Meno a priezvisko:
|
doc. RNDr. Tomáš Szemes, PhD.
|
Typ dokumentu:
|
Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
|
Názov vysokej školy:
|
Univerzita Komenského v Bratislave
|
Sídlo vysokej školy:
|
Šafárikovo námestie 6, 818 06 Bratislava
|
III.a - Zamestnanie-pracovné zaradenie | III.b - Inštitúcia | III.c - Časové vymedzenie |
---|---|---|
Vedecký pracovník | Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta | 2006-2021 |
Vedecký pracovník | Univerzita Komenského v Bratislave, Vedecký park | 2016-2021 |
Vedúci vedecký pracovník | Geneton s.r.o. | 2011-2021 |
docent | Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta | 2022 - doteraz |
Výskumný pracovník - výskumník | Univerzita Komenského v Bratislave, Vedecký park | 2022 - doteraz |
V.1.a - Názov profilového predmetu | V.1.b - Študijný program | V.1.c - Stupeň | V.1.d - Študijný odbor |
---|---|---|---|
Informatika pre biológov | Biológia a Medicínska biológia | I. | Biológia |
Vysokoparalelné sekvenovanie a analýza dát | Molekulárna biológia | II. | Biológia |
Pokročilé metódy molekulárnej biológie | Molekulárna biológia | II. | Biológia |
Bioinformatics | I. | Biológia | |
Problémové úlohy a výpočty v molekulárnej biológii | Molekulárna biológia | II. | Biológia |
V.5.a - Názov predmetu | V.5.b - Študijný program | V.5.c - Stupeň | V.5.d - Študijný odbor |
---|---|---|---|
Marketing a ekonomika biotechnologických spoločností | Molekulárna biológia | II. | Biológia |
Misova I, Pitelova A, Budis J, Gazdarica J, Sedlackova T, Jordakova A, Benko Z, Smondrkova M, Mayerova N, Pichlerova K, Strieskova L, Prevorovsky M, Gregan J, Cipak L, Szemes T, Polakova SB.
Repression of a large number of genes requires interplay between homologous recombination and HIRA.
Nucleic Acids Res. 2021 Feb 26;49(4):1914-1934.
Alm E, Broberg EK, Connor T, Hodcroft EB, Komissarov AB, Maurer-Stroh S, Melidou A, Neher RA, O'Toole Á, Pereyaslov D; WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group; WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group*.
Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020.
Euro Surveill. 2020 Aug;25(32):2001410.
Budis J, Gazdarica J, Radvanszky J, Szucs G, Kucharik M, Strieskova L, Gazdaricova I, Harsanyova M, Duris F, Minarik G, Sekelska M, Nagy B, Turna J, Szemes T.
Combining count- and length-based z-scores leads to improved predictions in non-invasive prenatal testing.
Bioinformatics. 2019 Apr 15;35(8):1284-1291.
Pös O., Radvanszky J., Buglyó G., Pös Z., Rusnakova D., Nagy B., Szemes T.
DNA copy number variation: Main characteristics, evolutionary significance, and pathological aspects
(2021) Biomedical Journal, 44 (5), pp. 548 - 559.
Pös O., Biró O., Szemes T., Nagy B.
Circulating cell-free nucleic acids: Characteristics and applications
(2018) European Journal of Human Genetics, 26 (7), pp. 937 - 945
Misova I, Pitelova A, Budis J, Gazdarica J, Sedlackova T, Jordakova A, Benko Z, Smondrkova M, Mayerova N, Pichlerova K, Strieskova L, Prevorovsky M, Gregan J, Cipak L, Szemes T, Polakova SB.
Repression of a large number of genes requires interplay between homologous recombination and HIRA. Nucleic Acids Res.
2021 Feb 26;49(4):1914-1934. doi: 10.1093/nar/gkab027.
Sládeček T., Gažiová M., Kucharík M., Zaťková A., Pös Z., Pös O., Krampl W., Tomková E., Hýblová M., Minárik G., Radvánszky J., Budiš J., Szemes T.
Combination of expert guidelines-based and machine learning-based approaches leads to superior accuracy of automated prediction of clinical effect of copy number variations
(2023) npj Scientific Reports, 13 (1), art. no. 10531
Styk J., Pös Z., Pös O., Radvanszky J., Turnova E.H., Buglyó G., Klimova D., Budis J., Repiska V., Nagy B., Szemes T.
Microsatellite instability assessment is instrumental for Predictive, Preventive and Personalised Medicine: status quo and outlook
(2023) EPMA Journal, 14 (1), pp. 143 - 165.
Pös O., Radvanszky J., Buglyó G., Pös Z., Rusnakova D., Nagy B., Szemes T.
DNA copy number variation: Main characteristics, evolutionary significance, and pathological aspects
(2021) Biomedical Journal, 44 (5), pp. 548 - 559.
Horti-Oravecz K., Bozsik A., Pócza T., Vereczkey I., Strausz T., Tóth E., Sedlackova T., Rusnakova D., Szemes T., Likó I., Oláh E., Butz H., Patócs A., Papp J., Grolmusz V.K.
Whole genome sequencing completes the molecular genetic testing workflow of patients with Lynch syndrome
(2025) npj Genomic Medicine, 10 (1), art. no. 5
Adrees, M., Ali, S., Rizwan, M., Zia-ur-Rehman, M., Ibrahim, M., Abbas, F., Farid, M., Qayyum, M.F., Irshad, M.K. Mechanisms of silicon-mediated alleviation of heavy metal toxicity in plants: A review (2015) Ecotoxicology and Environmental Safety, 119, pp. 186-197. Cited 715 times.
Mouliere, F., Chandrananda, D., Piskorz, A.M., Moore, E.K., Morris, J., Ahlborn, L.B., Mair, R., Goranova, T., Marass, F., Heider, K., Wan, J.C.M., Supernat, A., Hudecova, I., Gounaris, I., Ros, S., Jimenez-Linan, M., Garcia-Corbacho, J., Patel, K., Østrup, O., Murphy, S., Eldridge, M.D., Gale, D., Stewart, G.D., Burge, J., Cooper, W.N., Van Der Heijden, M.S., Massie, C.E., Watts, C., Corrie, P., Pacey, S., Brindle, K.M., Baird, R.D., Mau-Sørensen, M., Parkinson, C.A., Smith, C.G., Brenton, J.D., Rosenfeld, N. Enhanced detection of circulating tumor DNA by fragment size analysis (2018) Science Translational Medicine, 10 (466), . Cited 682 times.
Søreide, K., Sandvik, O.M., Søreide, J.A., Giljaca, V., Jureckova, A., Bulusu, V.R. Global epidemiology of gastrointestinal stromal tumours (GIST): A systematic review of population-based cohort studies (2016) Cancer Epidemiology, 40, pp. 39-46. Cited 541 times.
Singh, S., Singh, S.K., Chowdhury, I., Singh, R. Understanding the mechanism of bacterial biofilms resistance to antimicrobial agents (2017) Open Microbiology Journal, 11, pp. 53-62. Cited 520 times.
Montalbán-López M., Scott T.A., Ramesh S., Rahman I.R., Van Heel A.J., Viel J.H., Bandarian V., Dittmann E., Genilloud O., Goto Y., Grande Burgos M.J., Hill C., Kim S., Koehnke J., Latham J.A., Link A.J., Martínez B., Nair S.K., Nicolet Y., Rebuffat S., Sahl H.-G., Sareen D., Schmidt E.W., Schmitt L., Severinov K., Süssmuth R.D., Truman A.W., Wang H., Weng J.-K., Van Wezel G.P., Zhang Q., Zhong J., Piel J., Mitchell D.A., Kuipers O.P., Van Der Donk W.A.
New developments in RiPP discovery, enzymology and engineering
(2021) Natural Product Reports, 38 (1), pp. 130 - 239, Cited 441 times.
Horizon Europe/FORGENOM II - Fostering Excellence in Advanced Genomics and Proteomics Research at Comenius University in Bratislava (HORIZON-WIDERA-2023-ACCESS-02-01 - Twinning Bottom-Up) - since 2024 - Principal Investigator of coordinator
H2020/PANGAIA - Pan-genome Graph Algorithms and Data Integration (MSCA-RISE-2019 - Research and Innovation Staff Exchange) - since 2020 - Principal Investigator of coordinator
OPVaI-VA/DP/2018 - Dlhodobý strategický výskum a vývoj zameraný na výskyt Lynchovho syndrómu v populácii SR a možnosti prevencie nádorov spojených s týmto syndrómom - 2020-2023 - Principal Investigator of coordinator
APVV-VV-21-0296/INCAM - Identifikácia nových biomarkerov spojených s relapsom metastatického kolorektálneho karcinómu po metastasektómii - since 2021 - Principal Investigator of coordinator
APVV-PP-COVID-20-0051/NecroCov - Analýza príčin úmrtia pacientov a optimalizácia diferenciálnej diagnostiky v súvislosti s infekciou SARS-CoV-2 v Slovenskej republike - since 2020 - Principal Investigator of coordinator