Gáfriková, J., Zvarík, M., Hanajík, P., Súľovský, M., Vykouková, I., 2020: Impact of natural disturbance, forest management and vegetation cover on topsoil biochemical characteristics of Tatra Mts. (Slovakia). Journal of Mountain Science. Vol. 17: 6, 1294-1309.

Masarovičová E., Kráľová K., Vykouková I., Kriššáková Z. 2019: Responses of Medicinal Plants to Abiotic Stresses. In: M. Pessarakli (ed.). Handbook of Plant and Crop Stress. 4th Edition. CRC Press, Taylor & Francis Group, Boca Raton. ISBN 978-081-539-082-4. [7,28 AH], Pp. 713-753.

Gáfriková, J., Hanajík, P., Vykouková, I., Zvarík, M., Ferianc, P., Drahovská, H. & Puškárová, A. 2019, "Dystric Cambisol properties at windthrow sites with secondary succession developed after 12 years under different conditions in Tatra National Park", Biologia, vol. 74, no. 9, pp. 1099-1114. 

Masarovičová E., Májeková M., Vykouková I., 2016: Functional Traits and Plasticity of the Plants. In: M. Pessarakli (ed.). Handbook of Photosynthesis. 3th Edition. CRC Press, Taylor & Francis Group, Boca Raton. ISBN 978-1-4822-3073-4. [3,09 AH], Pp. 487-505.

Čierniková, M., Vykouková, I., Orfánus, T., Masarovičová, E., 2021: Functional traits of plant species suitable for revegetation of landfill waste from nickel smelter. Applied Sciences, 2021, 11(2), pp. 1–14, 658.

Kriššáková, Z., Čierniková, M., Vykouková, I., Hrabovský, A., Masarovičová, E., Beracko, P., 2023: Functional traits of medicinal plant species under different ecological conditions. Biologia 78, 2023, pp.925-935.

Gáfriková, J., Zvarík, M., Hanajík, P., Súľovský, M., Vykouková, I., 2020: Impact of natural disturbance, forest management and vegetation cover on topsoil biochemical characteristics of Tatra Mts. (Slovakia). Journal of Mountain Science 17: 6, 1294-1309.

Masarovičová E., Kráľová K., Vykouková I., Kriššáková Z. 2019: Responses of Medicinal Plants to Abiotic Stresses. In: M. Pessarakli (ed.). Handbook of Plant and Crop Stress. 4th Edition. CRC Press, Taylor & Francis Group, Boca Raton. ISBN 978-081-539-082-4. [7,28 AH], Pp. 713-753.

Gáfriková, J., Hanajík, P., Vykouková, I., Zvarík, M., Ferianc, P., Drahovská, H. & Puškárová, A. 2019, "Dystric Cambisol properties at windthrow sites with secondary succession developed after 12 years under different conditions in Tatra National Park", Biologia, vol. 74, no. 9, pp. 1099-1114. 

Kriššáková, Z., Čierniková, M., Vykouková, I., Hrabovský, A., Masarovičová, E., Beracko, P., 2023: Functional traits of medicinal plant species under different ecological conditions. Biologia 78, 2023, pp.925-935.

Čierniková, M., Vykouková, I., Orfánus, T., Masarovičová, E., 2021: Functional traits of plant species suitable for revegetation of landfill waste from nickel smelter. Applied Sciences, 2021, 11(2), pp. 1–14, 658.

Šimonovičová, A., Hanajík, P., Vykouková, I., 2011: Changes in soil properties in relation to the soil microbiota and plant community structure at the localities influenced by the windthrow in the Vysoké Tatry Mts. Stud. Tatra National Park, 10 (43), pp. 51-60. In: Renčo, M., Čerevková, A., Homolová, Z., Gömöryová, E., 2015: Long-term effects on soil nematode community structure in spruce forests of removing or not removing fallen trees after a windstorm. Forest Ecology and Management 356, 243-252.

Masarovičová, E., Májeková, M., Vykouková, I., 2015: Functional traits and plasticity of plants in ecological research and education. Chemistry-Didactics-Ecology-Metrology 20:1-2, 59-65. In: Rathee, S., Ahmad, M., Sharma, P., Singh, H.P., Batish, D.R., Kaur, S., Kaur, A., Yadav, S.S., Kohli, R.K., 2021: Biomass allocation and phenotypic plasticity are key elements of successful invasion of Parthenium hysterophorus at high elevation. Environmental and Experimental Botany 184, 104392.

Masarovičová, H., Májeková, M., Vykouková, I.,2015: Funkčné znaky a plasticita rastlín Univerzita Komenského, Bratislava, SVK. In: Paganová, V., Jureková, Z., Lichtnerová, H., 2019: The nature and way of root adaptation of juvenile woody plants Sorbus and Pyrus to drought. Environmental Monitoring and Assessment 191(12), 714.

Šimonovičová, A., Vykouková, I., Hanajík, P., 2010: Terestrická mikrobiocenóza a zmeny jej vlastností vo vzťahu k rastlinnému spoločenstvu po vetrovej kalamite v r. 2004 vo Vysokých Tatrách [Terrestrial microbiocoenosis and changes of its characteristics in relation to the plant community after the wind calamite in year 2004 in the High Tatra Mts]. Život v pôde, 11, pp. 157-163. In: Tirjaková, E., Vďačný, P., 2013: Recovery of ciliate communities from an oligotrophic mountain stream after a catastrophic wind damage. European Journal of Protistology 49:4, 526-537.

Šimonovičová, A., Hanajík, P., Vykouková, I., 2011: Changes in soil properties in relation to the soil microbiota and plant community structure at the localities influenced by the windthrow in the Vysoké Tatry Mts. Stud. Tatra National Park, 10 (43), pp. 51-60. In: Čerevková, A., Renčo, M., 2017: Impact of forest management practices after windstorm and wildfire in spruce forest on soil nematode communities. Forest Ecosystems: Management, Impact Assessment and Conservation,

pp. 45-64.

Projekt VEGA 2/0096/19 (2019-2022) Fytoindikácia zmien hydrologického režimu pôdy (riešiteľ)

Vlastnosti pôdy a procesy v nej prebiehajúce sú najdôležitejšími faktormi pre stav a štruktúru vegetácie na danom stanovišti. Z nich viaceré (napr. obsah a zloženie organickej hmoty, obsah solí, pohyb ílovitých častíc a pod.) reagujú na zmeny klímy, ktoré sa v súčasnosti na našom území prejavujú rastom teploty a zmenou distribúcie zrážok počas roka. Sledovanie týchto dlhodobých zmien nemôže byť predmetom jediného krátkodobého projektu. Na druhej strane je ale možné sa v relatívne krátkom časovom horizonte dopracovať k relevantným a spoľahlivým výsledkom zámenou širokého časového rámca za priestorový, ktorý má pri správnom výbere a dizajne výskumných lokalít analogický prejav. Zmeny v pôdnych režimoch sa odrážajú v ekofyziologických parametroch rastlín, ktoré vyjadrujú toleranciu rastlín voči meniacim sa podmienkam. Cieľom projektu je kvantifikácia týchto vzťahov smerom od jedinca k populácii vo vytýčených transektoch sledujúcich zmeny vlhkostných pomerov a hydrofyzikálnych charakteristík pôdy.

projekt VEGA 2/0147/21 (2021 - 2024): Vývoj pôdnych vlastností a vegetácie na bývalej poľnohospodárskej pôde (riešiteľ)

Projekt sa zameriava na zmeny pôdnych vlastností a vývoj vegetácie, ktoré nastali po opustení poľnohospodárskej pôdy od konca 19 stor. v dôsledku rôznych, najmä socio-ekonomických zmien. Na jej súčasné optimálne využívanie a manažment je takýto výskum zásadný o to viac, že zaberá rozsiahle plochy Slovenska. Vybraté modelové územia zahŕňajú rôzne prírodné podmienky a históriu využívania: 1) Podunajská nížina (bývalá orná pôda a vinohrady, karbonátové pôdy), 2) Borská nížina (bývalá orná pôda a vinohrady, piesočnaté silikátové pôdy), 3) Malé Karpaty (bývalá orná pôda a vinohrady, silikátové pôdy), 4) Považský Inovec (bývalá orná pôda a pasienky, karbonátové pôdy), 5) Liptov (bývalá orná pôda a pasienky, karbonátové a silikátové pôdy). Projekt má interdisciplinárny charakter a riešiteľský tím má medzirezortné zloženie. V pôdnej časti sa budú sledovať zmeny a vývoj základných ako aj niektorých špeciálnych pôdnych charakteristík, vegetačná časť je zameraná na rôzne aspekty procesov sekundárnej sukcesie.

Projekt VEGA 2/0118/18 (2018-2020) Zmeny pôdnych vlastností a sekundárna sukcesia po zalesnení bývalých poľnohospodárskych pôd (riešiteľ)

Projekt bol zameraný na ekológiu a pôdy sekundárnych lesných porastov, ktoré vznikli v dôsledku zmien využívania krajiny v rôznych regiónoch Slovenska, ktoré sa odlišujú prírodnými podmienkami a formou bývalého využívania. Modelové územia boli situované najmä v celkoch Malé Karpaty (zalesnené bývalé vinohrady a pasienky, nekarbonátové horniny) a Považský Inovec (zalesnené pasienky, karbonátové horniny). Projekt mal interdisciplinárny charakter. V rámci vegetačnej časti projektu bola vypracovaná podrobná fytocenologická a floristická charakteristika študovaných lesných porastov, ktorá bola údajovou bázou pre ďalšie aktivity, ako je stav, priebeh a smerovanie sekundárnej sukcesie, ekologické a socio-ekonomické hodnotenie danej vegetácie a pod.. V pôdnej časti sa boli sledované základné a niektoré špeciálne pôdne charakteristiky, ktoré o.i. poslúžili aj na zhodnotenie vplyvu historického a aktuálneho využívania krajiny na pôdu.

Projekt VEGA 2/0074/25 (2025-2028) Opustenie poľnohospodárskej pôdy s rôznym historickým využívaním vo vybraných regíónoch Slovenska a jeho dopady na vývoj pôdnych vlastností a vegetácie (riešiteľ)

Opúšťanie poľnohospodárskej pôdy predstavuje globálny dynamický a mnohorozmerný problém. V rámci štúdia tohto fenoménu sa projekt zameriava na 1) zmeny vybraných pôdnych vlastností a procesov, a 2) procesy sekundárnej regresívnej sukcesie (vývoj vegetácie) na opustenej poľnohospodárskej pôde. Na zachytenie rôznych prírodných podmienok a historického využívania sa pozornosť sústredí na vybraté modelové územia. V pôdnej časti sa budú sledovať zmeny a vývoj základných ako aj niektorých špeciálnych pôdnych charakteristík s dôrazom na hydropedologické vlastnosti, vegetačná časť je zameraná na procesy a mechanizmy sekundárnej sukcesie. Takéto plochy majú na Slovensku značnú výmeru, čo len potvrdzuje aktuálnosť a relevantnosť štúdia problematiky. Vzhľadom na charakter projektu má riešiteľský tím medzirezortné zloženie. Zahŕňa pracovníkov ÚKE SAV a katedry pedológie Prírodovedeckej fakulty UK.