Ondrejka, M. Uher, P., Pršek, J., Ozdín, D. 2007: Arsenian monazite-(Ce) and xenotime-(Y), REE arsenates and carbonates from the Tisovec-Rejkovo rhyolite, WesternCarpathians, Slovakia: Composition and substitutions in the (REE,Y)XO4 system (X = P, As, Si, Nb, S), Lithos. - Vol. 95, No. 1-2, 116-129.

Ondrejka, M., Uher, P., Putiš, M., Broska, I., Bačík, P., Konečný, P., Schmiedt, I., 2012: Two-stage breakdown of monazite by post-magmatic and metamorphic fluids: An example from the Veporic orthogneiss, Western Carpathians, Slovakia. Lithos 142-143, 245-255.

Uher P., Ondrejka M., Bačík P., Broska I., Konecny P. 2015: Britholite, monazite, REE carbonates, and calcite: Products of hydrothermal alteration of allanite and apatite in A-type granite from Stupné, Western Carpathians, Slovakia, Lithos, 236-237, 221-225.

Ondrejka M., Uher P., Ferenc Š., Milovská S., Mikuš T., Molnárová A., Škoda R., Kopáčik R., Bačík P. (2023) Gadolinium-dominant monazite and xenotime selective hydrothermal enrichment of middle REE during low-temperature alteration of uraninite, brannerite, and fluorapatite (the Zimná Voda REE-U-Au quartz vein, Western Carpathians, Slovakia). American Mineralogist, 108, 4, 754-768.

Ondrejka M., Uher P., Ferenc Š., Majzlan J., Pollok K., Mikuš T., Milovská S., Molnárová A., Škoda R., Kopáčik R., Kurylo S., Bačík P. (2023) Monazite-(Gd), a new Gd-dominant mineral of the monazite group from the Zimná Voda REE-U-Au quartz vein, Prakovce, Western Carpathians, Slovakia. Mineralogical Magazine, 87, 4, 568-574.

Ondrejka, M., Uher, P., Putiš, M., Kohút, M.,Broska, I., Larionov, A., Bojar, A-V., Sobocký, T. 2021: Permian A-type granites of the Western Carpathians and Transdanubian regions: Products of the Pangea supercontinent breakup. International Journal of Earth Sciences, 110, 2133-2155.

Ondrejka M., Molnárová A., Putiš M., Bačík P., Uher P., Voleková B., Milovská S., Mikuš T., Pukančík L. (2022) Hellandite-(Y)–hingganite-(Y)–fluorapatite retrograde coronae a novel type of fluid-induced dissolution–reprecipitation breakdown of xenotime-(Y) in the metagranites of Fabova Hoľa, Western Carpathians, Slovakia. Mineralogical Magazine, 86, 4, 586-605.

Ondrejka M., Uher P., Ferenc Š., Milovská S., Mikuš T., Molnárová A., Škoda R., Kopáčik R., Bačík P. (2023) Gadolinium-dominant monazite and xenotime selective hydrothermal enrichment of middle REE during low-temperature alteration of uraninite, brannerite, and fluorapatite (the Zimná Voda REE-U-Au quartz vein, Western Carpathians, Slovakia). American Mineralogist, 108, 4, 754-768.

Ondrejka M., Ferenc Š., Majzlan J., Števko M., Kopáčik R., Voleková B., Milovská S., Gottlicher J., Steininger R., Mikuš T., Uher P. Biroň A., Sejkora J., Molnárová A. (2023) Secondary uranyl arsenates–phosphates and Sb–Bi-rich minerals of the segnitite–philipsbornite series in the oxidation zone at the Prakovce-Zimná Voda REE–U–Au quartz-vein mineralisation, Western Carpathians, Slovakia. Mineralogical Magazine 87, 6, 849-865.

Ondrejka M., Bačík, P., Majzlan J., Uher, P., Ferenc, Š., Mikuš, T., Števko M., Čaplovičová, M., Milovská S., Molnárová, A., Rößler, Ch., Matthes, Ch. (2024): Xenotime-(Gd), a new Gd-dominant mineral of the xenotime group from the Zimná Voda REE–U–Au quartz vein, Prakovce, Western Carpathians, Slovakia. Mineralogical Magazine 88, 5, 613-622.

Ondrejka, M. Uher, P., Pršek, J., Ozdín, D. 2007: Arsenian monazite-(Ce) and xenotime-(Y), REE arsenates and carbonates from the Tisovec-Rejkovo rhyolite, WesternCarpathians, Slovakia: Composition and substitutions in the (REE,Y)XO4 system (X = P, As, Si, Nb, S), Lithos. - Vol. 95, No. 1-2, 116-129 in Vereshchangin et al. 2019: Gasparite-(La), La(AsO4), a new mineral from Mn ores of the Ushkatyn-III deposit, Central Kazakhstan, and metamorphic rocks of the Wanni glacier, Switzerland, American Mineralogist 104, 10, 1469-1480

Ondrejka, M. Uher, P., Pršek, J., Ozdín, D. 2007: Arsenian monazite-(Ce) and xenotime-(Y), REE arsenates and carbonates from the Tisovec-Rejkovo rhyolite, WesternCarpathians, Slovakia: Composition and substitutions in the (REE,Y)XO4 system (X = P, As, Si, Nb, S), Lithos. - Vol. 95, No. 1-2, 116-129 in Nikolenko et al. 2018: The origin of magnetite-apatite rocks of Mushgai-Khudag Complex, South Mongolia: mineral chemistry and studies of melt and fluid inclusions, Lithos, 320-321, 567-582

Ondrejka, M. Uher, P., Pršek, J., Ozdín, D. 2007: Arsenian monazite-(Ce) and xenotime-(Y), REE arsenates and carbonates from the Tisovec-Rejkovo rhyolite, WesternCarpathians, Slovakia: Composition and substitutions in the (REE,Y)XO4 system (X = P, As, Si, Nb, S), Lithos. - Vol. 95, No. 1-2, 116-129 in Hoshino et al. 2016: REE Mineralogy and Resources, Handbook on the Physics and Chemistry of Rare Earths, 49, pp. 129-291

Ondrejka M, Putiš M, Uher P, Schmiedt I, Pukančík L, Konečný P 2016: Fluid-driven destabilization of REE-bearing accessory minerals in the granitic orthogneisses of North Veporic basement (Western Carpathians, Slovakia). Mineralogy and Petrology, 110:561–580 in Engi 2017: Petrochronology Based on REE-Minerals: Monazite, Allanite, Xenotime, Apatite, Reviews in Mineralogy and Geochemistry, 83, 1, pp. 365-418

Uher P., Ondrejka M., Bacik P., Broska I., Konecny P. 2015: Britholite, monazite, REE carbonates, and calcite: Products of hydrothermal alteration of allanite and apatite in A-type granite from Stupné, Western Carpathians, Slovakia, Lithos, 236-237, 221-225 in Johannes Giebel et al. 2017: Multi-stage formation of REE minerals in the Palabora Carbonatite Complex, South Africa, American Mineralogist, 102, 6, 1218-1233

VEGA 1/0467/20 (2020-2022, vedúci projektu Doc. Martin Ondrejka) Remobilizácia a frakcionácia vzácnych litofilných prvkov v hydrotermálnych a supergénnych podmienkach. V súčasnosti sú litofilné prvky objektom štúdia geológov aj pedológov. Zistené fakty o geochemickej frakcionácii a remobilizácii týchto prvkov v nízko-T a supergénnych podmienkach sú významným úspechom. Získavanie poznatkov o ich správaní v týchto podmienkach je dôležité, keďže sú užitočnými geochemickými indikátormi geologických procesov. Minerály môžu byť nestabilné vo fluidnom režime a môžu vznikať rôzne rozpadové produkty. Interakcia horniny a fluida je dôležitým procesom zodpovedným za reaktiváciu/remobilizáciu litofilných prvkov v nízko-T/supergénnom štádiu. Tieto fluidá sú významným činiteľom supergenézy, aj počas zvetrávania a sú schopné objasniť metasomatizmus, ktorý by bol ťažko interpretovateľný. Tento projekt bude skúmať remobilizáciu/frakcionáciu litofilných prvkov v nízkoteplotných/supergénnych podmienkach kde prebiehajú dôležité geochemicko-biochemické procesy. Podrobný opis je nevyhnutným krokom k pochopeniu správania sa týchto prvkov v plytkých-podpovrchových podmienkach.

APVV-19-0065 (2020-2023, vedúci projektu Prof. Marián Putiš, spoluriešiteľ Doc. Martin Ondrejka) Petrologicko-geochronologický záznam riftogenézy a kôrovoplášťovej recyklácie v orogénnej prizme Západných Karpát.

Predmetom výskumu sú špecifické skupiny kôrových a plášťových hornín a ich minerálov ako indikátorov riftogénnych zón a to aj napriek tomu, že často majú znaky mladšieho tektono-termálneho prepracovania v dôsledku ich začlenenia do orogenetických zón. Používame mineralogicko-petrologické (EPMA, micro-Raman, LA-ICP-MS, XRF, ICP-MS), izotopovo-geochemické (LA-MC-ICP-MS, TIMS) a geochronologické (U-Pb SIMS, LA-ICP-MS, Ar-Ar, K-Ar) metódy na určenie chemizmu minerálov a hornín, vrátane vybraných rádiogénnych izotopov (U-Pb, Pb-Pb, Sm-Nd, Rb-Sr, Zr-Hf, Re-Os) na určenie ich veku a genézy.

2016YFE0203000 (2017-2020; vedúci projektu Prof. Dr. Qiu-Li Li; spoluriešiteľ za SR Doc. Martin Ondrejka) "Cooperative research of microbeam analytical techniques of rock and minerals". Strategická medzinárodná spolupráca v technologických inováciach Národného kľúčového výskumu a rozvojového plánu. Projekt čínskeho ministerstva pre vedu a technológiu, Inštitútu geológie a geofyziky Čínskej akadémie vied v Pekingu a Komenského univerzitou v Bratislave, Slovensko. Projekt sa zaoberá vývojom metodiky a izotopovým datovaním zirkónu a rutilu metódou U/Pb SIMS, nano-SIMS a LA-ICP-MS v Ústave geológie a geofyziky Čínskej akadémie vied v Pekingu a na univerzite vo Wuhane. Datoval sa protolit a metamorfný vek eklogitov z veporika Západných Karpát a austroalpinika Východných Álp. Aplikáciou nano-SIMS sa nám podarilo datovať aj zirkón veľmi malých rozmerov z permských metavulkanitov a metavulkanitov, ako aj veľmi jemnozrnnej (do 100 µm) detritickej frakcie zirkónu z aniskeho zatiaľ neznámeho magmatického zdroja zistenej v hlbokovodných oceánskych sedimentoch meliatika. Novovyvinutá metodika na datovanie rutilu sa aplikovala úspešne aj pri datovaní metamorfného rutilu z eklogitov Východných Álp, ako aj z metamorfitov veporika a meliatika Západných Karpát. Ide o prvé datovania rutilu v týchto regionóch, ktoré zároveň patria k prvým na svete.

APVV-15-0050 (2016-2019, vedúci projektu Prof. Marián Putiš, spoluriešiteľ Doc. Martin Ondrejka) Modely interakcie kôrových a plášťových hornín s fluidami v akrečných prizmách Západných Karpát, východných Álp a severného Turecka; korelácia P-T-X-t parametrov

Projekt sa zaoberal fluidno-alteračnými procesmi v horninách kôrovo-plášťovej prizmy v alpidnom orogéne Západných Karpát, východných Álp a severnej časti Turecka. Zamerali sme sa na viaceré typy fluidno-horninových interakčných (alteračných) zón, ktorých genéza bola predmetom výskumu: i) v subdukčno-akrečných komplexoch modrých bridlíc, eklogitov a ultramafitov, ii) v spodnokôrových ortorulách, granitoch, metabazitoch a metaultramafitoch, iii) v skarnoch, ako aj iv) v lamprofýroch. Podstatou týchto procesov je interakcia hornín s fluidami v rôznych hĺbkových úrovniach litosféry. Použili sme mikroskopické, elektrónovo-optické, rtg-difraktometrické a spektrometrické metódy na zistenie chemizmu minerálov a hornín alteračných zón. Určil sa model a vek interakcie ultramafitu s fluidom na perovskite ako produktu tejto interakcie.

APVV-22-0092 (2022-2026, hlavný riešiteľ Doc. Martin Ondrejka) Petrogenetické modely Paleozoických granitických hornín v Západných Karpatoch a ich korelácia.

Projekt je zameraný na geodynamické prostredie paleozoického granitového magmatizmu v Západných Karpatoch a koreláciu s analogickými plutonickými horninami Variskej Európy, ako aj na aktualizáciu súčasných petrogenetických modelov. Paleozoické granitické horniny Západných Karpát reprezentujú heterogénnu suitu, ktorá zahŕňa staropaleozoické pred-variské (kambro-ordovické), variské (karbónske) a post-variské (permské) magmatické litotypy. Najstaršia skupina, ktorá sa transformovala na variské ortoruly, vznikla na aktívnom okraji Gondwany. Relatívne staršie variské granitoidné plutóny (ca. 365-350 mil.r.) sa mohli formovať pri extenzii v magmatickom oblúku nad ranovariskou (spodnodevónskou) subdukčnou zónou. Počas post-kolíznej extenzie sa generovali mladše granity až tonality (ca. 350-340, menej 330 mil.r.). Obe skupiny sú konzistentné s dvomi anatektickými udalosťami (370-360 a 350-340 mil.r.). Malá časť granitov vznikala v post-kolíznom tektonickom režime a pri nasledovnom rozpade superkontinentu Pangea (A-typy a špecializované S-typy, 280-250 mil.r.). Granitické horniny budú študované pomocou štandardných petrologických, mineralogických, geochemických a petrochronologických metód (el. mikroanalýza, mikroRaman, laserová ablácia s indukčne viazanou plazmou, RTG fluorescenčná analýza, Sm, Nd, Pb izotopy pomocou TIMS, U-Th-Pb datovanie, modelovanie v softvéroch Melts a Perple_X). Hlavným cieľom projektu je zistenie magmatických prostredí a granitových protolitov, P-T-X podmienok, datovanie magmatickej a subsolidovej evolúcie granitov a ich vzťah k metamorfným horninám. Mineralogické štúdium zahŕňa aj metalogenetický potenciál granitov. Pre lepšie pochopenie petrogenézy granitov bude očakávaným výstupom aj všeobecný evolučný model západokarpatského paleozoického granitového magmatizmu v kontexte širšieho európskeho priestoru.