|
Meno a priezvisko:
|
doc. Mgr. Michal Pitoňák, PhD.
|
|
Typ dokumentu:
|
Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
|
|
Názov vysokej školy:
|
Univerzita Komenského v Bratislave
|
|
Sídlo vysokej školy:
|
Šafárikovo námestie 6, 818 06 Bratislava
|
| III.a - Zamestnanie-pracovné zaradenie | III.b - Inštitúcia | III.c - Časové vymedzenie |
|---|---|---|
| Odborný asistent / výskumný pracovník | Prírodovedecká fakulta UK v Bratislave | 2006 |
| Postdoktorand | Ústav organické chemie a biochemie, AVČR | 2007-2010 |
| výskumný pracovník | Prírodovedecká fakulta UK v Bratislave | 2008-2015 |
| docent | Prírodovedecká fakulta UK v Bratislave | 2015- |
| V.1.a - Názov profilového predmetu | V.1.b - Študijný program | V.1.c - Stupeň | V.1.d - Študijný odbor |
|---|---|---|---|
| Chemické modelovanie | Chémia, konverzný | I. | chémia |
| Pokročilá numerická matematika a programovanie | Teoretická a počítačová chémia, Fyzikálna chémia | II. | chémia |
| Vybrané kapitoly z teoretickej a počítačovej chémie (1) | Teoretické a počítačová chémia | II. | chémia |
| Moderné počítačové metódy kvantovej chémie | Teoretická a počítačová chémia | III. | chémia |
| Teoretická chémia | Teoretická a počítačová chémia | III. | chémia |
| V.2.a - Názov študijného programu | V.2.b - Stupeň | V.2.c - Študijný odbor |
|---|---|---|
| Teoretická a počítačová chémia | II. | chémia |
| Teoretická a počítačová chémia | III. | chémia |
| V.5.a - Názov predmetu | V.5.b - Študijný program | V.5.c - Stupeň | V.5.d - Študijný odbor |
|---|---|---|---|
| Bakalárska práca z teoretickej a počitačovej chémie (1) | Chémia, Chémia konverzný, Biochémia, Biochémia konverzný | I. | chémia |
| Bakalárska práca z teoretickej a počitačovej chémie (2) | Chémia, Chémia konverzný, Biochémia, Biochémia konverzný | I. | chémia |
| Cvičenie k bakalárskej práci z teoretickej a počítačovej chémie | Chémia, Chémia konverzný, Biochémia, Biochémia konverzný | I. | chémia |
| Chemické modelovanie | Chémia, Chémia konverzný, Biochémia, Biochémia konverzný | I. | chémia |
| Čo je fyzikálna a teoretická chémia? | Chémia | I. | chémia |
| Úvod do matematického spracovania chemických dát | Chémia, Chémia konverzný | I. | chémia |
| Výberová prax z chémie | Chémia, Chémia konverzný, Biochémia, Biochémia konverzný | I. | chémia |
| Základy programovania v chémii | Fyzikálna chémia, Teoretická a počítačová chémia | II. | chémia |
| Pokročilá numerická matematika a programovanie | Fyzikálna chémia, Teoretická a počítačová chémia | II. | chémia |
| Vybrané kapitoly z fyzikálnej chémie | Učiteľstvo chémia v kombinácii | II. | chémia |
| Vybrané kapitoly z teoretickej a počítačovej chémie (1) | Fyzikálna chémia, Teoretická a počítačová chémia | II. | chémia |
| Chemická reaktivita | Fyzikálna chémia | III. | chémia |
| Doktorandský seminár z teoretickej chémie (1) | Teoretická a počítačová chémia | III. | chémia |
| Doktorandský seminár z teoretickej chémie (2) | Teoretická a počítačová chémia | III. | chémia |
| Doktorandský seminár z teoretickej chémie (3) | Teoretická a počítačová chémia | III. | chémia |
Stabilization and Structure Calculations for Noncovalent Interactions in Extended Molecular Systems Based on Wave Function and Density Functional Theories; Riley, KE; Pitonak, M; Jurecka, P; Hobza, P; Chem. Rev. 110 (9) 5023-5063, 2010; DOI: 10.1021/cr1000173
Scaled MP3 Non-Covalent Interaction Energies Agree Closely with Accurate CCSD(T) Benchmark Data; Pitonak, M; Neogrady, P; Cerny, J; Grimme, S; Hobza, P; ChemPhysChem 10 (1) 282-289, 2009 ; DOI: 10.1002/cphc.200800718
Accuracy of Quantum Chemical Methods for Large Noncovalent Complexes; Sedlak, R; Janowski, T; Pitonak, M; Rezac, J; Pulay, P; Hobza, P; J. Chem. Theory Comput. 9 (8) 3364-3374, 2013; DOI: 10.1021/ct400036b
A Transferable H-Bonding Correction for Semiempirical Quantum-Chemical Methods; Korth, M; Pitonak, M; Rezac, J;Hobza; P, J. Chem. Theory Comput. 6 (1) 344-352, 2010; DOI: 10.1021/ct900541n
On the Structure and Geometry of Biomolecular Binding Motifs (Hydrogen-Bonding, Stacking, X-H center dot center dot center dot pi): WFT and DFT Calculations; Riley, KE; Pitonak, M; Cerny, J; Hobza, P; J. Chem. Theory Comput. 6 (1), 66-80, 2010; DOI:10.1021/ct900376r.
Machine learning prediction of 3CLpro SARS-CoV-2 docking scores; Bucinsky, L; Bortnak, D; Gall, M; Matuska, J; Milata, V; Pitonak, M; Steklac, Marek); Vegh, D; Zajacek, D; Comp. Bio. and Chem. 98 107656, 2022; DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2022.107656
Molecular docking and machine learning affinity prediction of compounds identified upon softwood bark extraction to the main protease of the SARS-CoV-2 virus; Jablonsky, M; Steklac, M; Majova, V; Gall, M; Matuska, J; Pitonak, M; Bucinsky, L; Biophys. Chem. 288 106854 2022; DOI: 10.1016/j.bpc.2022.106854
DFT Modeling of Polyethylene Chains Cross-linked by Selected ns1 and ns2 Metal Atoms; Vrška, D; Urban, M; Neogrády, P; Pittner, J; Blaško, M; Pitoňák, M; J. Phys. Chem. A 128 (36) 7634-7647, 2024; DOI: 10.1021/acs.jpca.4c04755
Advances and critical assessment of machine learning techniques for prediction of docking scores; Bucinsky, L; Gall, M.; Matúška J.; Pitoňák, M; Štekláč, M.; Int. J. Quantum Chem. 123 (24) e27110, 2023; DOI: 10.1002/qua.27110
Thermodynamics of the gas-phase dimerization of formic acid: Fully anharmonic finite temperature calculations at the CCSD(T) and many DFT levels; Vrška, D.; Pitoňák, M.; Bučko, T.; J. Chem. Phys. 160 (17) 174106, 2024; DOI: 10.1063/5.0205448
Chem. Rev. 110 (9) 5023-5063, 2010; DOI: 10.1021/cr1000173 => Accurate and Efficient Method for Many-Body van der Waals Interactions; Tkatchenko, A; DiStasio, RA; Car, R; Scheffler, M, Phys. Rev. Lett. 108 (23) 236402, 2012; DOI: 10.1103/PhysRevLett.108.236402 (citations: 1421)
Chem. Rev. 110 (9) 5023-5063, 2010; DOI: 10.1021/cr1000173 => Perspective: Advances and challenges in treating van der Waals dispersion forces in density functional theory; Klimes, J; Michaelides, A, J. Chem. Phys 137 (12) 120901, 2012; DOI 10.1063/1.4754130 (citations: 704)
J. Chem. Theory Comput. 6 (1) 344-352; DOI: 10.1021/ct900541n => Optimization of parameters for semiempirical methods VI: more modifications to the NDDO approximations and re-optimization of parameters; Stewart, JJP, J. Mol. Mod. 19 (1) 1-32, 2013; DOI: 10.1007/s00894-012-1667-x (citations: 849)
J. Chem. Theory Comput. 6 (1) 344-352; DOI: 10.1021/ct900541n => Dispersion-Corrected Mean-Field Electronic Structure Methods; Grimme, S; Hansen, A; Brandenburg, JG; Bannwarth, C, Chem. Rev. 116 (9) 5105-5154, 2016; DOI: 10.1021/acs.chemrev.5b00533 (citations: 604)
ChemPhysChem 10 (1) 282-289, 2009 ; DOI: 10.1002/cphc.200800718 => Efficient and Accurate Double-Hybrid-Meta-GGA Density Functionals-Evaluation with the Extended GMTKN30 Database for General Main Group Thermochemistry, Kinetics, and Noncovalent Interactions; Goerigk, L; Grimme, S, J. Chem. Theory Comput. 7 (2) 291-309, 2011; DOI: 10.1021/ct100466k (citations: 678)
Investigator: VEGA 1/0254/24 "The role of configurational variability in the theoretical description of interactions of molecules and condensed systems"
Investigator: APVV-24-0242 "Machine Learning led platform for separation science method development"
Investigator: APVV-20-0127 "From ab initio calculations to predictions of temperature-dependent properties of molecules and materials"