Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
Meno a priezvisko:
Mgr. Vladimír Boža, PhD.
Typ dokumentu:
Vedecko/umelecko-pedagogická charakteristika osoby
Názov vysokej školy:
Univerzita Komenského v Bratislave
Sídlo vysokej školy:
Šafárikovo námestie 6, 818 06 Bratislava

I. - Základné údaje

I.1 - Priezvisko
Boža
I.2 - Meno
Vladimír
I.3 - Tituly
Mgr., PhD.
I.4 - Rok narodenia
1989
I.5 - Názov pracoviska
Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave
I.6 - Adresa pracoviska
Mlynská dolina F1 842 48 Bratislava
I.7 - Pracovné zaradenie
Odborný asistent
I.8 - E-mailová adresa
boza1@uniba.sk
I.9 - Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl
https://www.portalvs.sk/regzam/detail/28543?do=filterForm-submit&name=Vladim%C3%ADr&surname=Bo%C5%BEa&sort=surname&employment_state=yes&filter=Vyh%C4%BEada%C5%A5
I.10 - Názov študijného odboru, v ktorom osoba pôsobí na vysokej škole
Informatika
I.11 - ORCID iD
0000-0002-0618-1557

II. - Vysokoškolské vzdelanie a ďalší kvalifikačný rast

II.1 - Vysokoškolské vzdelanie prvého stupňa
II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie
Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave
II.b - Rok
2011
II.c - Odbor a program
Informatika
II.2 - Vysokoškolské vzdelanie druhého stupňa
II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie
Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave
II.b - Rok
2013
II.c - Odbor a program
Informatika
II.3 - Vysokoškolské vzdelanie tretieho stupňa
II.a - Názov vysokej školy alebo inštitúcie
Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave
II.b - Rok
2017
II.c - Odbor a program
Informatika
II.4 - Titul docent
II.5 - Titul profesor
II.6 - Titul DrSc.

III. - Súčasné a predchádzajúce zamestnania

III.a - Zamestnanie-pracovné zaradenie III.b - Inštitúcia III.c - Časové vymedzenie
Odborný asistent Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave 2017 - doteraz

IV. - Rozvoj pedagogických, odborných, jazykových, digitálnych a iných zručností

IV.a - Popis aktivity, názov kurzu (ak išlo o kurz), iné IV.b - Názov inštitúcie IV.c - Rok
Angličtina Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave 2008

V. - Prehľad aktivít v rámci pedagogického pôsobenia na vysokej škole

V.1 - Prehľad zabezpečovaných profilových študijných predmetov v aktuálnom akademickom roku podľa študijných programov
V.2 - Prehľad o zodpovednosti za uskutočňovanie, rozvoj a zabezpečenie kvality študijného programu alebo jeho časti na vysokej škole v aktuálnom akademickom roku
V.3 - Prehľad o zodpovednosti za rozvoj a kvalitu odboru habilitačného konania a inauguračného konania v aktuálnom akademickom roku
V.4 - Prehľad vedených záverečných prác
V.4.1 - Počet aktuálne vedených prác
V.4.a - Bakalárske (prvý stupeň)
0
V.4.b - Diplomové (druhý stupeň)
5
V.4.c - Dizertačné (tretí stupeň)
0
V.4.2 - Počet obhájených prác
V.4.a - Bakalárske (prvý stupeň)
5
V.4.b - Diplomové (druhý stupeň)
4
V.4.c - Dizertačné (tretí stupeň)
0
V.5 - Prehľad zabezpečovaných ostatných študijných predmetov podľa študijných programov v aktuálnom akademickom roku
V.5.a - Názov predmetu V.5.b - Študijný program V.5.c - Stupeň V.5.d - Študijný odbor
Princípy dátovej vedy Dátová Veda I. informatika
Manažment dát Dátová Veda I. informatika
Rýchlostné programovanie (1) Informatika I. informatika
Rýchlostné programovanie (2) Informatika I. informatika
Rýchlostné programovanie (3) Informatika I. informatika
Rýchlostné programovanie (4) Informatika I. informatika
Rýchlostné programovanie (5) Informatika I. informatika
Moderné techniky strojového učenia Informatika II. informatika
Strojové učenie Informatika II. informatika

VI. - Prehľad výsledkov tvorivej činnosti

VI.1 - Prehľad výstupov tvorivej činnosti a ohlasov na výstupy tvorivej činnosti
VI.1.1 - Počet výstupov tvorivej činnosti
VI.1.a - Celkovo
35
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
28
VI.1.2 - Počet výstupov tvorivej činnosti registrovaných v databázach Web of Science alebo Scopus
VI.1.a - Celkovo
20
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
14
VI.1.3 - Počet ohlasov na výstupy tvorivej činnosti
VI.1.a - Celkovo
638
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
516
VI.1.4 - Počet ohlasov registrovaných v databázach Web of Science alebo Scopus na výstupy tvorivej činnosti
VI.1.a - Celkovo
334
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
284
VI.1.5 - Počet pozvaných prednášok na medzinárodnej a národnej úrovni
VI.1.a - Celkovo
1
VI.1.b - Za posledných šesť rokov
1
VI.2 - Najvýznamnejšie výstupy tvorivej činnosti
1

Boža, V., Brejová, B., & Vinař, T. (2017). DeepNano: deep recurrent neural networks for base calling in MinION nanopore reads. PloS one, 12(6), e0178751.

2

Kvapilova, L., Boza, V., Dubec, P., Majernik, M., Bogar, J., Jamison, J., ... & Karlin, D. R. (2019). Continuous sound collection using smartphones and machine learning to measure cough. Digital biomarkers, 3(3), 166-175.

3

Boža, V., Perešíni, P., Brejová, B., & Vinař, T. (2020). DeepNano-blitz: a fast base caller for MinION nanopore sequencers. Bioinformatics, 36(14), 4191-4192.

4

Boža, Vladimír, and Vladimír Macko. "Two Sparse Matrices are Better than One: Sparsifying Neural Networks with Double Sparse Factorization." In The Thirteenth International Conference on Learning Representations. 2025.

5

Perešíni, P., Boža, V., Brejová, B., & Vinař, T. (2021). Nanopore base calling on the edge. Bioinformatics, 37(24), 4661-4667.

VI.3 - Najvýznamnejšie výstupy tvorivej činnosti za ostatných šesť rokov
1

Herman, Robert, et al. "International evaluation of an artificial intelligence–powered electrocardiogram model detecting acute coronary occlusion myocardial infarction." European Heart Journal-Digital Health 5.2 (2024): 123-133.

2

Kvapilova, L., Boza, V., Dubec, P., Majernik, M., Bogar, J., Jamison, J., ... & Karlin, D. R. (2019). Continuous sound collection using smartphones and machine learning to measure cough. Digital biomarkers, 3(3), 166-175.

3

Boža, Vladimír, and Vladimír Macko. "Two Sparse Matrices are Better than One: Sparsifying Neural Networks with Double Sparse Factorization." In The Thirteenth International Conference on Learning Representations. 2025.

4

Perešíni, P., Boža, V., Brejová, B., & Vinař, T. (2021). Nanopore base calling on the edge. Bioinformatics, 37(24), 4661-4667.

5

Boza, Vladimir, et al. "Dynamic Pooling Improves Nanopore Base Calling Accuracy." IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (2021).

VI.4 - Najvýznamnejšie ohlasy na výstupy tvorivej činnosti
1

Ching, T., Himmelstein, D. S., Beaulieu-Jones, B. K., Kalinin, A. A., Do, B. T., Way, G. P., ... & Greene, C. S. (2018). Opportunities and obstacles for deep learning in biology and medicine. Journal of The Royal Society Interface, 15(141), 20170387.

2

Simpson, J. T., & Pop, M. (2015). The theory and practice of genome sequence assembly. Annual review of genomics and human genetics, 16, 153-172.

3

Garalde, D. R., Snell, E. A., Jachimowicz, D., Sipos, B., Lloyd, J. H., Bruce, M., ... & Turner, D. J. (2018). Highly parallel direct RNA sequencing on an array of nanopores. Nature methods, 15(3), 201-206.

4

Eraslan, G., Avsec, Ž., Gagneur, J., & Theis, F. J. (2019). Deep learning: new computational modelling techniques for genomics. Nature Reviews Genetics, 20(7), 389-403.

5

Wick, R. R., Judd, L. M., & Holt, K. E. (2019). Performance of neural network basecalling tools for Oxford Nanopore sequencing. Genome biology, 20(1), 1-10.

VI.5 - Účasť na riešení (vedení) najvýznamnejších vedeckých projektov alebo umeleckých projektov za posledných šesť rokov
1

Vladimír Boža (vedúci): Rýchle rozpoznávanie báz pre nanopórový sekvenántor MinION / Vladimír Boža (leading): Fast base callers for MinION nanopore sequencers, Google Cloud Computing Grant

2

Vladimír Boža (účasť): Chyby a neurčitosť v sekvenovaní DNA: Algoritmy a modely (vedúci Tomáš Vinař, Mária Lucká), VEGA 1/0458/18 / Vladimír Boža (participation): Error and uncertainty in DNA sequencing: algorithms and models (principal investigators Tomáš Vinař, Mária Lucká)

3

Vladimír Boža (účasť): Nekonvenčné aplikácie nových sekvenačných technológií v komparatívnej a funkčnej genomike (vedúci Jozef Nosek, Tomáš Vinař), APVV-18-0239 / Vladimír Boža (participation): Non-conventional applications of emerging sequencing technologies in comparative and functional genomics (principal investigators Jozef Nosek, Tomáš Vinař), APVV-18-0239


VII. - Prehľad aktivít v organizovaní vysokoškolského vzdelávania a tvorivých činností

VII.a - Aktivita, funkcia VII.b - Názov inštitúcie, grémia VII.c - Časové vymedzenia pôsobenia
Člen programovej komisie International Conference on Artificial Neural Networks 2021

VIII. - Prehľad zahraničných mobilít a pôsobenia so zameraním na vzdelávanie a tvorivú činnosť v študijnom odbore

VIII.a - Názov inštitúcie VIII.b - Sídlo inštitúcie VIII.c - Obdobie trvania pôsobenia/pobytu (uviesť dátum odkedy dokedy trval pobyt) VIII.d - Mobilitná schéma, pracovný kontrakt, iné (popísať)
Google Zurich, Švajčiarsko júl 2010 - september 2010 Stáž
Google Zurich, Švajčiarsko jún 2011 - september 2011 Stáž

IX. - Iné relevantné skutočnosti

IX.a - Ak je to podstatné, uvádzajú sa iné aktivity súvisiace s vysokoškolským vzdelávaním alebo s tvorivou činnosťou

Veľmajster v súťažiach v dátovej vede na stránke Kaggle.com

Dátum poslednej aktualizácie
2025-05-27