The protective effect of 1-methyltryptophan isomers in renal ischemia-reperfusion injury is not exclusively dependent on indolamine 2,3-dioxygenase inhibition. Čepcová D, Kema IP, Sandovici M, Deelman LE, Šišková K, Klimas J, Vavrinec P, Vavrincová-Yaghi D. Biomed Pharmacother. 2021 Mar;135:111180. doi: 10.1016/j.biopha.2020.111180.

A case of severe chlorite poisoning successfully treated with early administration of methylene blue, renal replacement therapy, and red blood cell transfusion: case report. Gebhardtova A, Vavrinec P, Vavrincova-Yaghi D, Seelen M, Dobisova A, Flassikova Z, Cikova A, Henning RH, Yaghi A. Medicine (Baltimore). 2014 Aug;93(9):e60. doi: 10.1097/MD.0000000000000060

Local gene therapy with indoleamine 2,3-dioxygenase protects against development of transplant vasculopathy in chronic kidney transplant dysfunction. Vavrincova-Yaghi D, Deelman LE, van Goor H, Seelen MA, Vavrinec P, Kema IP, Gomolcak P, Benigni A, Henning RH, Sandovici M. Gene Ther. 2016 Nov;23(11):797-806. doi: 10.1038/gt.2016.59.

Early Posttransplant Tryptophan Metabolism Predicts Long-term Outcome of Human Kidney Transplantation. Vavrincova-Yaghi D, Seelen MA, Kema IP, Deelman LE, van der Heuvel MC, Breukelman H, Van den Eynde BJ, Henning RH, van Goor H, Sandovici M. Transplantation. 2015 Aug;99(8):e97-104. doi: 10.1097/TP.0000000000000603. 

Gene therapy with adenovirus-delivered indoleamine 2,3-dioxygenase improves renal function and morphology following allogeneic kidney transplantation in rat. Vavrincova-Yaghi D, Deelman LE, Goor H, Seelen M, Kema IP, Smit-van Oosten A, Zeeuw D, Henning RH, Sandovici M. J Gene Med. 2011 Jul;13(7-8):373-81. doi: 10.1002/jgm.1584. 

Gaál Kovalčíková A, Janovičová Ľ, Hodosy J, Bábíčková J, Vavrincová-Yaghi D, Vavrinec P, Boor P, Podracká Ľ, Šebeková K, Celec P, Tóthová Ľ. Extracellular DNA concentrations in various aetiologies of acute kidney injury. Sci Rep. 2022 Oct 7;12(1):16812. doi: 10.1038/s41598-022-21248-7. PMID: 36207374; PMCID: PMC9546839.

Kovalčíková A, Gyurászová M, Vavrincová-Yaghi D, Vavrinec P, Tóthová Ľ, Boor P, Šebeková K, Celec P. Oxidative stress in the brain caused by acute kidney injury. Metab Brain Dis. 2018 Jun;33(3):961-967. doi: 10.1007/s11011-018-0204-8. Epub 2018 Mar 7. PMID: 29516412.

Renczés E, Marônek M, Gaál Kovalčíková A, Vavrincová-Yaghi D, Tóthová L, Hodosy J. Behavioral Changes During Development of Chronic Kidney Disease in Rats. Front Med (Lausanne). 2020 Jan 9;6:311. doi: 10.3389/fmed.2019.00311. PMID: 31998731; PMCID: PMC6962109.

Mišúth S, Uhrinová M, Klimas J, Vavrincová-Yaghi D, Vavrinec P. Vildagliptin improves vascular smooth muscle relaxation and decreases cellular senescence in the aorta of doxorubicin-treated rats. Vascul Pharmacol. 2021 Jun;138:106855. doi: 10.1016/j.vph.2021.106855. Epub 2021 Mar 17. PMID: 33744414.

Vavrinec P, Krivy J, Sykorova S, Bandzuchova H, Zilinska Z, Vavrincova-Yaghi D. Association of Senescence Markers with Age and Allograft Rejection in Renal Transplant Recipients. Biomedicines. 2024 Oct 14;12(10):2338. doi: 10.3390/biomedicines12102338. PMID: 39457650; PMCID: PMC11505218.

The protective effect of 1-methyltryptophan isomers in renal ischemia-reperfusion injury is not exclusively dependent on indolamine 2,3-dioxygenase inhibition. Čepcová D, Kema IP, Sandovici M, Deelman LE, Šišková K, Klimas J, Vavrinec P, Vavrincová-Yaghi D. Biomed Pharmacother. 2021 Mar;135:111180.

Behavioral Changes During Development of Chronic Kidney Disease in Rats. Renczés E, Marônek M, Gaál Kovalčíková A, Vavrincová-Yaghi D, Tóthová L, Hodosy J. Front Med (Lausanne). 2020 Jan 9;6:311.

Vildagliptin improves vascular smooth muscle relaxation and decreases cellular senescence in the aorta of doxorubicin-treated rats. Mišúth S, Uhrinová M, Klimas J, Vavrincová-Yaghi D, Vavrinec P. Vascul Pharmacol. 2021 Jun;138:106855.

Extracellular DNA concentrations in various aetiologies of acute kidney injury. Gaál Kovalčíková A, Janovičová Ľ, Hodosy J, Bábíčková J, Vavrincová-Yaghi D, Vavrinec P, Boor P, Podracká Ľ, Šebeková K, Celec P, Tóthová Ľ. Sci Rep. 2022 Oct 7;12(1):16812. doi: 10.1038/s41598-022-21248-7. PMID: 36207374; PMCID: PMC9546839.

Enhanced Diazepam Elimination With the Molecular Adsorbents Recirculating System (MARS) in Severe Autointoxication: A Survival Case Report. Dobisova A, Vavrinec P, Vavrincova-Yaghi D, Gebhardtova A, Henning RH, Yaghi A. Case Report. Front Med (Lausanne). 2021 Mar 9;8:633250. doi: 10.3389/fmed.2021.633250. PMID: 33791324; PMCID: PMC8006414.

Cinakova A, Vavrincova-Yaghi D, Krenek P, Klimas J, Kralova E. Combination of dapagliflozin and pioglitazone lacks superiority against monotherapy in streptozotocin-induced nephropathy. Sci Rep. 2025 Jan 9;15(1):1464. doi: 10.1038/s41598-024-84487-w. PMID: 39789116; PMCID: PMC11718164.

Vavrinec P, Krivy J, Sykorova S, Bandzuchova H, Zilinska Z, Vavrincova-Yaghi D. Association of Senescence Markers with Age and Allograft Rejection in Renal Transplant Recipients. Biomedicines. 2024 Oct 14;12(10):2338. doi: 10.3390/biomedicines12102338. PMID: 39457650; PMCID: PMC11505218.

Uremic encephalopathy. Rosner MH, Husain-Syed F, Reis T, Ronco C, Vanholder R. Kidney Int. 2022 Feb;101(2):227-241 

Acute kidney injury. John A Kellum, Paola Romagnani, Gloria Ashuntantang, Claudio Ronco , Alexander Zarbock, Hans-Joachim Anders. Nat Rev Dis Primers. 2021 Jul 15;7(1):52.

Tryptophan metabolism as a common therapeutic target in cancer, neurodegeneration and beyond. Platten, M., Nollen, E.A.A, Röhrig, U.F., Fallarino, F., Opitz, C.A.: Nature Reviews Drug Discovery. 2019 May;18(5):379-401.

Store–Operated Ca2+ Channels in Mesangial Cells Inhibit Matrix Protein Expression. Peiwen Wu, Yanxia Wang, Mark E. Davis, Jonathan E. Zuckerman, Sarika Chaudhari, Malcolm Begg, Rong Ma. J Am Soc Nephrol. 2015 Nov; 26(11): 2691–2702. 

The immunometabolic role of indoleamine 2,3-dioxygenase in atherosclerotic cardiovascular disease: immune homeostatic mechanisms in the artery wall. Daniel F J Ketelhuth. Cardiovasc Res. 2019 Jul 1;115(9):1408-1415. 

Schuermans S., Kestens C., Marques P.E.

AUTHOR FULL NAMES: Schuermans, Sara (57279202300); Kestens, Caine (59244158600); Marques, Pedro Elias (55338593700)

57279202300; 59244158600; 55338593700

Systemic mechanisms of necrotic cell debris clearance

(2024) Cell Death and Disease, 15 (8), art. no. 557, Cited 5 times.

DOI: 10.1038/s41419-024-06947-5

Thakur M., Junho C.V.C., Bernhard S.M., Schindewolf M., Noels H., Döring Y.

AUTHOR FULL NAMES: Thakur, Manovriti (57201339918); Junho, Carolina Victoria Cruz (57218316378); Bernhard, Sarah Maike (57211577925); Schindewolf, Marc (23502374900); Noels, Heidi (17342638800); Döring, Yvonne (22233586100)

57201339918; 57218316378; 57211577925; 23502374900; 17342638800; 22233586100

NETs-Induced Thrombosis Impacts on Cardiovascular and Chronic Kidney Disease

(2023) Circulation Research, 132 (8), pp. 933 - 949, Cited 21 times.

DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.123.321750

Imenez Silva P.H., Pepin M., Figurek A., Gutiérrez-Jiménez E., Bobot M., Iervolino A., Mattace-Raso F., Hoorn E.J., Bailey M.A., Hénaut L., Nielsen R., Frische S., Trepiccione F., Hafez G., Altunkaynak H.O., Endlich N., Unwin R., Capasso G., Pesic V., Massy Z., Wagner C.A., Andrade A., Bachmann M., Bumblyte I., Constantin Covic A., Engvig A., Fouque D., Franssen C., Gesualdo L., Goumenos D., Mani L.-Y., Marti H.-P., Mayer C., Rroji Molla M., Sakkas G., Stevens K., Vazelov E., Viggiano D., Zacharia L., Wanner C., Nitsch D., Fridolin I., Romeo M.J.S., Batinić B., Carrasco L., Gansevoort R., Martino G., Nistor I., Ortiz A., Rastenytė D., Stefan G., Tedeschi G., Bikbov B., Endlich K.H., Kurganaite J., Perico N., Remuzzi G., Blankestijn P., Eckardt K.-U., Fliser D., Konig M., Rychlik I., Deleidi M., Reusz G., Farisco M., Capolongo G.

AUTHOR FULL NAMES: Imenez Silva, Pedro H. (57985674000); Pepin, Marion (54399176200); Figurek, Andreja (56461356800); Gutiérrez-Jiménez, Eugenio (55949968200); Bobot, Mickaël (56993660000); Iervolino, Anna (55862774400); Mattace-Raso, Francesco (57189064149); Hoorn, Ewout J. (6508158988); Bailey, Matthew A. (35556471900); Hénaut, Lucie (55416776100); Nielsen, Rikke (7202361379); Frische, Sebastian (6603308740); Trepiccione, Francesco (9276633500); Hafez, Gaye (9736856000); Altunkaynak, Hande O. (55782609800); Endlich, Nicole (6603257929); Unwin, Robert (8234615900); Capasso, Giovambattista (35599101500); Pesic, Vesna (57194109901); Massy, Ziad (7005894966); Wagner, Carsten A. (7402148810); Andrade, Alexandre (57739006100); Bachmann, Maie (10839689300); Bumblyte, Inga (12778984200); Constantin Covic, Adrian (59170944300); Engvig, Andreas (35956134800); Fouque, Denis (7005189618); Franssen, Casper (7003868264); Gesualdo, Loreto (54938105400); Goumenos, Dimitrios (6603709366); Mani, Laila-Yasmin (36619111200); Marti, Hans-Peter (35964694300); Mayer, Christopher (56369286100); Rroji Molla, Merita (55556230700); Sakkas, Giorgos (6603161958); Stevens, Kate (35756668600); Vazelov, Evgueniy (6602627872); Viggiano, Davide (55944068400); Zacharia, Lefteris (6701756552); Wanner, Christoph (57212349814); Nitsch, Dorothea (10243870600); Fridolin, Ivo (6602274673); Romeo, Maria José Soler (57556241800); Batinić, Bojan (55547179600); Carrasco, Laura (57202943514); Gansevoort, Ron (57197562298); Martino, Gianvito (35399805500); Nistor, Ionut (55402421000); Ortiz, Alberto (7201911399); Rastenytė, Daiva (6701366547); Stefan, Gabriel (56054664500); Tedeschi, Gioacchino (7102955116); Bikbov, Boris (57219957158); Endlich, Karl Hans (57203952994); Kurganaite, Justina (57416581000); Perico, Norberto (57220168045); Remuzzi, Giuseppe (56466188600); Blankestijn, Peter (7006397092); Eckardt, Kai-Uwe (57217193173); Fliser, Danilo (7005165997); Konig, Maximilian (57193457273); Rychlik, Ivan (18344680300); Deleidi, Michela (8613948600); Reusz, George (57739832300); Farisco, Michele (37080384900); Capolongo, Giovanna (54411964700)

57985674000; 54399176200; 56461356800; 55949968200; 56993660000; 55862774400; 57189064149; 6508158988; 35556471900; 55416776100; 7202361379; 6603308740; 9276633500; 9736856000; 55782609800; 6603257929; 8234615900; 35599101500; 57194109901; 7005894966; 7402148810; 57739006100; 10839689300; 12778984200; 59170944300; 35956134800; 7005189618; 7003868264; 54938105400; 6603709366; 36619111200; 35964694300; 56369286100; 55556230700; 6603161958; 35756668600; 6602627872; 55944068400; 6701756552; 57212349814; 10243870600; 6602274673; 57556241800; 55547179600; 57202943514; 57197562298; 35399805500; 55402421000; 7201911399; 6701366547; 56054664500; 7102955116; 57219957158; 57203952994; 57416581000; 57220168045; 56466188600; 7006397092; 57217193173; 7005165997; 57193457273; 18344680300; 8613948600; 57739832300; 37080384900; 54411964700

Animal models to study cognitive impairment of chronic kidney disease

(2024) American Journal of Physiology - Renal Physiology, 326 (6), pp. F894 - F916, Cited 1 times.

DOI: 10.1152/ajprenal.00338.2023

https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-85194112846&doi=10.1152%2fajprenal.00338.2023&partnerID=40&md5=c556555aec3bb647fe4a9dbe7752bc61

Viggiano D., Capasso G.

AUTHOR FULL NAMES: Viggiano, Davide (55944068400); Capasso, Giovambattista (35599101500)

55944068400; 35599101500

How much time does it take to get cognitive impairment in kidney disease?

(2022) Nephrology Dialysis Transplantation, 37 (2), pp. 203 - 204, Cited 1 times.

DOI: 10.1093/ndt/gfab220

https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-85123877692&doi=10.1093%2fndt%2fgfab220&partnerID=40&md5=94d9c669aec7358e04b404fbc3ff44d9

Javaid U., Afroz S., Ashraf W., Saghir K.A., Alqahtani F., Anjum S.M.M., Ahmad T., Imran I.

AUTHOR FULL NAMES: Javaid, Usman (57219663243); Afroz, Syeda (12769150800); Ashraf, Waseem (58564789900); Saghir, Khaled Ahmed (57219666704); Alqahtani, Faleh (57199056965); Anjum, Syed Muhammad Muneeb (35110456800); Ahmad, Tanveer (57195283965); Imran, Imran (43861460900)

57219663243; 12769150800; 58564789900; 57219666704; 57199056965; 35110456800; 57195283965; 43861460900

Ameliorative effect of Nyctanthes arbor-tristis L. by suppression of pentylenetetrazole-induced kindling in mice: An insight from EEG, neurobehavioral and in-silico studies

(2024) Biomedicine and Pharmacotherapy, 175, art. no. 116791, Cited 2 times.

DOI: 10.1016/j.biopha.2024.116791

https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-85193618112&doi=10.1016%2fj.biopha.2024.116791&partnerID=40&md5=d51736c8d778b7209262dd390ea29e31

Vavrincová D. "Indolamín 2,3-dioxygenáza - nový prístup v terapii fibrotických ochorení." APVV-23-0399

– zodpovedný riešiteľ

Fibróza môže postihnúť akýkoľvek orgán a v konečnom dôsledku je zodpovedná až za 45 % všetkých úmrtí. I keď každý druh orgánovej fibrózy má svoje špecifická, jej základné znaky sú rovnaké. Dochádza k aktivácii, či proliferácii rezidentných fibroblastov, ktoré produkujú kolagén a ECM. Okrem toho dochádza aj k premene epiteliálnych buniek orgánov na fibroblasty cez EMT, ktoré ďalej prispievajú k fibróze. Naše publikované práce a najnovšie aj preliminárne dáta poukazujú, že na fibróze sa podieľa aj IDO. IDO metabolizuje tryptofán, no podieľa sa aj na viacerých patológiách, či v iných hrá ochrannú úlohu. Účinky IDO nie sú plne preskúmané, preto hlavným cieľom nášho projektu je komplexne preskúmať úlohu IDO v terapii fibrózy obličky, pečene a srdca. Jednotlivé ciele projektu pozostávajú z in vitro a in vivo experimentov. Na in vitro experimentoch plánujeme skúmať presné mechanizmy účinku na hlavné znaky aktivácie fibroblastov, EMT premenu epiteliálnych buniek na fibroblasty, či zapojenie jednotlivých profibrotických signálnych dráh. Typy buniek, ktoré plánujeme v in vitro experimentoch použiť budú korešpondovať s jednotlivými orgánmi. Plánujeme skúmať IDO inhibíciu (1 metyltryptofán – 1-MT, génový KO, či silencing), overexpresiu IDO a pôsobenie produktov metabolizmu IDO (kynurenín, Kyn a kynurenínová kyselina, Kyna). V in vivo budeme skúmať vplyv na fibrózu obličky, pečene a srdca. Ako model fibrózy pečene použijeme model podávania CCl4, obličky model unilaterálnej obštrukcie urétra a srdca daunorubicínový model. Liečba bude pozostávať z podávania 1-MT, alebo Kyna. Keďže v našej predošlej publikácii sme okrem iného ukázali, že inhibítor IDO 1-MT má mnoho nešpecifických účinkov, preto použijeme aj IDO KO myši na preskúmanie IDO (ne)špecifického antifibrotického účinku látok. Výsledky tohto projektu by mohli viesť k novým antifibrotickým látkam, ktoré by pomohli pacientom s fibrózou, keďže jej terapia je v dnešnej dobe veľmi limitovaná, alebo takmer žiadna.

Vavrincová D. „Antifibrotický potenciál kynurenínovej kyseliny.“ 1/0513/24

– zodpovedný riešiteľ

Fibróza patrí medzi chabo riešiteľný medicínsky problém. I keď ide o rozšírené ochorenie ktoré zasahuje takmer každý orgán, efektívna terapia nejestvuje. Momentálne dostupné liečivá majú totiž veľmi obmedzenú indikáciu a v neposlednom rade aj nežiadúce účinky. Kynurenínová kyselina (KYNA) patrí medzi metabolity enzýmu indolamín 2,3-dioxygenázy (IDO). Skúmaním terapeutického efektu IDO v rôznych ochoreniach sa zaoberáme už dlho, v poslednej dobe sa však stále viac sústreďujeme na jeho antifibrotický potenciál, za ktorým podľa našich preliminárnych dát môže stáť práve KYNA. Toto je i v súlade s najnovšími poznatkami. Navyše sa zdá, že KYNA je úplne bezpečná a netoxická látka. Toto všetko z nej činí vhodného kandidáta v terapii fibrózy. V predkladanom projekte teda plánujeme skúmať antifibrotický účinok KYNA na viacerých in vitro ako aj aj in vivo fibrotických modeloch. Nádejame sa, že prinesieme úplne nové poznatky na poli antifibrotickej terapie, čím trocha prispejeme k riešeniu tohto zložitého problému.

Vavrincová D. „Interferencia s metabolizmom indolamín 2,3-dioxygenázy ako nová terapeutická stratégia fibrotických ochorení.“ 1/0027/20

– zodpovedný riešiteľ

Takmer polovica úmrtí v industrializovanom svete je výsledkom komplikácií súvisiacich s fibroproliferatívnymi ochoreniami. Fibróza postihuje každý orgán, a i keď niektoré znaky fibrózy sa líšia v závislosti od postihnutého tkaniva, základné črty všetkých fibrotických ochorení sú rovnaké. Napriek enormnému impaktu fibrózy na ľudské zdravie doteraz nejestvuje efektívna terapia a/alebo terapeutický prístup, zasahujúcu do mechanizmu fibrózy. V poslednej dobe sa ukazuje, že enzým indolamín 2,3 dioxygenáza (IDO) hrá úlohu práve pri fibróze, čo je i v súlade s našimi preliminárnymi dátami. IDO je vhodným kandidátom terapie fibrózy, pretože by mohla ovplyvňovať fibrózu komplexne, na rôznych úrovniach jej mechanizmu, i v rôznych orgánoch/tkanivách. V tomto projekte preto sledujeme vplyv viaceré aspekty metabolizmu IDO na rôzne modely fibrózy in vitro aj in vivo, s cieľom nájsť optimálnu stratégiu terapie fibrotických ochorení, ako i objasniť doteraz nejasné mechanizmy fibrózy na molekulárnej úrovni.

Vavrinec P. „Úloha opravy DNA v bunkovej senescencii v kontexte ochorení kardiovaskulárneho systému a obličiek“ VEGA 1/0121/22

– zástupca zodpovedného riešiteľa

Starnutie je spojené s výskytom viacerých ochorení. Medzi tieto ochorenia patria najmä ochorenia kardiovaskulárneho systému i obličiek. Bunková senescencia je charakterizovaná ireverzibilným zastavením delenia buniek a sprevádza proces starnutia. Poškodenie DNA je jeden zo spúšťačov senescencie, ku ktorej dochádza ak bunka nedokáže opraviť poškodenú DNA. Práve akumulácia poškodenej DNA predstavuje jednu z teórií fenoménu starnutia a senescencie. Metylguanín-metyltransferáza (MGMT) sa podieľa na oprave poškodenej DNA. Úloha MGMT v senescencii nebola doteraz skúmaná a naše preliminárne výsledky poukazujú, že tu môže hrať významnú úlohu. Náš nový projekt bude prínosom hlavne v oblasti cievnej dysfunkcie a obličkových ochorení súvisiacich s vyšším vekom, ale taktiež môže odhaliť nežiaduce účinky terapie inhibítormi MGMT, ktoré sa používajú terapii rakoviny. Tento projekt by mohol navyše viesť k objaveniu nového modelu bunkovej senescencie, čo by bolo osožné pri vývoji nových liečiv.