ADC04 Liptáková, Adriána - Siegfried, Leonard - Rosocha, Ján - Podracká, Ľudmila - Bogyiová, E. - Kotulová, Daniela: A family outbreak of haemolytic uraemic syndrome and haemorrhagic colitis caused by verocytotoxigenic Escherichia coli O157 from unpasteurised cow´s milk in Slovakia

In: Clinical Microbiology and Infection. - Vol. 10, No. 6 (2004), s. 576-578. - ISSN 1198-743X

Indikátor časopisu: IF (JCR) 2004=2,361

Kvartil Q:

wos-jcr -- Q2 [Infectious diseases] -- 2004

wos-jcr -- Q2 [Microbiology] -- 2004

scimago-sjr -- Q2 [Infectious Diseases] -- 2004

scimago-sjr -- Q1 [Medicine (miscellaneous)] -- 2004

scimago-sjr -- Q2 [Microbiology (medical)] -- 2004

Práca bola napísaná počas môjho postgraduálneho štúdia, ktorého jeden z cieľov bol zameraný na implementáciu laboratórneho algoritmu záchytu verocytotoxigénnej E.coli (VTEC).

V roku 2003 sme použili na Slovensku prvýkrát PCR diagnostiku na detekciu génov kódujúcich šiga toxíny, enterohemolyzínu a adherenčného proteínu.

Táto štúdia uvádza prvé prípady hemolyticko-uremického syndrómu a hemoragickej kolitídy na Slovensku spôsobené VTEC O157.

Vďaka zavedenému algoritmu sme zachytili rodinnú epidémiu verocytotoxigénnej infekcie Escherichia coli O157 (VTEC) zahŕňajúcu deväť osôb z jednej širšej rodiny, ktorá sa vyskytla na východnom Slovensku. Tri deti trpeli hemolyticko-uremickým syndrómom, dve deti mali krvavú hnačku a štyria dospelí boli asymptomatickí nosiči. Získalo sa štrnásť izolátov E. coli O157 nefermentujúcich sorbitol obsahujúcich gény vtx2, eae a ehxA. Aktivita verocytotoxínu 2 bola preukázaná u všetkých 14 izolátov.

Veľmi úzko sme spolupracovali s pediatrami, epidemiológmi a veterinárnou správou. Po epidemiologickom sledovaní bolo ako zdroj nákazy identifikované nepasterizované kravské mlieko.

Výsledky práce pomohli implementovať na Slovensku nový mikrobiologický diagnostický protocol pre infekcie spôsobené VTEC.

ADC03 Birošová, Eva - Siegfried, Leonard - Kmeťová, Marta - Makara, A. - Ostró, Alexander -Grešová, A. - Urdzík, P. - Liptáková, Adriána - Molokáčová, Mária - Bártl, R. (aut) - Valanský, L.: Detection of virulence factors in alpha - haemolytic Escherichia coli strains isolated from various clinical materials

In: Clinical Microbiology and Infection. - Vol. 10, No. 6 (2004), s. 569-573. - ISSN 1198-743X

Indikátor časopisu:IF (JCR) 2004=2,361

Kvartil Q:

wos-jcr -- Q2 [Infectious diseases] -- 2004

wos-jcr -- Q2 [Microbiology] -- 2004

Vrámci postgraduálneho štúdia som bola v riešiteľskom kolektíve, ktorý etabloval molekulárno-biologické metódy na detekciu faktorov virulencie pomocou detekcie ich génov. Celkovo bolo pomocou PCR vyšetrených 201 α-hemolytických izolátov Escherichia coli z rôznych klinických materiálov (vzorky moču a vaginálne a rektálne výtery) na prítomnosť génov pre faktory virulencie α-hemolyzín (hly), cytotoxický nekrotizujúci faktor typu 1 (cnf1 ), P-fimbrie (pap), S/F1C-fimbrie (sfa/foc), aerobaktín (aer) a afimbriálny adhezín (afal). Spomedzi vaginálnych izolátov bolo 96 % pozitívnych na cnf1 v porovnaní s 80 % kmeňov moču (p 0,02) a 63 % kmeňov konečníka (p 0,0001). Podobne sa sekvencie DNA špecifické pre sfa/foc našli v 97 % vaginálnych izolátov v porovnaní so 75 % rektálnych kmeňov (p 0,004). Gény afa1 a aer boli viac spojené s rektálnymi a-hemolytickými kmeňmi E. coli ako s extraintestinálnymi izolátmi. Výsledky naznačujú, že CNF1 a/alebo S/F1C-fimbrie prispievajú ku kolonizácii a perzistencii a-hemolytických kmeňov E. coli vo vaginálnom prostredí. Štatistická analýza odhalila zvýšený výskyt cnf1 a sfa/foc v izolátoch E. coli z vaginálnych výterov v porovnaní s izolátmi z moču alebo rektálnych výterov.

Toto zistenie bolo významné z troch dôvodov. Po prvé, je známe, že S-fimbrie obsahujú kľúčový faktor virulencie v patogenéze neonatálnej meningitídy spôsobenej E. coli. Preto pretrvávanie S-fimbriovaných a-hemolytických kmeňov E. coli vo vagíne tehotných žien môže vystaviť novorodencov vyššiemu riziku infekcie. Po druhé, E. coli je najčastejším patogénom izolovaným od pacientov s bakteriálnou prostatitídou. Viacerí autori pozorovali zvýšený podiel nekrotoxigénnych kmeňov E. coli u pacientov s bakteriálnou prostatitídou. Preto by vaginálny prenos nekrotoxigénnych kmeňov E. coli mohol vystaviť sexuálnych partnerov riziku prostatickej infekcie. Po tretie, ženy často trpia zvýšenou náchylnosťou na opakované infekcie močových a pohlavných ciest v súvislosti s uropatogénnymi kmeňmi E. coli.

ADC03 Birošová, Eva - Siegfried, Leonard - Kmeťová, Marta - Makara, A. - Ostró, Alexander -Grešová, A. - Urdzík, P. - Liptáková, Adriána - Molokáčová, Mária - Bártl, R. (aut) - Valanský, L.: Detection of virulence factors in alpha - haemolytic Escherichia coli strains isolated from various clinical materials

In: Clinical Microbiology and Infection. - Vol. 10, No. 6 (2004), s. 569-573. - ISSN 1198-743X

Indikátor časopisu:IF (JCR) 2004=2,361

Kvartil Q:

wos-jcr -- Q2 [Infectious diseases] -- 2004

wos-jcr -- Q2 [Microbiology] -- 2004

Vrámci postgraduálneho štúdia som bola v riešiteľskom kolektíve, ktorý etabloval molekulárno-biologické metódy na detekciu faktorov virulencie pomocou detekcie ich génov. Celkovo bolo pomocou PCR vyšetrených 201 α-hemolytických izolátov Escherichia coli z rôznych klinických materiálov (vzorky moču a vaginálne a rektálne výtery) na prítomnosť génov pre faktory virulencie α-hemolyzín (hly), cytotoxický nekrotizujúci faktor typu 1 (cnf1 ), P-fimbrie (pap), S/F1C-fimbrie (sfa/foc), aerobaktín (aer) a afimbriálny adhezín (afal). Spomedzi vaginálnych izolátov bolo 96 % pozitívnych na cnf1 v porovnaní s 80 % kmeňov moču (p 0,02) a 63 % kmeňov konečníka (p 0,0001). Podobne sa sekvencie DNA špecifické pre sfa/foc našli v 97 % vaginálnych izolátov v porovnaní so 75 % rektálnych kmeňov (p 0,004). Gény afa1 a aer boli viac spojené s rektálnymi a-hemolytickými kmeňmi E. coli ako s extraintestinálnymi izolátmi. Výsledky naznačujú, že CNF1 a/alebo S/F1C-fimbrie prispievajú ku kolonizácii a perzistencii a-hemolytických kmeňov E. coli vo vaginálnom prostredí. Štatistická analýza odhalila zvýšený výskyt cnf1 a sfa/foc v izolátoch E. coli z vaginálnych výterov v porovnaní s izolátmi z moču alebo rektálnych výterov.

Toto zistenie bolo významné z troch dôvodov. Po prvé, je známe, že S-fimbrie obsahujú kľúčový faktor virulencie v patogenéze neonatálnej meningitídy spôsobenej E. coli. Preto pretrvávanie S-fimbriovaných a-hemolytických kmeňov E. coli vo vagíne tehotných žien môže vystaviť novorodencov vyššiemu riziku infekcie. Po druhé, E. coli je najčastejším patogénom izolovaným od pacientov s bakteriálnou prostatitídou. Viacerí autori pozorovali zvýšený podiel nekrotoxigénnych kmeňov E. coli u pacientov s bakteriálnou prostatitídou. Preto by vaginálny prenos nekrotoxigénnych kmeňov E. coli mohol vystaviť sexuálnych partnerov riziku prostatickej infekcie. Po tretie, ženy často trpia zvýšenou náchylnosťou na opakované infekcie močových a pohlavných ciest v súvislosti s uropatogénnymi kmeňmi E. coli.

ADC10 Dražilová, Sylvia - Janičko, Martin - Skladaný, Ľubomír - Kristian, Pavol - Oltman, Marián - Szántová, Mária - Krkoška, Dušan - Mazuchová, Eva - Piesecká, Ľubica - Vahalova, Veronika - Rác, Marek - Schréter, Ivan - Virág, Ladislav - Koller, Tomáš - Liptáková, Adriána - Ondrášová, Miriam (5%) - Jarčuška, Peter : Glucose metabolism changes in patients with chronic hepatitis C Treated with direct acting antivirals

In: Canadian Journal of Gastroenterology & Hepatology [elektronický dokument]. - Roč. 2018 (2018), s. [1-10], art. no. 6095097 [print]. - ISSN (print) 2291-2789

URL: https://www.hindawi.com/journals/cjgh/2018/6095097/

Indikátor časopisu: IF (JCR) 2018=1,714

Kvartil Q:

scimago-sjr -- Q2 [Medicine (miscellaneous)] -- 2018

Práca bola napísaná počas môjho postdoktorandského štúdia. Chronická hepatitída C je systémové ochorenie a diabetes mellitus 2. typu (T2DM) patrí k bežnejším extrahepatálnym prejavom. Cieľom tejto štúdie bolo (i) preskúmať prevalenciu zhoršenej glukózy nalačno (IFG) a T2DM u pacientov s chronickou hepatitídou C, (ii) preskúmať vplyv liečby priamo pôsobiacimi antivirotikami (DAA) na glykémiu a (iii ) skúmať faktory, ktoré modulujú účinok liečby DAA na glykémiu u pacientov s chronickou hepatitídou C. Uskutočnili sme longitudinálnu retrospektívnu observačnú štúdiu zameranú na pacientov podstupujúcich DAA liečbu chronickej hepatitídy C. Údaje o glykémii, anamnéze diabetu, vírusu hepatitídy C, liečbe a stave pečene vrátane elastografie boli získané na začiatku liečby (pred začiatkom liečby), na konci liečby a 12 týždňov po ukončení liečby. Pacienti boli liečení rôznymi režimami priamo pôsobiacich antivirotík.

Výsledky. Zaradili sme 370 pacientov; 45,9 % malo fibrózu F4. Na začiatku sa prevalencia T2DM zvyšovala so stupňom fibrózy (F0-F2 14,4 %, F3 21,3 % a F4 31,8 %, p=0,004). Glykémia nalačno sa tiež zvýšila so stupňom fibrózy (F0-F2 5,75±0,18 F3 5,84±0,17 a F4 6,69±0,2 mmol/l, p=0,001). Významný pokles glykémie po liečbe sme zaznamenali u všetkých pacientov, ale u pacientov bez T2DM alebo IFG z 6,21±0,12 na 6,08±0,15 mmol/l (p=0,002). Pokles bol viditeľný aj u pacientov, ktorí už boli liečení, a pacientov s Child-Pugh A cirhózou. Potvrdili sme, že prevalencia T2DM alebo IFG sa zvyšuje u pacientov s chronickou hepatitídou C so stupňom fibrózy. Prediktívnymi faktormi pre T2DM boli okrem F4 fibróza aj vyšší vek a BMI. Významný pokles glykémie nalačno po liečbe DAA bol pozorovaný v celom súbore a v podskupinách pacientov s T2DM, IFG, cirhózou a liečených pacientov.

Aj na základe tejto štúdie sa na Slovensku stala dostupnou a plne hradenou antivírusová terapia proti HCV s účinosťou okolo 99,9%, ktorá významne prispela ku zníženiu rizík spojených s neliečenou HCV infekciou.

V310 Ficik, Jozef - Andrezál, Michal - Drahovská, Hana - Böhmer, Miroslav - Szemes, Tomáš (aut) - Liptáková, Adriána - Slobodníková, Lívia: Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae in COVID-19 Era-Challenges and Solutions

In: Antibiotics. - Roč. 12, č. 8 (2023), s. [1-16], art. no. 1285. - ISSN (online) 2079-6382

Indikátor časopisu:IF (JCR) 2022=4.8

Kvartil Q:

wos-jcr -- Q1 [Pharmacology & pharmacy] -- 2022

wos-jcr -- Q2 [Infectious diseases] -- 2022

V roku 2022 sme úspešne akreditovali 3.stupeň postgraduálneho štúdia v odbore Lekárska mikrobiológia a imunológia. Práca je výsledkom vedeckého bádania jedného z našich prvých doktorandov na pracovisku.

Obdobie COVID-19 prinieslo nové medicínske výzvy, ktoré spolu s nozokomiálnymi bakteriálnymi infekciami znamenali pre systém zdravotnej starostlivosti obrovskú záťaž. Jednou z najalarmujúcejších nozokomiálnych hrozieb bola Klebsiella pneumoniae (CRKP) rezistentná na karbapeném. Monitorovanie výskytu CRKP a antimikrobiálnej rezistencie globálne a lokálne je životne dôležité. V retrospektívnej štúdii bol v Ústrednej vojenskej nemocnici v Ružomberku zisťovaný výskyt CRKP v období pred COVID-19 (2017–2019) a pandémii COVID-19 (2020–2022). Relatívny výskyt CRKP sa počas obdobia COVID-19 výrazne zvýšil – 4,8-krát, z 0,18 na 0,76 %. Zároveň 47 % CRKP-pozitívnych pacientov malo aj COVID-19. Identifikovalo sa 26 izolátov KPC a 69 izolátov produkujúcich NDM. CRKP izolované v roku 2022 boli podrobené celogenómovému sekvenovaniu a ich citlivosť bola testovaná na cefiderokol, ceftazidím–avibaktám, imipeném–relebaktám a meropeném–vaborbaktám s vynikajúcimi výsledkami. Izoláty produkujúce KPC boli tiež vysoko citlivé na kolistín (92 %). Izoláty NDM odhalili nižšiu mieru citlivosti, vrátane iba 57 % citlivosti na kolistín. ST-307 prevládal v KPC a ST-11 v izolátoch NDM. Napriek vynikajúcej aktivite nových antimikrobiálnych látok sa musí dôsledne dodržiavať racionálna antibiotická politika podporená doplnkovou liečbou a prísnymi protiepidemickými opatreniami.

Výsledky štúdie podporujú vstup nových liečiv a ich sprístupnenie pre liečbu závažných nozokomiálnych infekcií.

Práca vyšla v špeciálnom čísle časopisu Antibiotics “Strategies for Combatting Multidrug-Resistant and Extensively Drug-Resistant Bacteria: Current Challenges and Future Prospects”, v ktorom som bola hosťujúcou editorkou.

V310 Ficik, Jozef - Andrezál, Michal - Drahovská, Hana - Böhmer, Miroslav - Szemes, Tomáš (aut) - Liptáková, Adriána - Slobodníková, Lívia: Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae in COVID-19 Era-Challenges and Solutions

In: Antibiotics. - Roč. 12, č. 8 (2023), s. [1-16], art. no. 1285. - ISSN (online) 2079-6382

Indikátor časopisu:IF (JCR) 2022=4.8

Kvartil Q:

wos-jcr -- Q1 [Pharmacology & pharmacy] -- 2022

wos-jcr -- Q2 [Infectious diseases] -- 2022

V roku 2022 sme úspešne akreditovali 3.stupeň postgraduálneho štúdia v odbore Lekárska mikrobiológia a imunológia. Práca je výsledkom vedeckého bádania jedného z našich prvých doktorandov na pracovisku.

Obdobie COVID-19 prinieslo nové medicínske výzvy, ktoré spolu s nozokomiálnymi bakteriálnymi infekciami znamenali pre systém zdravotnej starostlivosti obrovskú záťaž. Jednou z najalarmujúcejších nozokomiálnych hrozieb bola Klebsiella pneumoniae (CRKP) rezistentná na karbapeném. Monitorovanie výskytu CRKP a antimikrobiálnej rezistencie globálne a lokálne je životne dôležité. V retrospektívnej štúdii bol v Ústrednej vojenskej nemocnici v Ružomberku zisťovaný výskyt CRKP v období pred COVID-19 (2017–2019) a pandémii COVID-19 (2020–2022). Relatívny výskyt CRKP sa počas obdobia COVID-19 výrazne zvýšil – 4,8-krát, z 0,18 na 0,76 %. Zároveň 47 % CRKP-pozitívnych pacientov malo aj COVID-19. Identifikovalo sa 26 izolátov KPC a 69 izolátov produkujúcich NDM. CRKP izolované v roku 2022 boli podrobené celogenómovému sekvenovaniu a ich citlivosť bola testovaná na cefiderokol, ceftazidím–avibaktám, imipeném–relebaktám a meropeném–vaborbaktám s vynikajúcimi výsledkami. Izoláty produkujúce KPC boli tiež vysoko citlivé na kolistín (92 %). Izoláty NDM odhalili nižšiu mieru citlivosti, vrátane iba 57 % citlivosti na kolistín. ST-307 prevládal v KPC a ST-11 v izolátoch NDM. Napriek vynikajúcej aktivite nových antimikrobiálnych látok sa musí dôsledne dodržiavať racionálna antibiotická politika podporená doplnkovou liečbou a prísnymi protiepidemickými opatreniami.

Výsledky štúdie podporujú vstup nových liečiv a ich sprístupnenie pre liečbu závažných nozokomiálnych infekcií.

Práca vyšla v špeciálnom čísle časopisu Antibiotics “Strategies for Combatting Multidrug-Resistant and Extensively Drug-Resistant Bacteria: Current Challenges and Future Prospects”, v ktorom som bola hosťujúcou editorkou.

FAI02 Liptáková, Adriána - Predný, Ján - Buc, Milan - Slobodníková, Lívia - Jalili, Nasir - Krčméry, Vladimír - Koreň, Ján: Lekárska mikrobiológia. - 1. vyd. - Bratislava : Herba, 2019. - 952 s. [145,03 AH] [print]. - (Dieškova edícia ; zv. 8) ISBN 978-80-89631-91-9

učebnica pre vysoké školy

Mikrobiológia je základný medicínsky odbor, ktorý zaznamenáva neustály záujem vedcov a lekárov. Prvé vydanie knihy (do roku 2019 neexistovala slovenská učebnica lekárskej mikrobiológie) sa dostalo ku čitateľom iba pár týždňov pred vypuknutím pandémie spôsobenej SARS-CoV-2, ktorá výrazne zasiahla náš každodenný život. Kniha sa prakticky behom necelého roka vypredala a kolektív autorov sa opätovne zišiel a pripravil kvalitný učebný text, ktorý zahrňuje aj inovované kapitoly dotýkajúce sa impaktu koronavírusovej pandémie. Mikrobiológia patrí medzi elementárne pregraduálne predmety študentov medicíny. Základy bakteriológie, virológie, mykológie a parazitológie spolu so základmi antiinfekčnej terapie sú stavebnými piliermi pre všetky nadstavbové klinické predmety ako je interné lekárstvo, chirurgia, pediatria, gynekológia a pôrodníctvo, infektológia a ďalšie. Nové poznatky v oblasti molekulovej biológie, imunológie, diagnostiky a liečby infekčných ochorení priniesli veľký pokrok v lekárskej mikrobiológii. Webová stránka www.lekarskamikrobiologia.eu, ktorá je súčasťou knihy, sa už stala bežne používaným študijným materiálom. Učebnica lekárskej mikrobiológie slúži študentom medicíny, aby vedeli správne manažovať vo svojej lekárskej praxi pacienta s podozrením na infekčné ochorenie. Učebnica spolu s e-learningovým riešením poskytuje súhrn najnovších poznatkov lekárskej mikrobiológie. Tieto poznatky sa premietajú do vyššej kvality vzdelávacieho procesu študentov lekárskych fakúlt nielen v Bratislave ale aj na ostatných lekárskych fakultách na Slovensku. Prepojenie učebnice a virtuálneho priestoru umožňuje aktualizáciu a sprístupnenie najnovších poznatkov v mikrobiologickej vede. Testovanie v elektronickom prostredí z domáceho prostredia zvyšuje compliance študentov a zatraktívňuje náročný medicínsky odbor. Študenti si môžu overiť svoje vedomosti získané na prednáškach, praktických cvičeniach a štúdiom povinnej literatúry pomocou kontrolných otázok, zaradených ku klinickým prípadom.

P103 Blažeková, Mária - Botek, Rudolf - Buc, Milan - Bukovinová, Pavlína - Czirfusová, Monika - Čurová, Katarína - Deglovič, Juraj - Dibalová, Hana - Drahovská, Hana - Drgoňa, Ľuboš - Dubinová, Martina - Gdovinová, Zuzana - Holá, Veronika - Horniačková, Miroslava - Hubenáková, Zuzana -Hučková, Daniela - Jalili, Nasir - Kónyová, Zuzana - Koreň, Ján - Krčméry, Vladimír - Kristian, Pavol - Liptáková, Adriána - Lisalová, Magdaléna - Líšková, Anna - Neuschlová, Martina - Nováková, Elena - Novotný, Martin - Ondriska, František - Piecková, Elena - Poľanová, Monika - Porvazník, Igor - Růžička, Filip - Sabaka, Peter - Schréter, Ivan - Slobodníková, Lívia - Solovič, Ivan (aut) - Straka, Marek - Šimaljaková, Mária - Staneková, Danica: Lekárska mikrobiológia. - 2. dopl. vyd. - Bratislava : Herba, 2023. - 771 s. [118,4 AH] [print]. - (Dieškovaedícia ; zv. 10), ISBN 978-80-8229-027-4

učebnica pre vysoké školy

Mikrobiológia je základný medicínsky odbor, ktorý zaznamenáva neustály záujem vedcov a lekárov. Prvé vydanie knihy (do roku 2019 neexistovala slovenská učebnica lekárskej mikrobiológie) sa dostalo ku čitateľom iba pár týždňov pred vypuknutím pandémie spôsobenej SARS-CoV-2, ktorá výrazne zasiahla náš každodenný život. Kniha sa prakticky behom necelého roka vypredala a kolektív autorov sa opätovne zišiel a pripravil kvalitný učebný text, ktorý zahrňuje aj inovované kapitoly dotýkajúce sa impaktu koronavírusovej pandémie. Mikrobiológia patrí medzi elementárne pregraduálne predmety študentov medicíny. Základy bakteriológie, virológie, mykológie a parazitológie spolu so základmi antiinfekčnej terapie sú stavebnými piliermi pre všetky nadstavbové klinické predmety ako je interné lekárstvo, chirurgia, pediatria, gynekológia a pôrodníctvo, infektológia a ďalšie. Nové poznatky v oblasti molekulovej biológie, imunológie, diagnostiky a liečby infekčných ochorení priniesli veľký pokrok v lekárskej mikrobiológii. Webová stránka www.lekarskamikrobiologia.eu, ktorá je súčasťou knihy, sa už stala bežne používaným študijným materiálom. Učebnica lekárskej mikrobiológie slúži študentom medicíny, aby vedeli správne manažovať vo svojej lekárskej praxi pacienta s podozrením na infekčné ochorenie. Učebnica spolu s e-learningovým riešením poskytuje súhrn najnovších poznatkov lekárskej mikrobiológie. Tieto poznatky sa premietajú do vyššej kvality vzdelávacieho procesu študentov lekárskych fakúlt nielen v Bratislave ale aj na ostatných lekárskych fakultách na Slovensku. Prepojenie učebnice a virtuálneho priestoru umožňuje aktualizáciu a sprístupnenie najnovších poznatkov v mikrobiologickej vede. Testovanie v elektronickom prostredí z domáceho prostredia zvyšuje compliance študentov a zatraktívňuje náročný medicínsky odbor. Študenti si môžu overiť svoje vedomosti získané na prednáškach, praktických cvičeniach a štúdiom povinnej literatúry pomocou kontrolných otázok, zaradených ku klinickým prípadom.

Matteo Boattini, Gabriele Bianco, Paulo Bastos, Viktoria Eirini Mavromanolaki, Sofia Maraki, Anastasia Spiliopoulou, Vasileios Kakouris, Yordan Kalchev, Ana Budimir, Branka Bedenić, Zana Rubic, Monica Licker, Corina Musuroi, Emese Juhász, Katalin Kristóf, Mateja Pirs, Ivana Velimirovic, Michael Berktold, Adriána Liptáková, Adriana Krajcikova, Pavel Drevinek, Anezka Gryndlerova, Monika Brzychczy-Wloch, Aldona Olechowska-Jarząb, Filip Bielec, Małgorzata Brauncajs, Edyta Podsiadly, Grażyna Nurzyńska, Patrycja Zalas-Więcek, Kristian Riesbeck, Hanna-Sofia Andersson, Tone Tønjum, Johan Christian Berild, Truls Michael Leegaard, Asger Nellemann Rasmussen, Kristian Schønning, Stefan Glöckner, Jürgen Rödel, Mohamed Tarek Badr, Georg Alexander Häcker, Denise Stark, Axel Hamprecht, Anna Dudakova, Jonathan Jantsch, Stefano Mancini, Chantal Quiblier, Damien Jacot, Gilbert Greub, Tiziano Ferniani, Simone Ambretti, Maddalena Calvo, Stefania Stefani, Rogier Schade, Erlangga Yusuf, Stefanie van Kleef-van Koeveringe, Sarah Vandamme, Alexia Verroken, Hector Rodriguez-Villalobos, François Duigou, Stéphane Corvec, Pauline Floch, Clémence Massip, Delphine Chainier, Olivier Barraud, Marie-Bossuète Louissaint, Assaf Mizrahi, Saied Ali, Maeve Doyle, Clarice Egan, Sinead McNicholas, Javier Colomina-Rodriguez, Ignacio Torres, Raul Gilarranz Luengo, Maria Nieves Larrosa Escartín, Maria Belen Viñado Perez, Ana Verónica Halperin, Sergio Fuente García, Rafael Cantón, Miguel Seruca, Vasco Santos Mendes, Dinah Carvalho, Rossana Cavallo, José Melo Cristino, Cristina Costa,

Diagnostic and epidemiological landscape of anaerobic bacteria in Europe, 2020–2023 (ANAEuROBE),

International Journal of Antimicrobial Agents,

Volume 65, Issue 6,

2025,

107478,

ISSN 0924-8579,

https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2025.107478.

(https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0924857925000354)

Abstract: Introduction

Despite being implicated in a wide spectrum of community- and healthcare-acquired infections, anaerobes have not yet been incorporated into systematic surveillance programs in Europe.

Methods

We conducted a multicentre retrospective observational study analysing all anaerobic strains isolated from blood cultures in 44 European Hospital Centres over a 4-y period (2020–2023). Diagnostic approach, epidemiology, and antimicrobial susceptibility according to EUCAST v. 15.0 were investigated.

Results

Our study included 14,527 anaerobes, most of which were Gram-positive (45%) or Gram-negative (40%) bacilli. MALDI-TOF coupled to mass spectrometry was the most widely used tool for species identification (98%). Antimicrobial susceptibility testing was performed in the vast majority of centres, using mostly gradient diffusion strip (77%) and disk diffusion (45%) methods according to EUCAST guidelines. The most prevalent species were Cutibacterium acnes (18.7%), Bacteroides fragilis (16.3%), Clostridium perfringens (5.3%), Bacteroides thetaiotaomicron (4.2%), Fusobacterium nucleatum (3.5%), and Parvimonas micra (3.4%). C. acnes showed high resistance to benzylpenicillin (18%), clindamycin (39%), and imipenem (19% and 13% by MIC methods and disk diffusion, respectively). B. fragilis showed high resistance to amoxicillin/clavulanate (24%), piperacillin/tazobactam (22% and 14% by MIC methods and disk diffusion, respectively), clindamycin (22% by both MIC methods and disk diffusion), meropenem (13%), and metronidazole (10%, only by disk diffusion). A similar resistance pattern was observed in B. thetaiotaomicron, Bacteroides ovatus, and Parabacteroides distasonis. C. perfringens showed high resistance to clindamycin (69% and 45% by MIC methods and disk diffusion, respectively), while benzylpenicillin and metronidazole maintained over 90% activity. F. nucleatum showed high resistance to benzylpenicillin (11%), while Fusobacterium necrophorum showed alarming rates of resistance to clindamycin (12%), meropenem (16%) and metronidazole (11%).

Conclusions

This study presented an up-to-date analysis of the diagnostics and epidemiology of anaerobic bacteria in Europe, providing insights for future comparative analyses and the development of antimicrobial diagnostic and management strategies, as well as the optimization of current antibiotic treatments.

Keywords: Anaerobes; Antimicrobial resistance; Bacteroides; Blood culture; Clostridium; Sepsis

Jalali, Y.; Liptáková, A.; Jalali, M.; Payer, J. Moving toward Extensively Drug-Resistant: Four-Year Antimicrobial Resistance Trends of Acinetobacter baumannii from the Largest Department of Internal Medicine in Slovakia. Antibiotics 2023, 12, 1200. https://doi.org/10.3390/antibiotics12071200

ADC04 Liptáková, Adriána - Siegfried, Leonard - Rosocha, Ján - Podracká, Ľudmila - Bogyiová, E. - Kotulová, Daniela: A family outbreak of haemolytic uraemic syndrome and haemorrhagic colitis caused by verocytotoxigenic Escherichia coli O157 from unpasteurised cow´s milk in Slovakia

In: Clinical Microbiology and Infection. - Vol. 10, No. 6 (2004), s. 576-578. - ISSN 1198-743X

Indikátor časopisu: IF (JCR) 2004=2,361

Kvartil Q:

wos-jcr -- Q2 [Infectious diseases] -- 2004

wos-jcr -- Q2 [Microbiology] -- 2004

scimago-sjr -- Q2 [Infectious Diseases] -- 2004

scimago-sjr -- Q1 [Medicine (miscellaneous)] -- 2004

scimago-sjr -- Q2 [Microbiology (medical)] -- 2004

Ohlasy 23, z toho 23 SCI

ADC03 Birošová, Eva - Siegfried, Leonard - Kmeťová, Marta - Makara, A. - Ostró, Alexander -Grešová, A. - Urdzík, P. - Liptáková, Adriána - Molokáčová, Mária - Bártl, R. (aut) - Valanský, L.: Detection of virulence factors in alpha - haemolytic Escherichia coli strains isolated from various clinical materials

In: Clinical Microbiology and Infection. - Vol. 10, No. 6 (2004), s. 569-573. - ISSN 1198-743X

Indikátor časopisu:IF (JCR) 2004=2,361

Kvartil Q:

wos-jcr -- Q2 [Infectious diseases] -- 2004

wos-jcr -- Q2 [Microbiology] -- 2004

Ohlasy 43, z toho 43 SCI

ADC10 Dražilová, Sylvia - Janičko, Martin - Skladaný, Ľubomír - Kristian, Pavol - Oltman, Marián - Szántová, Mária - Krkoška, Dušan - Mazuchová, Eva - Piesecká, Ľubica - Vahalova, Veronika - Rác, Marek - Schréter, Ivan - Virág, Ladislav - Koller, Tomáš - Liptáková, Adriána - Ondrášová, Miriam (5%) - Jarčuška, Peter : Glucose metabolism changes in patients with chronic hepatitis C Treated with direct acting antivirals

In: Canadian Journal of Gastroenterology & Hepatology [elektronický dokument]. - Roč. 2018 (2018), s. [1-10], art. no. 6095097 [print]. - ISSN (print) 2291-2789

URL: https://www.hindawi.com/journals/cjgh/2018/6095097/

Indikátor časopisu: IF (JCR) 2018=1,714

Kvartil Q:

scimago-sjr -- Q2 [Medicine (miscellaneous)] -- 2018

Ohlasy 22, z toho 21 SCI

Lubomira Tothova^ABDEF, Peter Celec^ABCDEFG, Janka Babickova^B, Jana Gajdosova^B, Hend Al-Alami^B, Natalia Kamodyova^B, Hana Drahovska^BG, Adriana Liptakova^G, Jan Turna^G, Julius Hodosy^ABCDEFGDOI: 10.12659/MSM.881844

Med Sci Monit 2011; 17(7): BR173-178

Ohlasy 41, z toho 41 SCI

FAI02 Liptáková, Adriána - Predný, Ján - Buc, Milan - Slobodníková, Lívia - Jalili, Nasir - Krčméry, Vladimír - Koreň, Ján: Lekárska mikrobiológia. - 1. vyd. - Bratislava : Herba, 2019. - 952 s. [145,03 AH] [print]. - (Dieškova edícia ; zv. 8) ISBN 978-80-89631-91-9

učebnica pre vysoké školy

P103 Blažeková, Mária - Botek, Rudolf - Buc, Milan - Bukovinová, Pavlína - Czirfusová, Monika - Čurová, Katarína - Deglovič, Juraj - Dibalová, Hana - Drahovská, Hana - Drgoňa, Ľuboš - Dubinová, Martina - Gdovinová, Zuzana - Holá, Veronika - Horniačková, Miroslava - Hubenáková, Zuzana -Hučková, Daniela - Jalili, Nasir - Kónyová, Zuzana - Koreň, Ján - Krčméry, Vladimír - Kristian, Pavol - Liptáková, Adriána - Lisalová, Magdaléna - Líšková, Anna - Neuschlová, Martina - Nováková, Elena - Novotný, Martin - Ondriska, František - Piecková, Elena - Poľanová, Monika - Porvazník, Igor - Růžička, Filip - Sabaka, Peter - Schréter, Ivan - Slobodníková, Lívia - Solovič, Ivan (aut) - Straka, Marek - Šimaljaková, Mária - Staneková, Danica: Lekárska mikrobiológia. - 2. dopl. vyd. - Bratislava : Herba, 2023. - 771 s. [118,4 AH] [print]. - (Dieškovaedícia ; zv. 10), ISBN 978-80-8229-027-4

učebnica pre vysoké školy

Kultúrna a edukačná grantová agentúra Ministerstva školstva, vedy, výskumu a športu Slovenskej republiky KEGA 002UK-4/2022

2022-2024      Inovácia učebných textov a online súborov z lekárskej mikrobiológie určených pre pregraduálnu a postgraduálnu výučbu mikrobiológie na lekárskych fakultách prostredníctvom elektronických médií a simulácií

Hlavná riešiteľka

Kultúrna a edukačná grantová agentúra Ministerstva školstva, vedy, výskumu a športu Slovenskej republiky KEGA004UK-4/2018

2018-2020      Interaktívny učebný text z lekárskej mikrobiológie pre študentov pregraduálneho štúdia medicíny

Hlavná riešiteľka

Agentúra pre podporu vedy a výskumu APVV-18-0171

2019-2022      Význam nových biomarkerov hepatitídy B pre stratifikáciu rizika a manažment liečby pacientov s chronickou HBv infekciou

Zástupkyňa hlavného riešiteľa

Agentúra pre podporu vedy a výskumu APVV-23- 0546

2023-2027 Eradikácia multirezistentných mikroorganizmov vrátane nosných kmeňov u pacientov pomocou personalizovaného prístupu

Hlavná riešiteľka