Zvarík, M., Martinický, D., Hunáková, Ľ., Lajdová, I., Šikurová, L. (2013). Fluorescence characteristics of human urine from normal individuals and ovarian cancer patients. Neoplasma. Vol 60, No. 5, s. 533-537. 

Šikurová, L., Bališ, P., Zvarík, M. (2011). Penetration of laser light through red blood cell ghosts. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology. Vol. 103, No. 3, s. 230-233. 

Lešková, A., Zvarík, M., Araya, T., Giehl, R. (2019). Nickel Toxicity Targets Cell Wall-Related Processes and PIN2-Mediated Auxin Transport to Inhibit Root Elongation and Gravitropic Responses in Arabidopsis. Plant & cell physiology., Vol 61, No. 3, s. 519-535.

Zvarík, M., Martinický, D., Hunáková, Ľ., Šikurová, L. 2015, "Differences in pteridine urinary levels in patients with malignant and benign ovarian tumors in comparison with healthyindividuals", Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, vol. 153, pp. 191-197.

Kollárik, B., Zvarík, M., Bujdák, P., Weibl, P., Rybár, L., Šikurová, L., Hunáková, Ľ. (2018). Urinary fluorescence analysis in diagnosis of bladder cancer. Neoplasma. Vol. 65., No. 2, s. 234-241.

Džubinská, D., Zvarík, M., Kollárik, B., Šikurová, L. 2021. "Multiple Chromatographhic Analysis of Urine in the Detection of Bladder Cancer", Diagnostics 2021, 11(10), 1793.

Šutý, Š., Oravczová, V., Garaiová, Z., Šubjaková, V., Ionov, M., Shcharbin, D., Šimoníková, Z., Bartek, P., Zvarík, M., Shi, X., Mignani, S., Majoral, J., Bryszewska, M., Hianik, T., Waczulikova, I. (2021). Blood Compatibility of Amphiphilic Phosphorous Dendrons—Prospective Drug Nanocarriers. Biomedicines. Vol 9, No. 11, s. 1-13.

Lešková, A., Zvarík, M., Araya, T., Giehl, R. (2019). Nickel Toxicity Targets Cell Wall-Related Processes and PIN2-Mediated Auxin Transport to Inhibit Root Elongation and Gravitropic Responses in Arabidopsis. Plant & cell physiology., Vol 61, No. 3, s. 519-535.

Majerová, K., Zvarík, M., Ricon-Becker, I., Hanalis-Miller, T., Mikolášková, I., Bella, V., Mravec, B., Hunáková, Ľ. (2022) Increased sympathetic modulation in breast cancer survivors determined by measurement of heart rate variability. Scientific reports. 12(1), art. no. 1466 (s. [1-10]).

Zvarík, M., Waczulíková a kol. (2022). Experimentálne metódy biofyziky a lekárskej fyziky. Univerzita Komenského v Bratislave, 419 s. ISBN 978-80-8147-128-5

Stafford N., Wilson C., Oceandy D., Neyses L., Cartwright E.J.(2017) The plasma membrane calcium ATPases and their role as major new players in human disease. Physiological Reviews, 97 (3), pp. 1089 - 1125; SCI, SCOPUS (IF 49,5).

Jordaens S., Zwaenepoel K., Tjalma W., Deben C., Beyers K., Vankerckhoven V., Pauwels P., Vorsters A. (2023) Urine biomarkers in cancer detection: A systematic review of preanalytical parameters and applied methods. International Journal of Cancer, 152 (10), pp. 2186 - 2205; SCI; SCOPUS (IF 15,2)

Atta N., Shahbaz M., Farhat F., Maqsood M.F., Zulfiqar U., Naz N., Ahmed M.M., Hassan N.U., Mujahid N., Mustafa A.E.-Z.M.A., Elshikh M.S., Chaudhary T. (2024) Proline-mediated redox regulation in wheat for mitigating nickel-induced stress and soil decontamination. Scientific Reports, 14 (1), art. no. 456; SCI ; SCOPUS (IF 7,5)

Zhao X., Zheng W., Qin T., Du X., Lei Y., Lv T., Zhou M., Xu Z., Wang L., Liu B., Peng X. (2022) An anti-interference fluorescent probe for point-of-care diagnosis of albuminuria. Sensors and Actuators B: Chemical, 351, art. no. 130980; SCI; SCOPUS (IF 15)

Liu B., Zhao X., Zhou M., Song C., Zeng C., Qin T., Zhang M., Xu Z. (2022) Modulating donor of dicyanoisophorone-based fluorophores to detect human serum albumin with NIR fluorescence. Spectrochimica Acta - Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 268, art. no. 120666; SCI ; SCOPUS (IF 7,1)

BIOCARD - Bioenergetická a proteomická diagnostika v kardioprotekcii: efektívny nástroj v sledovaní regulácie mitochondriálnych signalizačných dráh (vedúci projektu FMFI UK). Podmienky s obmedzeným prístupom kyslíka významne zvyšujú energetické nároky myokardu. Nástupmechanizmov kompenzácie účinných voči tejto poruche sa spája s reguláciou na úrovni srdcových mitochondrií.Práve mitochondriálna dysfunkcia predstavuje v súčasnosti cieľ terapeutickej kardioprotektívnej stratégie,efektívnej voči energetickej a dynamickej dysbalancii myokardu. Kľúčovým aspektom predkladaného výskumu jezabezpečiť energetické požiadavky srdca v podmienkach zvýšených energetických nárokov zapríčinenýchzníženou utilizáciou kyslíka a ischemickou chorobou srdca v spojení s kardioprotektívnymi intervenciami v podobefarmakologického, remote ischemického a hypoxického preconditioningu. V oblasti kardiovaskulárneho výskumumá sľubný potenciál využitie moderných metodických prístupov, ktoré poskytujú komplexný prehľad o reguláciisignálnych dráh mitochondriálnych proteínov, dynamiky proteómu a metabolómu srdca a mitochondrií. Práveidentifikácia biologicky relevantných zmien v proteín-proteínových interakciách môže byť veľkým prínosom priobjasnení signálnych dráh v procesoch kardioprotekcie. Rovnako budú identifikované zmeny na úrovni komplexovdýchacieho reťazca mitochondrií, ktoré predstavujú účinný spôsob zachovania energetickej rovnováhy. Jedným zdôležitých mechanizmov kardioprotekcie je inhibícia otvárania mitochondriálnych pórov prechodnej permeability(mPTP). V súčasnosti je diskutovaná zväčša regulácia mPTP na úrovni zmien jednotlivých proteínov. Našimcieľom bude navyše objasniť vzájomné interakcie proteínov, ktoré vedú k protektívnej modulácii mPTP. V súvislostis remodeláciou mitochondriálnej funkcie bude sledovaná vápniková homeostáza a signalizácia voľnýchkyslíkových radikálov. Predkladaný projekt sa bude zaoberať stimuláciou adaptačných procesov s úmyslomprispieť k eliminácii mitochondriálnej dysfunkcie a zabezpečiť udržanie dynamickej rovnováhy v podmienkachenergetickej deficiencie srdca. [APVV-22-0264]

Zníženou spotrebou kyslíka regulovaná bioenergetika srdcových mitochondrií: Hĺbková proteomická analýza signálnych kardioprotektívnych dráh (vedúci projektu FMFI UK). Znížená utilizácia kyslíka významne zvyšuje energetické nároky myokardu. Nástup mechanizmov kompenzácie účinných voči tejto závažnej metabolickej poruche sa spája s reguláciou na úrovni srdcových mitochondrií. Práve mitochondriálna dysfunkcia predstavuje v súčasnosti cieľ terapeutickej kardioprotektívnej stratégie, efektívnej voči energetickej a dynamickej dysbalancii. Súčasťou identifikácie preconditioningom indukovaných adaptačných procesov bude sledovanie úlohy mitochondrií na redoxnej rovnováhe, signalizácii voľných kyslíkových radikálov, zmien oxidačnej fosforylácie a energetických dráh, dynamiky mitochondrií a iónovej homeostázy. Definícia hypoxického poškodenia, účinku preconditioningu a určenie potenciálneho nosiča kardioprotektívneho signálu bude indikovaná prostredníctvom proteomických a metabolomických analýz metódou LC-MS. Komplexná analýza poskytne detailné informácie o zmenách na úrovni proteínov ako potenciálnych markerov a zároveň charakteristiku ich signálnych dráh. [VEGA 2/0016/23]

Diagnostický potenciál monitorovania fluorescenčných charakteristík telových tekutín a analýza extracelulárnych mikrovezikúl u nádorových ochorení urogenitálneho systému (vedúci projektu). Projekt sa zameriava na detekciu metabolitov krvného séra a moču, ktoré môžu byť potencionálne spojené s procesom neoplázie, s cieľom poskytnúť nový smer v súčasnom hľadaní prediktívnych markerov nádorových ochorení. K fundamentálnym cieľom projektu preto patrí predovšetkým zmapovanie fluorescenčných charakteristík moču a krvného séra pre ich potenciál na využitie v diagnostike a skríningu nádorových ochorení. Pomocou moderných separačných a fluorescenčných techník bude stanovený tzv. metabolický „fingerprint“ moču a krvného séra zdravých dobrovoľníkov a pacientov s rakovinou močového mechúra, prostaty, semenníkov a obličky. Pre maximalizáciu využitia daných médií, je projekt zameraný aj na izoláciu a analýzu extracelulárnych mikrovezikúl prítomných v biologických vzorkách (tzv. exosome-like vesicles). V prostredí moderných viacrozmerných štatistických metód prebehnú všetky analýzy získaných dát, ktoré následne poslúžia na selekciu najvhodnejších parametrov - potenciálnych biomarkerov. [VEGA - 0136/18]

Analýza interakcie medzi amfifilnými dendrónmi a biologickými systémami (spoluriešiteľ). V posledných desaťročiach chemici vyvíjajú nové prístupy k syntéze funkčných nanoštruktúr s aplikáciami v cielenej terapii, ako sú dendriméry - polyméry s vysokorozvetvenou štruktúrou. Snaha o čo najvyššiu biokompatibilitu, netoxicitu a selektivitu absorpcie v cieľových bunkách viedla k syntéze a štúdiu rôznych typov dendrimérov. Jednou z týchto úspešných modifikácií je kombinácia výhod dendritickej štruktúry s vlastnosťami lipidov. V navrhovanom projekte budeme pomocou rôznych biofyzikálnych metód študovať niekoľko chemicky optimalizovaných dendrónov amfifilného charakteru a obsahujúcich fosfor, ako platformu na dopravu antiapoptotickej malej interferujúcej RNA (siRNA). Nevyhnutným krokom pred ďalším skúmaním biomedicínskych aplikácií je posúdenie ich biokompatibility. Zámerom projektu je preto získať relevantné poznatky podložené experimentálnymi nálezmi o povahe interakcie originálne syntetizovaných amfifilných dendritických blokov a ich agregátov s biologickými systémami na rôznych úrovniach organizácie, molekulárnej (s proteínami plazmy), supramolekulárnej (biomembrány a modelové membrány), bunkovej (izolované erytrocyty a trombocyty), ako aj na úrovni tkaniva (krv ako fluidné spojivové tkanivo). Domnievame sa, že nové poznatky o mechanizmoch interakcií amfifilných dendrónov s biologickými systémami napomôžu výskum cielenej dopravy liečiv a ďalších aplikácií v oblasti nanomedicíny. Oba tímy, disponujú vo svojich laboratóriách celou škálou moderných a vysokovýkonných biofyzikálnych metód, ktoré umožnia realizovať projektové úlohy, úspešne riešiť plánované ciele a vybrať nanoštruktúry vhodné pre ďalšie štúdium ako potenciálne nevírusové vektory pre génovú terapiu. Medzi priority projektu patrí aj vzájomná spolupráca medzi bieloruským a slovenským tímom v rámci spoločných a nadväzujúcich experimentov, prípravy spoločných publikácií, organizovaní spoločných seminárov a workshopov. [APVV_SK-BY-RD-19-0019]

Strengthening and spreading international partnership activities of the Faculty of Biology and Environmental Protection for interdisciplinary research and innovation of the University of Lodz (spoluriešiteľ). The aim of the project is to strengthen the international partnership of the Faculty of Biology and Environmental Protection of the University of Lodz by preparing a consortium partnership to submit a competitive application to the Horizon 2020 program dedicated to innovative interdisciplinary and cross-sectoral PhD studies in the Maria Skłodowska-Curie call for proposal. [NAWA EUROPARTNER (Poľsko)]