Study programme - Approved
Academic year:
 2021/2022
Study programme:
 Bioinformatics (BIN)
(Joint degree study, bachelor I. deg., full time form)
Teaching languages: English, Slovak
Study field:
 18. Computer Science
Guarantor:
 doc. Mgr. Bronislava Brejová, PhD.
Study field:
 3. Biology
Guarantor:
 prof. RNDr. Ľubomír Tomáška, DrSc.

Study section
Compulsory courses

Block: Physical Education Activities - Obligatory
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-MXX-110/00  Physical Education and Sport (1) - L. Mókus, D. Mašlejová, J. Leginusová, T. Kuchár, M. Ortutay, M. Dovičák, J. Raábová, B. Nedbálek, T. Lovecký 1/W    2P   0    
 1-MXX-120/00  Physical Education and Sport (2) - T. Kuchár, D. Mašlejová, L. Mókus, J. Leginusová, M. Ortutay, M. Dovičák, J. Raábová, B. Nedbálek, T. Lovecký 1/S    2P   0    
Predmety Telesná výchova (1) - (6) si študenti konverzných študijných programov zapisujú o jeden ročník neskôr.

Block: Foreign Languages - Obligatory
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-MXX-232/10  English Language (4) - J. Kočvarová, A. Maďarová, A. Zemanová, Ľ. Kožehubová, E. Foltánová, A. Barnes, S. Tomášková 2/S    2P   2    

Block: Obligatory Subjects
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-BIN-101/15  Biology - Ľ. Tomáška 1/W    2L   2    
 1-INF-110/00  Mathematical Analysis (1) - Z. Kubáček, A. Jakubička, I. Eliašová 1/W    2L + 2P   5    
 1-INF-127/15  Programming (1) in C/C++ - B. Brejová, D. Bernát, A. Goga 1/W    4L + 4P   8    
 1-INF-120/00  Introduction to Discrete Structures - M. Škoviera, J. Rajník, A. Goga, L. Kiss 1/W    2L + 2P   5    
 1-INF-150/00  Mathematical Analysis (2) - Z. Kubáček, A. Jakubička 1/S    2L + 2P   5    
 1-INF-166/11  Programming (2) in Java - P. Kostolányi, L. Kiss 1/S    2L + 2P   6    
 1-INF-526/15  System Programming - J. Janáček, D. Bernát 1/S    2L + 2P   6    
 1-INF-160/00  Introduction to Combinatorics and Graph Theory - E. Mačajová, J. Rajník 1/S    2L + 2P   6    
 1-BIN-105/15  Perspectives of the Current Bioinformatics - B. Brejová, T. Vinař 1/S    2S   2    
 1-INF-115/00  Algebra (1) - J. Guričan, M. Sleziak 2/W    2L + 2P   5    
 1-INF-220/00  Algorithms and Data Structures - F. Kardoš 2/W    4L   5    
 1-INF-215/14  Formal Languages and Automata (1) - B. Rovan, Š. Sádovský, L. Kiss 2/W    3L + 2P   6    
 1-BIN-201/15  Genetics (1) - Ľ. Tomáška, E. Gálová, A. Ševčovičová, M. Slaninová, R. Sepšiová, K. Gaplovská, L. Mentelová, K. Procházková, S. Kyzek, F. Brázdovič 2/W    4L + 2P   8    
 1-INF-225/15  Programming (3) - R. Ostertág, Š. Sádovský, A. Gafurov 2/W    2L + 2P   6    
 1-INF-283/15  Computer Networks (1) - J. Janáček, D. Bernát 2/S    2L + 1P   4    
 1-INF-175/00  Social Aspects of Informatics - M. Winczer 2/S    2C   2    
 1-INF-310/00  Design of Efficient Algorithms - M. Anderle, F. Kardoš 2/S    3L + 1P   6    
 1-DAV-202/20  Data Management - B. Brejová, T. Vinař, V. Boža 2/S    1L + 2P   5    
 1-BIN-302/15  Evolutionary Biology (1) - P. Vďačný, P. Mikulíček, Ľ. Tomáška, R. Sepšiová, M. Mentel, J. Radvánszky 3/W    2L   3    
 1-BIN-301/15  Methods in Bioinformatics - B. Brejová, T. Vinař, A. Gafurov 3/W    2L + 2P   6    
 2-INF-175/18  Probability and Statistics - R. Harman, L. Filová 3/W    2L + 2P   5    
 1-INF-230/00  Introduction to Database Systems - T. Plachetka, J. Mazák 3/W    2L + 2P   5    
 1-BIN-303/15  Essential Cell Biology - J. Nosek, P. Polčic 3/W    2L + 2S   5    
 1-BIN-922/15  BSc Seminar (2) - B. Brejová, D. Pardubská, T. Plachetka 3/S    2S   4    
Od školského roku 2020/21 je predmet 2-INF-185 Integrácia dátových zdrojov nahradený predmetom 1-DAV-202 Manažment dát.
 
Compulsory elective courses

Block: Obligatory-Optional Subjects min. 2 credits
povinný výber jedného predmetu
pre všetkých študentov
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-BIN-921/15  BSc Seminar (1) - B. Brejová, D. Pardubská, T. Plachetka 3/W    1S   2    
 1-BIN-315/17  Generic Subject in Bioinformatics - B. Brejová 3/W      6    

Block: Obligatory-Optional Subjects min. 15 credits
Študenti, ktorí začali štúdium v akademickom roku 2019/2020 alebo neskôr, povinne absolvujú všetky predmety z bloku B2. Študenti, ktorí začali štúdium v akademickom roku 2018/19 alebo skôr, absolvujú buď celý blok B1 alebo celý blok B2.
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-BIN-103/15  General and Inorganic Chemistry - M. Drábik, J. Tatiersky, J. Chrappová 1/W    2L + 2P   5   !  
 1-BIN-102/15  Organic Chemistry - A. Boháč, V. Poláčková 1/W    2L + 2P   5   !  
 1-BIN-104/15  Biochemistry - J. Korduláková, P. Chovančíková 1/S    2L + 2P   5   !  

Block: Obligatory-Optional Subjects min. 15 credits
Študenti, ktorí začali štúdium v akademickom roku 2019/2020 alebo neskôr, povinne absolvujú všetky predmety z bloku B2. Študenti, ktorí začali štúdium v akademickom roku 2018/19 alebo skôr, absolvujú buď celý blok B1 alebo celý blok B2.
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-BIN-112/15  Basic Chemical Calculation and Nomenclature - J. Chrappová, M. Galamboš 1/W    2S   2    
 1-BIN-106/19  Laboratory Practicals (1) - J. Tatiersky, J. Chrappová 1/W    2P   2    
 2-FBF-107/15  Organic Chemistry and Biochemistry - J. Urban, I. Waczulíková 1/W    4L + 2P   6    
 1-BIN-113/15  General Biology - Ľ. Tomáška 1/S    2L   3    
 1-BIN-107/19  Laboratory Practicals (2) - J. Korduláková, P. Chovančíková 1/S    2P   2    
 
Elective courses

Block: Physical Education Activities - Electives
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-MXX-210/00  Physical Education and Sport (3) - T. Kuchár, J. Leginusová, D. Mašlejová, L. Mókus, M. Ortutay, M. Dovičák, J. Raábová, B. Nedbálek, T. Lovecký 2/W    2P   2    
 1-MXX-220/00  Physical Education and Sport (4) - T. Kuchár, L. Mókus, J. Leginusová, D. Mašlejová, M. Ortutay, M. Dovičák, J. Raábová, B. Nedbálek, T. Lovecký 2/S    2P   2    
 1-MXX-310/00  Physical Education and Sport (5) - T. Kuchár, L. Mókus, J. Leginusová, D. Mašlejová, M. Ortutay, M. Dovičák, J. Raábová, B. Nedbálek, T. Lovecký 3/W    2P   2    
 1-MXX-320/00  Physical Education and Sport (6) - D. Mašlejová, L. Mókus, J. Leginusová, T. Kuchár, M. Ortutay, M. Dovičák, J. Raábová, B. Nedbálek, T. Lovecký 3/S    2P   2    
 1-MXX-115/15  Sports in Nature (1) - M. Dovičák, T. Kuchár, J. Leginusová, D. Mašlejová, L. Mókus, M. Ortutay, J. Raábová 1/W      2    
 1-MXX-215/15  Sports in Nature (2) - M. Dovičák, T. Kuchár, J. Leginusová, D. Mašlejová, L. Mókus, M. Ortutay, J. Raábová 1/S      2    
 1-MXX-216/18  Sports in Nature (3) - M. Dovičák, T. Kuchár, J. Leginusová, D. Mašlejová, L. Mókus, M. Ortutay, J. Raábová 2/W      1    
 1-MXX-217/18  Sports in Nature (4) - M. Dovičák, T. Kuchár, J. Leginusová, D. Mašlejová, L. Mókus, M. Ortutay, J. Raábová 2/S      1    
 1-UXX-340/00  Recreation Sports in Dialy Routine of Pupils and Students - T. Kuchár 3/W    2C   2   !  
Predmety Telesná výchova (1) - (6) si študenti konverzných študijných programov zapisujú o jeden ročník neskôr.

Block: Foreign Languages - Elective
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-MXX-171/20  Slovak Language for Foreign Students (1) - A. Barnes 1/W    2P   2    
 1-MXX-141/00  French Language (1) - Ľ. Kožehubová 1/W    2P   2    
 1-MXX-161/00  Russian Language (1) - V. Mirsalova 1/W    2P   2    
 1-MXX-151/00  German Language (1) - A. Maďarová, S. Tomášková 1/W    2P   2    
 1-MXX-131/00  English Language (1) - E. Foltánová, J. Kočvarová, Ľ. Kožehubová, A. Maďarová, A. Zemanová, A. Barnes, S. Tomášková 1/W    2P   2    
 1-MXX-133/18  Supplementary English Course (1) - J. Kočvarová 1/W    2P   2    
 1-MXX-172/20  Slovak Language for Foreign Students (2) - A. Barnes 1/S    2P   2    
 1-MXX-142/00  French Language (2) - Ľ. Kožehubová 1/S    2P   2    
 1-MXX-152/00  German Language (2) - A. Maďarová, S. Tomášková 1/S    2P   2    
 1-MXX-132/00  English Language (2) - A. Zemanová, J. Kočvarová, A. Maďarová, Ľ. Kožehubová, E. Foltánová, A. Barnes, S. Tomášková 1/S    2P   2    
 1-MXX-134/18  Supplementary English Course (2) - J. Kočvarová 1/S    2P   2    
 1-MXX-162/00  Russian Language (2) - V. Mirsalova 1/S    2P   2    
 1-MXX-271/20  Slovak Language for Foreign Students (3) - A. Barnes 2/W    2P   2    
 1-MXX-241/00  French Language (3) - Ľ. Kožehubová 2/W    2P   2    
 1-MXX-231/00  English Language (3) - A. Zemanová, J. Kočvarová, A. Maďarová, Ľ. Kožehubová, E. Foltánová, A. Barnes, S. Tomášková 2/W    2P   2    
 1-MXX-261/00  Russian Language (3) - V. Mirsalova 2/W    2P   2    
 1-MXX-251/00  German Language (3) - A. Maďarová, S. Tomášková 2/W    2P   2    
 1-MXX-272/20  Slovak Language for Foreign Students (4) - A. Barnes 2/S    2P   2    
 1-MXX-242/00  French Language (4) - Ľ. Kožehubová 2/S    2P   2    
 1-MXX-252/00  German Language (4) - A. Maďarová, S. Tomášková 2/S    2P   2    
 1-MXX-262/00  Russian Language (4) - V. Mirsalova 2/S    2P   2    
 1-MXX-233/13  English Conversation Course (1) - A. Barnes 2, 3/W    2P   2    
 1-MXX-234/13  English Conversation Course (2) - A. Barnes 2, 3/S    2P   2    
Predmety 1–MXX–133/18 Doplňujúci kurz anglického jazyka (1) a 1–MXX–134/18 Doplňujúci kurz anglického jazyka (2) si študenti zapisujú len so súhlasom učiteľa. Aj na zápis predmetov Slovenský jazyk pre zahraničných študentov (1) - (4) potrebuje študent súhlas učiteľa.

Block: Humanities - Elective
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-MXX-491/15  Integrated Education of People with Disabilities - E. Mendelová 1/W    2C   3    
 2-IKVa-192/19  Science, Technology and Humanity: Opportunities and Risks - M. Takáč, T. Gál 1/S    3S   5    
 1-AIN-407/15  Brain and Mind - B. Cimrová, J. Rybár 1, 2, 3/W    2C   3    
 1-AIN-408/15  Cognitive Laboratory - J. Rybár 1, 2, 3/W    2C   2    
 1-AIN-406/15  Language and Cognition - J. Rybár 1, 2, 3/S    2C   3    

Block: Electives - Mathematics and Computer Science
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-INF-615/10  Mathematical Propedeutics (1) - J. Mazák 1/W    2P   2    
 1-AIN-112/15  Introduction to Web Technologies - R. Hrušecký, M. Nagy 1/W    2L + 2P   6    
 1-INF-616/14  Mathematical Propedeutics (2) - J. Mazák 1/S    2P   2    
 1-AIN-500/00  Linux for Users - M. Nagy 1/S    2C   2    
 1-AIN-189/15  Web Applications (1) - R. Hrušecký, M. Nagy 1/S    2L + 2P   6    
 1-INF-516/15  Principles of Software Design - R. Lukoťka 2/W    4C   6    
 1-AIN-510/15  Linux - Principles and Means - M. Nagy, J. Kľuka 2/W    1L + 1P   3    
 1-INF-156/10  Algebra (2) - J. Guričan, T. Rusin, M. Sleziak 2/S    2L + 1P   4    
 1-INF-171/15  Operating Systems - D. Bernát, R. Ostertág, J. Mazák 2/S    3L + 1P   6    
 1-INF-210/21  Introduction to Mathematical Logic - R. Lukoťka, J. Mazák 2/S    2L + 4P   7    
 1-INF-617/19  Algebra Complementary Classes - M. Sleziak, T. Rusin 2/S    1P   1    
 1-INF-130/00  Computer Architecture - D. Olejár, R. Ostertág 3/W    4L   5    
 2-INF-176/15  Unix for System Administrators - J. Janáček, D. Bernát 3/W    2L + 2P   6    
 1-INF-167/15  Computational Complexity and Computability - D. Pardubská 3/W    3L + 1P   6    
 1-INF-270/15  Practicum in Databases - J. Mazák, M. Rjaško 3/W    2C   2    
 1-DAV-105/20  Data Visualisation - B. Brejová, M. Bátorová 3/S    2L + 2P   5    

Block: Electives - Biology and Chemistry
Subject code Subject title - Teacher Ac. year
/Semester		 Range
and form		 Credits Current
 1-BIN-212/15  Lab Math - E. Gálová, A. Ševčovičová, K. Juríková, M. Peťková, T. Zajičková, I. Ďurovcová 2/S    2S   2    
 1-BIN-210/15  Mathematics for Biologists - R. Kollár 2/S    2L + 2S   5    
 1-BIN-311/15  Bioinformatics - Ľ. Kľučár 3/W    2L + 2P   5    
 1-BIN-312/15  Genetics (2): Model Organisms - I. Barák, E. Gálová, A. Horváth, M. Slaninová, V. Džugasová, M. Matúšková, L. Mentelová, D. Žitňan, S. Kyzek 3/W    2L + 2P   5    
 1-BIN-211/15  Evolutionary Biology (2) - M. Okuliarová, J. Radvánszky, V. Demko, A. Čerňanský 3/S    2L   3    
 1-BIN-313/15  Genetics (3): Cytogenetics - A. Ševčovičová, M. Slaninová, E. Gálová, K. Gaplovská 3/S    2L + 2P   5    
 1-BIN-314/15  Methods in Molecular and Cell Biology - P. Polčic, M. Neboháčová, J. Nosek, L. Mentelová, K. Procházková 3/S    2L + 2S   5    
 

State exams
Unless determined otherwise by the programe guarantor, a student is permitted to take the state examination only if all previous study requirements have been met.
Compulsory courses

Block: State Examination Subjects
Subject code Subject title Credits Current
 1-BIN-990/15  BSc Thesis Defense 12    
 1-BIN-950/15  Bioinformatics 4    
 

Such a symbol can occur after the teaching range: d - days in a semester, h - hours in a week, s - hours in a semester, t - weeks in a semester
When none of these symbols are given, expected range of teaching is "hours in a week".
Form: L - lecture, P - practicals, S - seminar, C - course, LP - laboratory practicals, X - practice, IW - independent work, E - excursion, O - other, p - practical, TS - training session, FW - fieldwork, I - internship
Current: ! - course will not be implemented in the given academic year; + - course will not be implemented, perhaps the next academic year; - - course is implemented for the last time