Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
Meno a priezvisko:
RNDr. Boris Klempa, DrSc.
Typ dokumentu:
Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
Názov vysokej školy:
Univerzita Komenského v Bratislave
Sídlo vysokej školy:
Šafárikovo námestie 6, 818 06 Bratislava

I. - Základné údaje

I.1 - Priezvisko
Klempa
I.2 - Meno
Boris
I.3 - Tituly
RNDr., PhD., DrSc.
I.4 - Rok narodenia
1976
I.5 - Názov pracoviska
Biomedicínske centrum Slovenskej akadémie vied, Virologický ústav
I.6 - Adresa pracoviska
Dúbravská cesta 9, 84505 Bratislava
I.7 - Pracovné zaradenie
vedúci vedecký pracovník
I.8 - E-mailová adresa
boris.klempa@savba.sk
I.10 - Názov študijného odboru, v ktorom osoba pôsobí na vysokej škole
biológia
I.11 - ORCID iD
"https://orcid.org/0000-0002-6931-1224 0000-0002-6931-1224"

II. - Vysokoškolské vzdelanie a ďalší kvalifikačný rast

II.1 - Vysokoškolské vzdelanie prvého stupňa
II.2 - Vysokoškolské vzdelanie druhého stupňa
II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie
Univerzita Komenského, Prírodovedecká fakulta
II.b - Rok
1999
II.c - Odbor a program
biológia
II.3 - Vysokoškolské vzdelanie tretieho stupňa
II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie
Humboldt Universität, Bertlin
II.b - Rok
2004
II.c - Odbor a program
virológia
II.4 - Titul docent
II.5 - Titul profesor
II.6 - Titul DrSc.
II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie
Slovenská komisia pre vedecké hodnosti
II.b - Rok
2016
II.c - Odbor a program
virológia

III. - Súčasné a predchádzajúce zamestnania

III.a - Zamestnanie-pracovné zaradenie III.b - Inštitúcia III.c - Časové vymedzenie
vedecko-technický pracovník Slovenská akadémia vied, Virologický ústav 1999 - 2001
vedecký asistent Institut fuer Virologie, Charité Universitätsmedizin, Berlin 2001 - 2004
vedecký pracovník Institut fuer Virologie, Charité Universitätsmedizin, Berlin 2005 - 2018
vedecký pracovník Slovenská akadémia vied, Virologický ústav 2005 - 2007
samostatný vedecký pracovník Slovenská akadémia vied, Virologický ústav 2007 - 2009

IV. - Rozvoj pedagogických, odborných, jazykových, digitálnych a iných zručností

IV.a - Popis aktivity, názov kurzu (ak išlo o kurz), iné IV.b - Názov inštitúcie IV.c - Rok
Kurz vírusovej evolúcie a molekulárnej epidemiológie Katholieke Universiteit Leuven 2002
Kurz vírusovej evolúcie a molekulárnej epidemiológie Standford Univesity 2003

V. - Prehľad aktivít v rámci pedagogického pôsobenia na vysokej škole

V.1 - Prehľad zabezpečovaných profilových študijných predmetov v aktuálnom akademickom roku podľa študijných programov
V.2 - Prehľad o zodpovednosti za uskutočňovanie, rozvoj a zabezpečenie kvality študijného programu alebo jeho časti na vysokej škole v aktuálnom akademickom roku
V.3 - Prehľad o zodpovednosti za rozvoj a kvalitu odboru habilitačného konania a inauguračného konania v aktuálnom akademickom roku
V.4 - Prehľad vedených záverečných prác
V.4.1 - Počet aktuálne vedených prác
V.4.a - Bakalárske (prvý stupeň)
0
V.4.b - Diplomové (druhý stupeň)
1
V.4.c - Dizertačné (tretí stupeň)
1
V.4.2 - Počet obhájených prác
V.4.a - Bakalárske (prvý stupeň)
1
V.4.b - Diplomové (druhý stupeň)
8
V.4.c - Dizertačné (tretí stupeň)
4
V.5 - Prehľad zabezpečovaných ostatných študijných predmetov podľa študijných programov v aktuálnom akademickom roku
V.5.a - Názov predmetu V.5.b - Študijný program V.5.c - Stupeň V.5.d - Študijný odbor
Vybrané kapitoly z virológie virológia II. biológia

VI. - Prehľad výsledkov tvorivej činnosti

VI.1 - Prehľad výstupov tvorivej činnosti a ohlasov na výstupy tvorivej činnosti
VI.1.1 - Počet výstupov tvorivej činnosti
VI.1.a - Celkovo
240
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
73
VI.1.2 - Počet výstupov tvorivej činnosti registrovaných v databázach Web of Science alebo Scopus
VI.1.a - Celkovo
116
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
38
VI.1.3 - Počet ohlasov na výstupy tvorivej činnosti
VI.1.a - Celkovo
3437
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
1869
VI.1.4 - Počet ohlasov registrovaných v databázach Web of Science alebo Scopus na výstupy tvorivej činnosti
VI.1.a - Celkovo
3290
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
624
VI.1.5 - Počet pozvaných prednášok na medzinárodnej a národnej úrovni
VI.1.a - Celkovo
20
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
6
VI.2 - Najvýznamnejšie výstupy tvorivej činnosti
1

Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Denys C, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg Infect Dis. 2006;12:838-40. 

2

Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Barrière P, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Novel hantavirus sequences in Shrew, Guinea. Emerg Infect Dis. 2007;13:520-2.

3

Klempa B, Witkowski PT, Popugaeva E, Auste B, Koivogui L, Fichet-Calvet E, Strecker T, Ter Meulen J, Krüger DH. Sangassou virus, the first hantavirus isolate from Africa, displays genetic and functional properties distinct from those of other Murinae-associated hantaviruses. J Virol. 2012;86:3819-27. 

4

Kruger DH, Schonrich G, and Klempa B. Human pathogenic hantaviruses and prevention of infection. Human Vaccines. 2011;7:685-93. 

5

Boršová K, Paul ED, Kováčová V, Radvánska M, Hajdu R, Čabanová V, Sláviková M, Ličková M, Lukáčiková L, Belák A, Roussier L, Kostičová M, Líšková A, Maďarová L, Štefkovičová M, Reizigová L, Nováková E, Sabaka P, Koščálová A, Brejová B, Staroňová E, Mišík M, Vinař T, Nosek J, Čekan P*, Klempa B*. Surveillance of SARS‑CoV‑2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT‑qPCR assay. Scientific Reports. 2021;11:20494. 

VI.3 - Najvýznamnejšie výstupy tvorivej činnosti za ostatných šesť rokov
1

Boršová K, Paul ED, Kováčová V, Radvánska M, Hajdu R, Čabanová V, Sláviková M, Ličková M, Lukáčiková L, Belák A, Roussier L, Kostičová M, Líšková A, Maďarová L, Štefkovičová M, Reizigová L, Nováková E, Sabaka P, Koščálová A, Brejová B, Staroňová E, Mišík M, Vinař T, Nosek J, Čekan P*, Klempa B*. Surveillance of SARS‑CoV‑2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT‑qPCR assay. Scientific Reports. 2021;11:20494. 

2

Ličková M, Fumačová Havlíková S, Sláviková M, Slovák M, Drexler JF, Klempa B*. Dermacentor reticulatus is a vector of tick-borne encephalitis virus. Ticks Tick Borne Dis. 2020 Jul;11(4):101414. 

3

Tkachenko EA, Ishmukhametov AA, Dzagurova TK, Bernshtein AD, Morozov VG, Siniugina AA, Kurashova SS, Balkina AS, Tkachenko PE, Kruger DH, Klempa B*. Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome, Russia. Emerg Infect Dis. 2019 Dec;25(12):2325-2328. 

4

Laenen L, Vergote V, Kafetzopoulou LE, Wawina TB, Vassou D, Cook JA, Hugot JP, Deboutte W, Kang HJ, Witkowski PT, Köppen-Rung P, Krüger DH, Licková M, Stang A, Striešková L, Szemeš T, Markowski J, Hejduk J, Kafetzopoulos D, Van Ranst M, Yanagihara R, Klempa B, Maes P*. A Novel Hantavirus of the European Mole, Bruges Virus, Is Involved in Frequent Nova Virus Coinfections. Genome Biol Evol. 2018 Jan 1;10(1):45-55. 

5

Witkowski PT, Drexler JF, Kallies R, Ličková M, Bokorová S, Maganga GD, Szemes T, Leroy EM, Krüger DH, Drosten C, Klempa B.Phylogenetic analysis of a newfound bat-borne hantavirus supports a laurasiatherian host association for ancestral mammalian hantaviruses. Infect Genet Evol. 2016 Jul;41:113-119.

VI.4 - Najvýznamnejšie ohlasy na výstupy tvorivej činnosti
1

Jonsson CB, Figueiredo LT, Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin Microbiol Rev. 2010 Apr;23(2):412-41. doi: 10.1128/CMR.00062-09. Citovaná práca: Klempa B, Tkachenko EA, Dzagurova TK, Yunicheva YV, Morozov VG, Okulova NM, Slyusareva GP, Smirnov A, Kruger DH. Hemorrhagic fever with renal syndrome caused by 2 lineages of Dobrava hantavirus, Russia. Emerg Infect Dis. 2008 Apr;14(4):617-25. doi: 10.3201/eid1404.071310. 

2

Wille M, Geoghegan JL, Holmes EC. How accurately can we assess zoonotic risk? PLoS Biol. 2021 Apr 20;19(4):e3001135. doi: 10.1371/journal.pbio.3001135. Citovaná práca: Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Barrière P, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Novel hantavirus sequences in Shrew, Guinea. Emerg Infect Dis. 2007 Mar;13(3):520-2. doi: 10.3201/eid1303.061198. 

3

Arai S, Ohdachi SD, Asakawa M, Kang HJ, Mocz G, Arikawa J, Okabe N, Yanagihara R. Molecular phylogeny of a newfound hantavirus in the Japanese shrew mole (Urotrichus talpoides). Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Oct 21;105(42):16296-301. doi: 10.1073/pnas.0808942105. Citovaná práca: Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Barrière P, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Novel hantavirus sequences in Shrew, Guinea. Emerg Infect Dis. 2007 Mar;13(3):520-2. doi: 10.3201/eid1303.061198

4

Guo WP, Lin XD, Wang W, Tian JH, Cong ML, Zhang HL, Wang MR, Zhou RH, Wang JB, Li MH, Xu J, Holmes EC, Zhang YZ. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS Pathog. 2013 Feb;9(2):e1003159. doi: 10.1371/journal.ppat.1003159. Citovaná práca: Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Denys C, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg Infect Dis. 2006 May;12(5):838-40. doi: 10.3201/eid1205.051487.

5

Engdahl TB, Crowe JE Jr. Humoral Immunity to Hantavirus Infection. mSphere. 2020 Jul 15;5(4):e00482-20. doi: 10.1128/mSphere.00482-20. Citovaná práca: Kruger DH, Figueiredo LT, Song JW, Klempa B. Hantaviruses--globally emerging pathogens. J Clin Virol. 2015 Mar;64:128-36. doi: 10.1016/j.jcv.2014.08.033. 

VI.5 - Účasť na riešení (vedení) najvýznamnejších vedeckých projektov alebo umeleckých projektov za posledných šesť rokov
1

EU Horizon2020: Euroepan Virus Archive goes global (EVAg), 2015-2019, zodpovedný riešiteľ za VÚ SAV. Cieľom projektu EVAg (European Virus Archive goes global) bolo v celosvetovom meradle zvýšiť dostupnosť vírusov a z nich derivovaných produktov a tým akcelerovať virologický výskum a zlepšiť pripravenosť na nové vírusové epidémie a nadviazať na predchádzajúci project EVA. Kľúčovou náplňou projektu bola preto príprava a charakteristika vírusov a z nich derivovaných produktov a ich následné poskytovanie akademickým partnerom, diagnostickým laboratóriám, či industriálnym partnerom aktívnym v oblastiach vývoja antivírusových látok či diagnostických produktov.

2

EU 7RP: Anti-tick Vaccines to Prevent Tick-borne Diseases in Europe, (ANTIDotE), 2013-2018, zodpovedný riešiteľ za VÚ SAV. Projekt ANTIDotE bol zameraný na vývoj vakcín zacielených proti u nás najbežnejším kliešťom Ixodes ricinus, ktoré by súčasne chránili voči prenosu viacerých kliešťami-prenášaným patogénom, predovšetkým voči boréliám, babésiám a vírusu kliešťovej encefalitídy. V rámci projektu sa podarilo vykonať viacero dôležitých experimentov zameraných na biologickú charakterizáciu vybraných kandidátskych klieštich génov vrátane samotných imunizačných pokusov overujúcich vhodnosť využitia týchto proteínov ako vakcín. Podarilo sa ukázať, že obmedzenie expresie jedného z cicaním-indukovaných génov priamo v kliešťoch pomocou technológie RNAi vedie nielen k zníženej schopnosti kliešťov prijímať potravu, ale taktiež k zníženému prenosu vírusu kliešťovej encefalitídy na myši, ktorý sa prejavil v preukaznom predĺžení doby prežívania myší infikovaných vírusom prostredníctvom cicajúcich kliešťov. Ešte povzbudzujúcejšie výsledky sa získali pri imunizačných pokusoch s dvomi kandidátskymi vakcínami. Zatiaľ čo v kontrolnej skupine hynulo po expozícii infikovanými kliešťami 100% myší, imunizácia kandidátskymi antigénmi viedla prostredníctvom obmedzeného cicania kliešťov a zníženého prenosu vírusu k prežívaniu až u polovice myší. Získané výsledkyboli impulzom pre pokračovanie v tejto oblasti výskumu. 

3

EU Horizon2020: European Virus Archive GLOBAL (EVA-GLOBAL), 2020-2023, zodpovedný riešiteľ za BMC SAV. H2020 projekt EVA-GLOBAL je priamy pokračovateľ úspešných medzinárodných projektov EVA (FP7) a EVAg (H2020). Pokračujúcou hlavnou misiou projektu je v celosvetovom meradle zvýšiť dostupnosť vírusov a z nich derivovaných produktov a tým akcelerovať virologický výskum, ako aj zrýchliť a zlepšiť diagnostiku vírusových ochorení a tým zásadne zlepšiť pripravenosť na vírusové epidémie. Táto misia sa práve v mimoriadnych, COVID-19 pandemických rokoch ukázala ako mimoriadne dôležitá a EVA-GLOBAL zohral z globálneho hľadiska v pandémii mimoriadne dôležitú úlohu. 

4

APVV-15-0232: Využitie sekvenovania novej generácie pre analýzu virómu medicínsky a hospodársky významných organizmov, 2016-2019, koordinátor. Projektu NEXTVIR bol zameraný na vývoj metodológie sekvenovania vírusov a analýzy virómu pomocou metód „next-generation sequencing“ (NGS) a využitie týchto metód pre analýzu medicínsky a hospodársky významných vírusov drobných cicavcov a hospodársky dôležitých rastlín. Ciele projektu boli splnené nad rámec očakávaní. Získané výsledky boli prezentované v 12 publikáciách v zahraničných karentovaných časopisoch.


Očakávané výstupy projektu boli naplnené aj v ostatných dôležitých aspektoch projektu, akými bola vedecká výchova študentov, popularizačné aktivity, či tvorba vyvolaných projektov. Získané metodické skúsenosti viedli k podaniu štyroch domácich a dvoch zahraničných projektov, ktoré využívajú detekciu a analýzu nízko zastúpených RNA molekúl v hostiteľských vzorkách. Významným prínosom projektu je aj posilnenie medzinárodnej spolupráce, kedy viacero významných výsledkov geograficky aj významovo presiahlo hranice Slovenska.


Najvýznamnejšie výsledky boli dosiahnuté v oblasti identifikácie a genetickej charakterizácie nových alebo novo sa objavujúcich rastlinných aj živočíšnych vírusov. Vyvinuté a uplatnené NGS postupy aplikované priamo na vzorky z terénu bez predchádzajúcej izolácie vírusu sa ukázali ako veľmi prínosné najmä v oblasti detekcie rastlinných vírusov a viedli k identifikácii viacerých vírusov hospodársky významných rastlín. Podobne aj v oblasti zoonotických vírusov prenášaných drobnými cicavcami viedla práve aplikácia NGS metód k zásadnému zlomu v predchádzajúcom snažení o genetickú charakterizáciu novo identifikovaného hantavírusu Bruges.  

5

APVV-PP-COVID-20-0017: Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARS-CoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID-19, 2020-2021, koordinátor. Pandémia COVID-19 predstavuje bezprecedentnú situáciu, s akou sa v novodobej histórii svet a Slovensko nestretli. Jedným z predpokladov na zmiernenie jej negatívnych dopadov na spoločnosť je prehĺbenie poznatkov o imunitnej odpovedi na infekciu vírusom SARS-CoV-2 a zavedenie efektívnych diagnostických prístupov, ktoré umožnia zlepšiť manažment pacientov a kontrolu nad šírením infekcie. V tomto projekte sa spojili pracoviská, ktoré sa aktívne podieľali na úspešnom boji Slovenska s prvou fázou pandémie, so zámerom reagovať na konkrétne potreby klinickej, diagnostickej a epidemiologickej praxe. Hlavným cieľom projektu bolo objasniť dynamiku a charakter imunitnej odpovede na infekciu SARS-CoV-2 pomocou systematickej analýzy klinických vzoriek opakovane získaných od pacientov s COVID-19 a kontrolných probandov, s využitím spektra virologických a imunologických metód. Esenciálnou súčasťou projektu bol aj vývoj virologických testov, ktoré si vyžadujú prácu s infekčným vírusom v špecializovanom laboratóriu s tretím stupňom biologickej bezpečnosti, ako sú vírus neutralizačný test, či izolácia infekčného vírusu. Tieto metódy boli využívané aj priamo pre klinickú prax. Dôležitou ambíciou projektu bolo aj zefektívniť primárnu diagnostiku vírusu kombináciou slín ako diagnostickej tekutiny a „loop-mediated isothermal amplification“ (LAMP) metódy. Unikátna interdisciplinárna spolupráca partnerov s expertízou vo virológii, molekulárnej biológii, imunológii, klinickej infektológii a v matematickom modelovaní boli zárukou originality a úspechu tohto projektu.

VII. - Prehľad aktivít v organizovaní vysokoškolského vzdelávania a tvorivých činností

VII.a - Aktivita, funkcia VII.b - Názov inštitúcie, grémia VII.c - Časové vymedzenia pôsobenia
člen redakčnej rady Virus Genes 2018 - doteraz
predseda Vedeckej rady Biomedicínske centrum SAV 2020 - doteraz
volený člen medzinárodnej rady International Society for hantaviruses 2019 - doteraz
volený člen Učená spoločnosť Slovenska 2021 - doteraz
člen Vedeckej rady Univerzita Komenského, Prírodovedecká fakulta 2019 - doteraz

VIII. - Prehľad zahraničných mobilít a pôsobenia so zameraním na vzdelávanie a tvorivú činnosť v študijnom odbore

VIII.a - Názov inštitúcie VIII.b - Sídlo inštitúcie VIII.c - Obdobie trvania pôsobenia/pobytu (uviesť dátum odkedy dokedy trval pobyt) VIII.d - Mobilitná schéma, pracovný kontrakt, iné (popísať)
Institut für Virologie, Charité Universitätsmedizin Berlin, Germany 8/2000 - 10/2000 EMBO štipendium
Institut für Virologie, Charité Universitätsmedizin Berlin, Germany 7/2001 - 12/2004 PhD štúdium
Institut für Virologie, Charité Universitätsmedizin Berlin, Germany 2005 - 2018 associated research fellow
University of Cagliari Cagliari, Italy 11.09 visiting professor

IX. - Iné relevantné skutočnosti

Dátum poslednej aktualizácie
2022-02-14