I. - Základné údaje

I.1 - Priezvisko

Gafurov

I.2 - Meno

Askar

I.3 - Tituly

Mgr., PhD.

I.4 - Rok narodenia

1994

I.5 - Názov pracoviska

Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave

I.6 - Adresa pracoviska

Mlynská dolina F1 842 48 Bratislava

I.7 - Pracovné zaradenie

odborný asistent

I.8 - E-mailová adresa

askar.gafurov@fmph.uniba.sk

I.9 - Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl

https://www.portalvs.sk/regzam/detail/45714

I.10 - Názov študijného odboru, v ktorom osoba pôsobí na vysokej škole

Informatika

I.11 - ORCID iD

0009-0006-5270-831X

II. - Vysokoškolské vzdelanie a ďalší kvalifikačný rast

II.1 - Vysokoškolské vzdelanie prvého stupňa

II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie

Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave

II.b - Rok

2016

II.c - Odbor a program

Informatika

II.2 - Vysokoškolské vzdelanie druhého stupňa

II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie

Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave

II.b - Rok

2018

II.c - Odbor a program

Informatika

II.3 - Vysokoškolské vzdelanie tretieho stupňa

II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie

Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave

II.b - Rok

2022

II.c - Odbor a program

Informatika

II.4 - Titul docent

II.5 - Titul profesor

II.6 - Titul DrSc.

III. - Súčasné a predchádzajúce zamestnania

III.a - Zamestnanie-pracovné zaradenie	III.b - Inštitúcia	III.c - Časové vymedzenie
odborný asistent	Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave	2022-súčasnosť
výskumný prácovník	Vedecký park, Univerzita Komenského v Bratislave	2022-2023
výskumný prácovik	LIRMM, Montpellier, Francúzsko	2024-súčasnosť

IV. - Rozvoj pedagogických, odborných, jazykových, digitálnych a iných zručností

V. - Prehľad aktivít v rámci pedagogického pôsobenia na vysokej škole

V.1 - Prehľad zabezpečovaných profilových študijných predmetov v aktuálnom akademickom roku podľa študijných programov

V.2 - Prehľad o zodpovednosti za uskutočňovanie, rozvoj a zabezpečenie kvality študijného programu alebo jeho časti na vysokej škole v aktuálnom akademickom roku

V.3 - Prehľad o zodpovednosti za rozvoj a kvalitu odboru habilitačného konania a inauguračného konania v aktuálnom akademickom roku

V.4 - Prehľad vedených záverečných prác

V.4.1 - Počet aktuálne vedených prác

V.4.2 - Počet obhájených prác

V.4.a - Bakalárske (prvý stupeň)

V.5 - Prehľad zabezpečovaných ostatných študijných predmetov podľa študijných programov v aktuálnom akademickom roku

VI. - Prehľad výsledkov tvorivej činnosti

VI.1 - Prehľad výstupov tvorivej činnosti a ohlasov na výstupy tvorivej činnosti

VI.1.1 - Počet výstupov tvorivej činnosti

VI.1.a - Celkovo

VI.1.b - Za posledných šesť rokov

VI.1.2 - Počet výstupov tvorivej činnosti registrovaných v databázach Web of Science alebo Scopus

VI.1.a - Celkovo

VI.1.b - Za posledných šesť rokov

VI.1.3 - Počet ohlasov na výstupy tvorivej činnosti

VI.1.a - Celkovo

VI.1.b - Za posledných šesť rokov

VI.1.4 - Počet ohlasov registrovaných v databázach Web of Science alebo Scopus na výstupy tvorivej činnosti

VI.1.a - Celkovo

VI.1.b - Za posledných šesť rokov

VI.1.5 - Počet pozvaných prednášok na medzinárodnej a národnej úrovni

VI.2 - Najvýznamnejšie výstupy tvorivej činnosti

Brejová, B., Boršová, K., Hodorová, V., Čabanová, V., Gafurov, A., Fričová, D., Neboháčová, M., Vinař, T., Klempa, B. and Nosek, J., 2021. Nanopore sequencing of SARS-CoV-2: Comparison of short and long PCR-tiling amplicon protocols. PLoS One, 16(10), p.e0259277.

Brejová, B., Gafurov, A., Pardubská, D., Sabo, M., & Vinař, T. (2017). Isometric gene tree reconciliation revisited. Algorithms for Molecular Biology, 12(1), 1-16.

Gafurov, A., Vinař, T., Medvedev, P., Brejová, B. (2024). Efficient Analysis of Annotation Colocalization Accounting for Genomic Contexts. In: Ma, J. (eds) Research in Computational Molecular Biology. RECOMB 2024. Lecture Notes in Computer Science, vol 14758. Springer, Cham.

Gafurov, A., Baláž, A., Amman, F., Boršová, K., Čabanová, V., Klempa, B., Bergthaler, A., Vinař, T. and Brejová, B., 2022. VirPool: model-based estimation of SARS-CoV-2 variant proportions in wastewater samples. BMC bioinformatics, 23(1), p.551.

Gafurov, A., Brejová, B. and Medvedev, P., 2022. Markov chains improve the significance computation of overlapping genome annotations. Bioinformatics, 38(Supplement_1), pp.i203-i211.

VI.3 - Najvýznamnejšie výstupy tvorivej činnosti za ostatných šesť rokov

Gafurov, A., Vinař, T., & Brejová, B. (2021, July). Probabilistic Models of k-mer Frequencies. In Conference on Computability in Europe (pp. 227-236). Springer, Cham.

Gafurov, A., Brejová, B. and Medvedev, P., 2022. Markov chains improve the significance computation of overlapping genome annotations. Bioinformatics, 38(Supplement_1), pp.i203-i211.

VI.4 - Najvýznamnejšie ohlasy na výstupy tvorivej činnosti

Liao, Y.-C., Chen, F.-J., Chuang, M.-C., (...), Yu, G.-Y., Huang, T.-S. (2022) High-Integrity Sequencing of Spike Gene for SARS-CoV-2 Variant Determination. International Journal of Molecular Sciences 23(6), 3257

Sugi, T., Rahman, M., Rahim, R., (...), Hayashida, K., Yamagishi, J. (2022) COVID-19 Whole-Genome Resequencing with Redundant Tiling PCR and Subtract-Based Amplicon Normalization Successfully Characterized SARS-CoV-2 Variants in Clinical Specimens, Interdisciplinary Perspectives on Infectious Diseases 2022,2109641

Vacca, D., Fiannaca, A., Tramuto, F., (...), Tripodo, C., Urso, A. (2022) Direct RNA Nanopore Sequencing of SARS-CoV-2 Extracted from Critical Material from Swabs, Life 12(1), 69

Li, L., Comi, T.J., Bierman, R.F. and Akey, J.M., 2024. Recurrent gene flow between Neanderthals and modern humans over the past 200,000 years. Science, 385(6705), p.eadi1768.

VI.5 - Účasť na riešení (vedení) najvýznamnejších vedeckých projektov alebo umeleckých projektov za posledných šesť rokov

Pan-genome Graph Algorithms and Data Integration (Algoritmy a integrácia dát pre grafy pangenómov), H2020 872539, PANGAIA

Alternative Representations of Big Genomic Data (Broňa Brejová), VEGA 1/0463/20

Non-conventional applications of emerging sequencing technologies in comparative and functional genomics (Nekonvenčné aplikácie nových sekvenačných technológií v komparatívnej a funkčnej genomike) (Jozef Nosek, Tomáš Vinař), APVV-18-0239

VII. - Prehľad aktivít v organizovaní vysokoškolského vzdelávania a tvorivých činností

VIII. - Prehľad zahraničných mobilít a pôsobenia so zameraním na vzdelávanie a tvorivú činnosť v študijnom odbore

VIII.a - Názov inštitúcie	VIII.b - Sídlo inštitúcie	VIII.c - Obdobie trvania pôsobenia/pobytu (uviesť dátum odkedy dokedy trval pobyt)	VIII.d - Mobilitná schéma, pracovný kontrakt, iné (popísať)
Pennsylvania State University	Pensylvania, Spojené štáty americké	október 2021 - február 2022	Vyskumný pobyt
postdoktorandský pobyt	LIRMM, Montpellier, Francúzsko	2024-súčastnosť

IX. - Iné relevantné skutočnosti

Dátum poslednej aktualizácie

2025-01-23

Meno a priezvisko:	Mgr. Askar Gafurov, PhD.
Typ dokumentu:	Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
Názov vysokej školy:	Univerzita Komenského v Bratislave
Sídlo vysokej školy:	Šafárikovo námestie 6, 818 06 Bratislava