Research/art/teacher profile of a person
Name and surname:
RNDr. Boris Klempa, DrSc.
Document type:
Research/art/teacher profile of a person
The name of the university:
Comenius University Bratislava
The seat of the university:
Šafárikovo námestie 6, 818 06 Bratislava

I. - Basic information

I.1 - Surname
Klempa
I.2 - Name
Boris
I.3 - Degrees
RNDr., PhD., DrSc.
I.4 - Year of birth
1976
I.5 - Name of the workplace
Biomedical Research Center of the Slovak Academy of Sciences, Institute of Virology
I.6 - Address of the workplace
Dúbravská cesta 9, 84505 Bratislava
I.7 - Position
Senior scientist
I.8 - E-mail address
boris.klempa@savba.sk
I.10 - Name of the study field in which a person works at the university
Biology
I.11 - ORCID iD
"https://orcid.org/0000-0002-6931-1224 0000-0002-6931-1224"

II. - Higher education and further qualification growth

II.1 - First degree of higher education
II.2 - Second degree of higher education
II.a - Name of the university or institution
Comenius University in Bratislava, Faculty of Natural Sciences
II.b - Year
1999
II.c - Study field and programme
Biology
II.3 - Third degree of higher education
II.a - Name of the university or institution
Humboldt Universität, Bertlin
II.b - Year
2004
II.c - Study field and programme
Virology
II.4 - Associate professor
II.5 - Professor
II.6 - Doctor of Science (DrSc.)
II.a - Name of the university or institution
Slovak Commission for Scientific Degrees
II.b - Year
2016
II.c - Study field and programme
Virology

III. - Current and previous employment

III.a - Occupation-position III.b - Institution III.c - Duration
Laboratory technician Slovak Academy of Sciences, Institute of Virology 1999 - 2001
Scientific assistant Institut fuer Virologie, Charité Universitätsmedizin, Berlin 2001 - 2004
Scientist Institut fuer Virologie, Charité Universitätsmedizin, Berlin 2005 - 2018
Scientist Slovak Academy of Sciences, Institute of Virology 2005 - 2007
Independent researcher Slovak Academy of Sciences, Institute of Virology 2007 - 2009

IV. - Development of pedagogical, professional, language, digital and other skills

IV.a - Activity description, course name, other IV.b - Name of the institution IV.c - Year
Course of viral evolution and molecular epidemiology Katholieke Universiteit Leuven 2002
Course of viral evolution and molecular epidemiology Standford Univesity 2003

V. - Overview of activities within the teaching career at the university

V.1 - Overview of the profile courses taught in the current academic year according to study programmes
V.2 - Overview of the responsibility for the delivery, development and quality assurance of the study programme or its part at the university in the current academic year
V.3 - Overview of the responsibility for the development and quality of the field of habilitation procedure and inaugural procedure in the current academic year
V.4 - Overview of supervised final theses
V.4.1 - Number of currently supervised theses
V.4.a - Bachelor's (first degree)
0
V.4.b - Diploma (second degree)
1
V.4.c - Dissertation (third degree)
1
V.4.2 - Number of defended theses
V.4.a - Bachelor's (first degree)
1
V.4.b - Diploma (second degree)
8
V.4.c - Dissertation (third degree)
4
V.5 - Overview of other courses taught in the current academic year according to study programmes
V.5.a - Name of the course V.5.b - Study programme V.5.c - Degree V.5.d - Field of study
Selected chapters from virology Virology II. Biology

VI. - Overview of the research/artistic/other outputs

VI.1 - Overview of the research/artistic/other outputs and the corresponding citations
VI.1.1 - Number of the research/artistic/other outputs
VI.1.a - Overall
240
VI.1.b - Over the last six years
73
VI.1.2 - Number of the research/artistic/other outputs registered in the Web of Science or Scopus databases
VI.1.a - Overall
116
VI.1.b - Over the last six years
38
VI.1.3 - Number of citations corresponding to the research/artistic/other outputs
VI.1.a - Overall
3437
VI.1.b - Over the last six years
1869
VI.1.4 - Number of citations registered in the Web of Science or Scopus databases
VI.1.a - Overall
3290
VI.1.b - Over the last six years
624
VI.1.5 - Number of invited lectures at the international, national level
VI.1.a - Overall
20
VI.1.b - Over the last six years
6
VI.2 - The most significant research/artistic/other outputs
1

Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Denys C, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg Infect Dis. 2006;12:838-40. 

2

Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Barrière P, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Novel hantavirus sequences in Shrew, Guinea. Emerg Infect Dis. 2007;13:520-2.

3

Klempa B, Witkowski PT, Popugaeva E, Auste B, Koivogui L, Fichet-Calvet E, Strecker T, Ter Meulen J, Krüger DH. Sangassou virus, the first hantavirus isolate from Africa, displays genetic and functional properties distinct from those of other Murinae-associated hantaviruses. J Virol. 2012;86:3819-27. 

4

Kruger DH, Schonrich G, and Klempa B. Human pathogenic hantaviruses and prevention of infection. Human Vaccines. 2011;7:685-93. 

5

Boršová K, Paul ED, Kováčová V, Radvánska M, Hajdu R, Čabanová V, Sláviková M, Ličková M, Lukáčiková L, Belák A, Roussier L, Kostičová M, Líšková A, Maďarová L, Štefkovičová M, Reizigová L, Nováková E, Sabaka P, Koščálová A, Brejová B, Staroňová E, Mišík M, Vinař T, Nosek J, Čekan P*, Klempa B*. Surveillance of SARS‑CoV‑2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT‑qPCR assay. Scientific Reports. 2021;11:20494. 

VI.3 - The most significant research/artistic/other outputs over the last six years
1

Boršová K, Paul ED, Kováčová V, Radvánska M, Hajdu R, Čabanová V, Sláviková M, Ličková M, Lukáčiková L, Belák A, Roussier L, Kostičová M, Líšková A, Maďarová L, Štefkovičová M, Reizigová L, Nováková E, Sabaka P, Koščálová A, Brejová B, Staroňová E, Mišík M, Vinař T, Nosek J, Čekan P*, Klempa B*. Surveillance of SARS‑CoV‑2 lineage B.1.1.7 in Slovakia using a novel, multiplexed RT‑qPCR assay. Scientific Reports. 2021;11:20494. 

2

Ličková M, Fumačová Havlíková S, Sláviková M, Slovák M, Drexler JF, Klempa B*. Dermacentor reticulatus is a vector of tick-borne encephalitis virus. Ticks Tick Borne Dis. 2020 Jul;11(4):101414. 

3

Tkachenko EA, Ishmukhametov AA, Dzagurova TK, Bernshtein AD, Morozov VG, Siniugina AA, Kurashova SS, Balkina AS, Tkachenko PE, Kruger DH, Klempa B*. Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome, Russia. Emerg Infect Dis. 2019 Dec;25(12):2325-2328. 

4

Laenen L, Vergote V, Kafetzopoulou LE, Wawina TB, Vassou D, Cook JA, Hugot JP, Deboutte W, Kang HJ, Witkowski PT, Köppen-Rung P, Krüger DH, Licková M, Stang A, Striešková L, Szemeš T, Markowski J, Hejduk J, Kafetzopoulos D, Van Ranst M, Yanagihara R, Klempa B, Maes P*. A Novel Hantavirus of the European Mole, Bruges Virus, Is Involved in Frequent Nova Virus Coinfections. Genome Biol Evol. 2018 Jan 1;10(1):45-55. 

5

Witkowski PT, Drexler JF, Kallies R, Ličková M, Bokorová S, Maganga GD, Szemes T, Leroy EM, Krüger DH, Drosten C, Klempa B.Phylogenetic analysis of a newfound bat-borne hantavirus supports a laurasiatherian host association for ancestral mammalian hantaviruses. Infect Genet Evol. 2016 Jul;41:113-119.

VI.4 - The most significant citations corresponding to the research/artistic/other outputs
1

Jonsson CB, Figueiredo LT, Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin Microbiol Rev. 2010 Apr;23(2):412-41. doi: 10.1128/CMR.00062-09. Citovaná práca: Klempa B, Tkachenko EA, Dzagurova TK, Yunicheva YV, Morozov VG, Okulova NM, Slyusareva GP, Smirnov A, Kruger DH. Hemorrhagic fever with renal syndrome caused by 2 lineages of Dobrava hantavirus, Russia. Emerg Infect Dis. 2008 Apr;14(4):617-25. doi: 10.3201/eid1404.071310. 

2

Wille M, Geoghegan JL, Holmes EC. How accurately can we assess zoonotic risk? PLoS Biol. 2021 Apr 20;19(4):e3001135. doi: 10.1371/journal.pbio.3001135. Citovaná práca: Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Barrière P, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Novel hantavirus sequences in Shrew, Guinea. Emerg Infect Dis. 2007 Mar;13(3):520-2. doi: 10.3201/eid1303.061198. 

3

Arai S, Ohdachi SD, Asakawa M, Kang HJ, Mocz G, Arikawa J, Okabe N, Yanagihara R. Molecular phylogeny of a newfound hantavirus in the Japanese shrew mole (Urotrichus talpoides). Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Oct 21;105(42):16296-301. doi: 10.1073/pnas.0808942105. Citovaná práca: Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Barrière P, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Novel hantavirus sequences in Shrew, Guinea. Emerg Infect Dis. 2007 Mar;13(3):520-2. doi: 10.3201/eid1303.061198

4

Guo WP, Lin XD, Wang W, Tian JH, Cong ML, Zhang HL, Wang MR, Zhou RH, Wang JB, Li MH, Xu J, Holmes EC, Zhang YZ. Phylogeny and origins of hantaviruses harbored by bats, insectivores, and rodents. PLoS Pathog. 2013 Feb;9(2):e1003159. doi: 10.1371/journal.ppat.1003159. Citovaná práca: Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, Denys C, Koivogui L, ter Meulen J, Krüger DH. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg Infect Dis. 2006 May;12(5):838-40. doi: 10.3201/eid1205.051487.

5

Engdahl TB, Crowe JE Jr. Humoral Immunity to Hantavirus Infection. mSphere. 2020 Jul 15;5(4):e00482-20. doi: 10.1128/mSphere.00482-20. Citovaná práca: Kruger DH, Figueiredo LT, Song JW, Klempa B. Hantaviruses--globally emerging pathogens. J Clin Virol. 2015 Mar;64:128-36. doi: 10.1016/j.jcv.2014.08.033. 

VI.5 - Participation in conducting (leading) the most important research projects or art projects over the last six years
1

EU Horizon2020: Euroepan Virus Archive goes global (EVAg), 2015-2019, zodpovedný riešiteľ za VÚ SAV. Cieľom projektu EVAg (European Virus Archive goes global) bolo v celosvetovom meradle zvýšiť dostupnosť vírusov a z nich derivovaných produktov a tým akcelerovať virologický výskum a zlepšiť pripravenosť na nové vírusové epidémie a nadviazať na predchádzajúci project EVA. Kľúčovou náplňou projektu bola preto príprava a charakteristika vírusov a z nich derivovaných produktov a ich následné poskytovanie akademickým partnerom, diagnostickým laboratóriám, či industriálnym partnerom aktívnym v oblastiach vývoja antivírusových látok či diagnostických produktov.

2

EU 7RP: Anti-tick Vaccines to Prevent Tick-borne Diseases in Europe, (ANTIDotE), 2013-2018, zodpovedný riešiteľ za VÚ SAV. Projekt ANTIDotE bol zameraný na vývoj vakcín zacielených proti u nás najbežnejším kliešťom Ixodes ricinus, ktoré by súčasne chránili voči prenosu viacerých kliešťami-prenášaným patogénom, predovšetkým voči boréliám, babésiám a vírusu kliešťovej encefalitídy. V rámci projektu sa podarilo vykonať viacero dôležitých experimentov zameraných na biologickú charakterizáciu vybraných kandidátskych klieštich génov vrátane samotných imunizačných pokusov overujúcich vhodnosť využitia týchto proteínov ako vakcín. Podarilo sa ukázať, že obmedzenie expresie jedného z cicaním-indukovaných génov priamo v kliešťoch pomocou technológie RNAi vedie nielen k zníženej schopnosti kliešťov prijímať potravu, ale taktiež k zníženému prenosu vírusu kliešťovej encefalitídy na myši, ktorý sa prejavil v preukaznom predĺžení doby prežívania myší infikovaných vírusom prostredníctvom cicajúcich kliešťov. Ešte povzbudzujúcejšie výsledky sa získali pri imunizačných pokusoch s dvomi kandidátskymi vakcínami. Zatiaľ čo v kontrolnej skupine hynulo po expozícii infikovanými kliešťami 100% myší, imunizácia kandidátskymi antigénmi viedla prostredníctvom obmedzeného cicania kliešťov a zníženého prenosu vírusu k prežívaniu až u polovice myší. Získané výsledkyboli impulzom pre pokračovanie v tejto oblasti výskumu. 

3

EU Horizon2020: European Virus Archive GLOBAL (EVA-GLOBAL), 2020-2023, zodpovedný riešiteľ za BMC SAV. H2020 projekt EVA-GLOBAL je priamy pokračovateľ úspešných medzinárodných projektov EVA (FP7) a EVAg (H2020). Pokračujúcou hlavnou misiou projektu je v celosvetovom meradle zvýšiť dostupnosť vírusov a z nich derivovaných produktov a tým akcelerovať virologický výskum, ako aj zrýchliť a zlepšiť diagnostiku vírusových ochorení a tým zásadne zlepšiť pripravenosť na vírusové epidémie. Táto misia sa práve v mimoriadnych, COVID-19 pandemických rokoch ukázala ako mimoriadne dôležitá a EVA-GLOBAL zohral z globálneho hľadiska v pandémii mimoriadne dôležitú úlohu. 

4

APVV-15-0232: Využitie sekvenovania novej generácie pre analýzu virómu medicínsky a hospodársky významných organizmov, 2016-2019, koordinátor. Projektu NEXTVIR bol zameraný na vývoj metodológie sekvenovania vírusov a analýzy virómu pomocou metód „next-generation sequencing“ (NGS) a využitie týchto metód pre analýzu medicínsky a hospodársky významných vírusov drobných cicavcov a hospodársky dôležitých rastlín. Ciele projektu boli splnené nad rámec očakávaní. Získané výsledky boli prezentované v 12 publikáciách v zahraničných karentovaných časopisoch.


Očakávané výstupy projektu boli naplnené aj v ostatných dôležitých aspektoch projektu, akými bola vedecká výchova študentov, popularizačné aktivity, či tvorba vyvolaných projektov. Získané metodické skúsenosti viedli k podaniu štyroch domácich a dvoch zahraničných projektov, ktoré využívajú detekciu a analýzu nízko zastúpených RNA molekúl v hostiteľských vzorkách. Významným prínosom projektu je aj posilnenie medzinárodnej spolupráce, kedy viacero významných výsledkov geograficky aj významovo presiahlo hranice Slovenska.


Najvýznamnejšie výsledky boli dosiahnuté v oblasti identifikácie a genetickej charakterizácie nových alebo novo sa objavujúcich rastlinných aj živočíšnych vírusov. Vyvinuté a uplatnené NGS postupy aplikované priamo na vzorky z terénu bez predchádzajúcej izolácie vírusu sa ukázali ako veľmi prínosné najmä v oblasti detekcie rastlinných vírusov a viedli k identifikácii viacerých vírusov hospodársky významných rastlín. Podobne aj v oblasti zoonotických vírusov prenášaných drobnými cicavcami viedla práve aplikácia NGS metód k zásadnému zlomu v predchádzajúcom snažení o genetickú charakterizáciu novo identifikovaného hantavírusu Bruges.  

5

APVV-PP-COVID-20-0017: Výskum imunitnej odpovede na infekciu SARS-CoV-2 a vývoj klinicky relevantných virologických testov na zvládnutie dopadov pandémie COVID-19, 2020-2021, koordinátor. Pandémia COVID-19 predstavuje bezprecedentnú situáciu, s akou sa v novodobej histórii svet a Slovensko nestretli. Jedným z predpokladov na zmiernenie jej negatívnych dopadov na spoločnosť je prehĺbenie poznatkov o imunitnej odpovedi na infekciu vírusom SARS-CoV-2 a zavedenie efektívnych diagnostických prístupov, ktoré umožnia zlepšiť manažment pacientov a kontrolu nad šírením infekcie. V tomto projekte sa spojili pracoviská, ktoré sa aktívne podieľali na úspešnom boji Slovenska s prvou fázou pandémie, so zámerom reagovať na konkrétne potreby klinickej, diagnostickej a epidemiologickej praxe. Hlavným cieľom projektu bolo objasniť dynamiku a charakter imunitnej odpovede na infekciu SARS-CoV-2 pomocou systematickej analýzy klinických vzoriek opakovane získaných od pacientov s COVID-19 a kontrolných probandov, s využitím spektra virologických a imunologických metód. Esenciálnou súčasťou projektu bol aj vývoj virologických testov, ktoré si vyžadujú prácu s infekčným vírusom v špecializovanom laboratóriu s tretím stupňom biologickej bezpečnosti, ako sú vírus neutralizačný test, či izolácia infekčného vírusu. Tieto metódy boli využívané aj priamo pre klinickú prax. Dôležitou ambíciou projektu bolo aj zefektívniť primárnu diagnostiku vírusu kombináciou slín ako diagnostickej tekutiny a „loop-mediated isothermal amplification“ (LAMP) metódy. Unikátna interdisciplinárna spolupráca partnerov s expertízou vo virológii, molekulárnej biológii, imunológii, klinickej infektológii a v matematickom modelovaní boli zárukou originality a úspechu tohto projektu.

VII. - Overview of organizational experience related to higher education and research/artistic/other activities

VII.a - Activity, position VII.b - Name of the institution, board VII.c - Duration
member of the Editorial Board Virus Genes 2018 - up to now
Chairman of the Scientific Council Biomedical Center SAS 2020 - up to now
elected member of the International Council International Society for hantaviruses 2019 - up to now
elected member The learned society of Slovakia 2021 - up to now
Chairman of the Scientific Council Comenius University in Bratislava, Faculty of Natural Sciences 2019 - up to now

VIII. - Overview of international mobilities and visits oriented on education and research/artistic/other activities in the given field of study

VIII.a - Name of the institution VIII.b - Address of the institution VIII.c - Duration (indicate the duration of stay) VIII.d - Mobility scheme, employment contract, other (describe)
Institut für Virologie, Charité Universitätsmedizin Berlin, Germany 8/2000 - 10/2000 EMBO scholarship
Institut für Virologie, Charité Universitätsmedizin Berlin, Germany 7/2001 - 12/2004 PhD study
Institut für Virologie, Charité Universitätsmedizin Berlin, Germany 2005 - 2018 associated research fellow
University of Cagliari Cagliari, Italy 11.09 visiting professor

IX. - Other relevant facts

Date of last update
2022-02-14