|
Meno a priezvisko:
|
doc. RNDr. Stanislav Stuchlík, CSc.
|
|
Typ dokumentu:
|
Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
|
|
Názov vysokej školy:
|
Univerzita Komenského v Bratislave
|
|
Sídlo vysokej školy:
|
Šafárikovo námestie 6, 818 06 Bratislava
|
| III.a - Zamestnanie-pracovné zaradenie | III.b - Inštitúcia | III.c - Časové vymedzenie |
|---|---|---|
| vedecký pracovník | Katedra biochémie, PríFUK v Bratislave | 1987 - 1992 |
| vedecký pracovník | Katedra mol. biológie, PríFUK v Bratislave | 1992 - 1995 |
| odborný asistent | Katedra mol. biológie, PríFUK v Bratislave | 1995 - 2008 |
| docent | Katedra mol. biológie, PríFUK v Bratislave | 2008 - |
| vedúci katedry | Katedra mol. biológie, PriFUK v Bratislave | 2019 - doteraz |
| IV.a - Popis aktivity, názov kurzu (ak išlo o kurz), iné | IV.b - Názov inštitúcie | IV.c - Rok |
|---|---|---|
| WIPO Workshop "Ochrana duševného vlastníctva vo vyššom vzdelávaní", Bukurešť, Rumunsko | WIPO Ženeva | 2007 |
| V.1.a - Názov profilového predmetu | V.1.b - Študijný program | V.1.c - Stupeň | V.1.d - Študijný odbor |
|---|---|---|---|
| Metódy molekulárnej biológie | Biológia a Medicínska biológia | I. | Biológia |
| Regulácia génovej expresie v prokaryotoch | Biológia a Medicínska biológia | I. | Biológia |
| Ochrana duševného vlastníctva v biotech | Molekulárna biológia a Biotechnológie | II. | Biotechnológie |
| Molekulárna Imunológia | Molekulárna biológia a Biotechnológie | II. | Biológia |
| Vybrané kapitoly z molekulárnej biológie | Molekulárna biológia a Biotechnológie | II. | Biológia |
| V.2.a - Názov študijného programu | V.2.b - Stupeň | V.2.c - Študijný odbor |
|---|---|---|
| Molekulárna biológia | II. | Biológia |
| Molekulárna biológia | III. | Biológia |
| Biotechnológie | II. | Biotechnológie |
| Biotechnológie | III. | Biotechnológie |
| V.3.a - Názov odboru habilitačného konania a inauguračného konania | V.3.b - Študijný odbor, ku ktorému je priradený |
|---|---|
| Molekulárna biológia | Biológia |
| V.5.a - Názov predmetu | V.5.b - Študijný program | V.5.c - Stupeň | V.5.d - Študijný odbor |
|---|---|---|---|
| Seminár z mol biol 1, Seminár z mol biol 2 | Biológia a Medicínska biológia | I. | Biológia |
| Problémové úlohy a výpočty v molekulárnej biológii | Biológia a Medicínska biológia | I. | Biológia |
| Špeciálne metódy analýzy DNA | Biológia a Medicínska biológia | I. | Biológia |
| Legislatíva a biologická bezpečnosť biotechnológií | Molekulárna biológia a Biotechnológie | II. | Biológia |
| Pokroky molekulárnej biológie1 | Molekulárna biológia a Biotechnológie | II. | Biológia |
Vávrová, S., Struhárňanská, E., Turňa, J., Stuchlík, S. The tellurium, a rare element with influence on prokaryotic and eukaryotic biological systems. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 5924. - Q1
Varga, V., Štefuca, V., Mihálová, L., Levarski, Z., Struhárňanská, E., Blaško, J., Kubinec, R., Farkaš, P., Sitkey, V., Turňa, J., Rosenberg, M., Stuchlík, S. Recombinant enzymatic redox systems for preparation of aroma compounds by biotransformation. Frontiers in Microbiology 12: 684640, 2021 - Q1
Kormanová; Ľ., Rybecká; S., Levarski; L., Struhárňanská; E., Levarská; L., Blaško; J., Turňa; J., Stuchlík, S. Comparison of simple expression procedures in novel expression host Vibrio natriegens and established Escherichia coli system. Journal of Biotechnology 321: 57-67, 2020 - Q1
Stuchlík, S., Turna, J. Current status of biotechnology in Slovakia. Current Opinion in Biotechnology 24 S1, S14-18, 2013 - Q1
Burian, J., Stuchlík, S., Kay, W.W: Replication Control of a Small Cryptic Plasmid of Escherichia coli. J. Mol. Biol. 294, 49-66, 1999, IF1999 = 5,5
Vávrová, S., Struhárňanská, E., Turňa, J., Stuchlík, S. The tellurium, a rare element with influence on prokaryotic and eukaryotic biological systems. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 5924. - Q1
Varga, V., Štefuca, V., Mihálová, L., Levarski, Z., Struhárňanská, E., Blaško, J., Kubinec, R., Farkaš, P., Sitkey, V., Turňa, J., Rosenberg, M., Stuchlík, S. Recombinant enzymatic redox systems for preparation of aroma compounds by biotransformation. Frontiers in Microbiology 12: 684640, 2021 - Q1
Minich, A., Lišková, V., Kormanová, Ľ., Krahulec, J., Šarkanová, J., Mikulášová, M., Levarski, Z., Stuchlík, S. Role of RNAIII in resistance to antibiotics and antimicrobial agents in Staphylococcus epidermidis biofilms. Int. J. Mol. Sci. 23: art No. 11094, 2022 - Q1
Minich A., Levarski Z., Mikulášová M., Straka, M., Liptáková, A.,, Stuchlík, S. Complex analysis of vanillin and syringic acid as natural antimicrobial agents against Staphylococcus epidermidis biofilms. Int. J. Mol. Sci. 23, art. No. 1816, 2022. - Q1
Kormanová, Ľ., Levarski, Z., Minich, A., Varga, V., Levarská, L., Struhárňanská, E., Turňa, J., Stuchlík, S. Novel efficient recombinant expression system based on enhanced permeability of Vibrio natriegens induced by D,D-carboxypeptidase overexpression. World Journal of Microbiology and Biotechnology 39, Art. No. 277, 2023 - Q2
Burian, J., Stuchlík, S., Kay, W.W: Replication Control of a Small Cryptic Plasmid of Escherichia coli. J. Mol. Biol. 294, 49-66, 1999
2000 Solar, G., Espinosa, M. Plasmid copy number control: an ever-growing story. Molecular Microbiology 37: (3) 492-500,2000
2006 Srivastava P et al. Characterization of broad host range cryptic plasmid pCR1 from Corynebacterium renale. Plasmid 56(1): 24-34,2006
2011 Fratamico, P.M. etal. The complete DNA sequence and analysis of the virulence plasmid and of five additional plasmids carried by Shiga toxin-producing Escherichia coli O26:H11 strain H30. International Journal of Medical Microbiology 301 (3),192-203,2011 01
2012 Ma, YF. et al. Analysis of two marine metagenomes reveals the diversity of plasmids in oceanic environments. Environmental Microbiology 14 (2), 453-466,2012
2019 Branger, C. et al. Specialization of small non-conjugative plasmids in Escherichia coli according to their family types. Microbial Genomics 5 (9), Article Number: 000281, 2019
2023 Dewan, I., Uecker, H. A mathematician’s guide to plasmids: an introduction to plasmid biology for modellers. Microbiology (United Kingdom) 169(7), Art. No. 001362, 2023
Gajdošová, J., Benedikovičová, K., Kamodyová, N., Tóthová, Ľ., Kaclíková, E., Stuchlík, S., Turňa, J., Drahovská, H. Analysis of the DNA region mediating increased thermotolerance at 58°C in Cronobacter sp. and other enterobacterial strains. Antonie van Leeuwenhoek, International Journal of General and Molecular Microbiology 100, 279-289,2011
2012 Joseph, S. et al. Comparative Analysis of Genome Sequences Covering the Seven Cronobacter Species. PLoS ONE 7(11): Art. No. e49455, 2012
2013 Grim, C.J. et al. Pan-genome analysis of the emerging foodborne pathogen Cronobacter spp. suggests a species-level bidirectional divergence driven by niche adaptation. BMC Genomics 14, Art. No. 366,2013
2015 The H.C. et al. A high-resolution genomic analysis of multidrug resistant hospital outbreaks of Klebsiella pneumoniae. EMBO Molecular Medicine 7: 227-239,2015
2020 Li, H. et al. Heat and Pressure Resistance in Escherichia coli Relates to Protein Folding and Aggregation. Frontiers in Microbiology 11, Art. No 111,2020
2021 Almblad, H. et al. Bacterial cyclic diguanylate signaling networks sense temperature. Nature Communications 12, Art. No. 1986, 2021
2024 Liu, H., et al Diverse Genotypes of Cronobacter spp. Associated with Dairy Farm Systems in Jiangsu and Shandong Provinces in China. Foods 13(6):871, 2024
2024 Soni, A., Brightwell, G. Genetic determinants of thermal resistance in foodborne bacterial pathogens. Food Safety and Health 2: 213–220, 2024
Levarski Z., Šoltýsová A., Krahulec, J., Stuchlík, S., Turňa, J. High-level expression and purification of recombinant human growth hormone produced in soluble form in Escherichia coli. Protein Expression and Purification 100, 40-47, 2014
2018 Dai, Z. et al. Genetic tool development and systemic regulation in biosynthetic technology. Biotechnology for Biofuels 11: 152,2018
2018 Jang S.H. et al. Development of bicistronic expression system for the enhanced and reliable production of recombinant proteins in Leuconostoc citreum. Scientific Reports 8 (1), Art. No. 8852,2018
2020 Perez‐Perez, D.A. et al. Engineered small metal‐binding protein tag improves the production of recombinant human growth hormone in the periplasm of Escherichia coli. FEBS Open Bio 10: 546–551,2020
2021 Amaranto, M. et al. Novel intein-based self-cleaving affinity tag for recombinant protein production in Escherichia coli., Journal of Biotechnology 332: 126-134,2021
2021 Keshavarz, R. et al. Over-expression, Overproduction, Purification and characterization of rhGH in E. coli. Biotechnology and Applied Biochemistry 68: 122–135, 2021
2023 Wang, Y. et al. Growth hormone receptor agonists and antagonists: From protein expression and purification to long‐acting formulations. Protein Science 32(9): e4727, 2023
2024 Nasr, S.M. et al. Interdisciplinary gene manipulation, molecular cloning, and recombinant expression of modified human growth hormone isoform-1 in E. coli system. International Journal of Biological Macromolecules 257, 128637, 2024
Madyagol, M., Al-Alami, H., Levarski, Z., Drahovská, H., Turňa, J., Stuchlík, S. Gene replacement techniques for Escherichia coli genome modification. Folia Microbiologica 56, 253-263, 2011
2015 Liu W. et al. Generation of an attenuated strain oral vaccine candidate using. Appl Microbiol Biotechnol 99: 855–867, 2015,
2016 Liu, L. et al. L-tryptophan production in Escherichia coli improved by weakening the Pta-AckA pathway. PLoS ONE 11 (6), Art.No. e0158200, 2016
2019 Chen, TP. et al. Efficient Biofilm-Based Fermentation Strategies for L-Threonine Production by Escherichia coli. Frontiers in Microbiology 10, Art. No.: 1773, 2019
2020 Xu, X. et al. Extension of Genetic Marker List Using Unnatural Amino Acid System: An Efficient Genomic Modification Strategy in Escherichia coli. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 8, Art. No 145, 2020
2021 Saleski, T.E. et al. Optimized gene expression from bacterial chromosome by high-throughput integration and screening. Science Advances 7 (7): Art. No.eabe1767, 2021
2022 Liu, QG. et al. Type I fimbriae subunit fimA enhances Escherichia coli biofilm formation but affects L-threonine carbon distribution. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 10, Art. No- 904636, 2022
2024 Kamali, F. et al. Chapter 5-Ammonia production from amino acid-based biomass-like sources by engineered Escherichia coli. In: Progresses in Ammonia: Science, Technology and Membranes (Ed.A. Basile and M.R. Rahimpou), pp. 113-142, 2024, Elsevier
Vávrová, S., Struhárňanská, E., Turňa, J., Stuchlík, S. The tellurium, a rare element with influence on prokaryotic and eukaryotic biological systems. Int. J. Mol. Sci. 22(11), 5924; 2021
2023 Liu, W. et al. Biosynthesis of uniform fluorescent-stable telluride quantum dots in Escherichia coli and its detection of Fe3+ in water. Biochemical and Biophysical Research Communications 667: 153-161, 2023
2023 O’Loughlin, E.J. et al. Tellurium Goes for a Ride on the “Ferrous” Wheel: Interactions of Te(VI) and Te(IV) with Fe(II)-Bearing Minerals. ACS Earth and Space Chemistry 7 (10): 1825-1836, 2023
2024 Sári, D., et al. Tellurium and Nano-Tellurium: Medicine or Poison? Nanomaterials 14(8):670, 2024
2024 Kińska, K. et al. Interaction of Te(IV) and Te(VI) with the soil matrix – Sorption and fractionation as a function of soil composition. Environmental Pollution 361,124878, 2024
2024 Tozawa, M. et al. Spectrally Narrow Blue-Light Emission from Nonstoichiometric AgGaS2 Quantum Dots for Application to Light-Emitting Diodes. ACS Applied Materials & Interfaces, 16(49): 68169-68180, 2024
APVV-14-0375 (2015 - 2019, (aplikovaný výskum) - Syntetická biológia a produkcia peroxidáz de novo - zástupca zodpovedného riešiteľa projektu
APVV-17-0333 (2018 - 2022, aplikovaný výskum) - Výskum a vývoj efektívnych procesov prípravy vanilínu a iných prírodných aróm s využitím oxidačného a protektívneho účinku rekombinantnej katalázy a peroxidázy - zodpovedný riešiteľ projektu
APVV-21-0215 (2022-2026 - aplikovaný výskum) - Bakteriálna Lon proteáza ako perspektívny nástroj na liečbu mnohopočetného myelómu - zodpovedný riešiteľ projektu
APVV-19-0196 (2020 - 2024) - Neuroendokrinná regulácia energetického metabolizmu v modeli Drosophila melanogaster - zástupca zodpovedného riešiteľa projektu
APVV-22-0161 (2023-2027 - aplikovaný výskum) - Využitie biotechnologickych transformácií pri výrobe zdraviu prospešných nápojov zástupca zodpovedného riešiteľa projektu
European Space Agency (Noordwijk, NL) GRANT_NUMBER: Sixth Call for Outline Proposals under the Plan for European Cooperating States (PECS) in Slovakia/ESA, The European Space Research and Technology Centre (ESTEC) (2022-2024) - Mapovanie lipidómu Arthrospira PCC8005 - zástupca zodpovedného riešiteľa projektu
Horizon Europe program under grant agreement No. 101160008 - Forgenome II projekt (2024 - 2027) - člen riešiteľského kolektívu
| VII.a - Aktivita, funkcia | VII.b - Názov inštitúcie, grémia | VII.c - Časové vymedzenia pôsobenia |
|---|---|---|
| Člen zboru expertov | Komisia pre biologickú bezpečnosť MŽP SR | od 01/2020 |
| Člen ENGL working group on „Detection of genetically modified microorganisms in food and feed" | European Commission, Directorate-general, Joint Research Centre, Brussels | 11/2020 - |
| vedecký tajomník, člen výboru | Slovenská spoločnoť pre biochémiu a molekulárnu biológiu v rámci FEBS spoločnosti | od 02/2019 |
| Člen edičnej rady | Časopis Amino Acids (IF=3,5) | od 05/2017 |
| Editor špeciálneho vydania | Časopis Biomolecules (IF=4,5) | od 04/2021 |
| VIII.a - Názov inštitúcie | VIII.b - Sídlo inštitúcie | VIII.c - Obdobie trvania pôsobenia/pobytu (uviesť dátum odkedy dokedy trval pobyt) | VIII.d - Mobilitná schéma, pracovný kontrakt, iné (popísať) |
|---|---|---|---|
| Dept. Mol. Genetics, Leiden University, The Netherlands | Leiden, The Netherlands | 06/1994-07/1994 | TEMPUS program - krátkodobý pobyt |
| Dept. Bioch. and Microbiol., University of Victoria, B.C., Canada | Victoria, B.C., Canada | 1995-1997 | NSERC Ottawa - NATO Science Postdoctoral Fellowship Award |
| Dept. Mol. Genetics, Leiden University, The Netherlands | Leiden, The Netherlands | 2000-2002 | Postdoctoral fellowship, EC project: Structural studies on the mechanism of DNA excision repair |
Prodekan pre rozvoj a IT - PriFUK - 04/2009 –01/2011
Externý expert-delegát MŽP SR na podujatí COP MOP 8 - 8. Zasadnutie Konferencie zmluvných strán Dohovoru o biologickej bezpečnosti OSN -Kartagenský protokol, 2.12..-19.12.2016, Cancún, Mexico
Ďakovný list dekana PriFUK pri príležitosti 75. výročia vzniku fakulty v r. 2015 za výsledky výskumu - člen oceneného kolektívu Katedry molekulárnej biológie
Spolupráca WIPO Geneva: „WIPO Initiative University IPR coordinator“ na PriFUK (2003-2010)
Člen Komisie pre koordináciu aktivít SR vo výskumných infraštruktúrach ESFRI v oblasti zdravia, potravín a životného prostredia pri MŠVVaŠ SR - od 17.12.2018 - doteraz
Člen zboru expertov v Komisii pre biologickú bezpečnosť MŽP SR – od 15.1.2020 - doteraz
Spolupráca s praxou:
1. CPN Dolní Dobrouč, ČR/Czech Rep.: 2007-2011 zmluvný výskum – spolupráca pri produkcii kyseliny hyalurónovej, produkcii antimikrobiálnych peptidov; školenie PhD. študenta v ext. forme)
2. Axxence Slovakia/Monoprix, s.r.o.: dlhodobá spolupráca (od r. 2007 - doteraz) na výskume biotranformácie aromatických aditív pomocou rekombinantných enzýmov v rámci APVV projektov
3. hameln rds, Modra (bývalý VUL Modra): v r. 1992-1994 zmluvný výskum, v r. 2010-2014 spoločný ERDF projekt „Priemyselný výskum nových liečiv na báze rekombinantných proteínov“
4. Medirex, a.s., Bratislava: spolupráca pri organizovaní ceny Medirex Group Academy o najlepšiu diplomovú prácu z oblasti z molekulárnej biológie a imunológie s klinickým využitím a školenie študentov v rámci bakalárskych a diplomových prác v Medirexe v r. 2016-2022
1 udelený patent, 4 patentové prihlášky - Úrad priem. vlastníctva SR:
1. udelený SK patent, 289111 (UPV SR, 2023) - Stuchlík, S., Levarski, Z., Struhárňanská, E., Zámocký M, Turňa. J. Polypeptid rekombinantnej katalázy-peroxidázy, spôsob jej produkcie v bunkách Escherichia coli a jej použitie.. PP50015-2019, 15.3.2019, ÚPV SR
Patentové prihlášky:
1. Bocánová L., Krahulec, J., Stuchlík, S., Turňa, J. Spôsob prípravy hostiteľského kmeňa Escherichia coli s dvojitou reguláciou expresie rekombinantných proteínov. PP 5039-2013, 17.12.2013, ÚPV SR
2. Krahulec, J., Levarski, Z. Stuchlík, S., Turňa, J. Spôsob produkcie rozpustného ľudského rekombinantného rastového hormónu. PP5038-2014, 17.12.2013, ÚPV SR
3. Stuchlík, S., Levarski, Z., Koiš, P., Fraňo, M., Turňa. J. Spôsob biotransformácie trans-2-hexenálu na trans-2-hexenol pomocou rekombinantných enzýmov. PP50068-2016. 13.10.2016, ÚPV SR
4. Stuchlík, S. Levarski, Z. Kormanová, Ľ., Turňa, J. Spôsob navýšenia permeability vonkajších bunkových štruktúr u Vibria natriegens z pohľadu extracelulárneho transportu rekombinantných proteínov PP 50063-2021, 06.12.2021, ÚPV SR